RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.76■■■■■ 4.44
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.76■■■■■ 4.44
RPS6KA1-212ENST00000526040 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.72■■■■■ 4.43
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.72■■■■■ 4.43
RPS6KA1-212ENST00000526040 PREX2Q70Z35 1606 aa42.7■■■■■ 4.43
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.67■■■■■ 4.42
RPS6KA1-212ENST00000526040 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.66■■■■■ 4.42
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.65■■■■■ 4.42
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.63■■■■■ 4.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.6■■■■■ 4.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.57■■■■■ 4.41
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.56■■■■■ 4.4
RPS6KA1-212ENST00000526040 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.56■■■■■ 4.4
RPS6KA1-212ENST00000526040 AFAP1Q8N556 730 aa42.54■■■■■ 4.4
RPS6KA1-212ENST00000526040 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCC1P33527 1531 aa42.51■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 KDM5CP41229 1560 aa42.49■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.47■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.47■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.47■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.46■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 ATP10AO60312 1499 aa42.45■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.45■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.45■■■■■ 4.39
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.43■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.42■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 MADDQ8WXG6 1647 aa42.41■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.4■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.4■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTPRMP28827 1452 aa42.39■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.38■■■■■ 4.38
RPS6KA1-212ENST00000526040 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.36■■■■■ 4.37
RPS6KA1-212ENST00000526040 TIAM1Q13009 1591 aa42.34■■■■■ 4.37
RPS6KA1-212ENST00000526040 MLECQ14165 292 aa42.3■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.3■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.29■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.29■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.28■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.27■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCA6Q8N139 1617 aa42.26■■■■■ 4.36
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.24■■■■■ 4.35
RPS6KA1-212ENST00000526040 NCOA2Q15596 1464 aa42.23■■■■■ 4.35
RPS6KA1-212ENST00000526040 REREQ9P2R6 1566 aa42.21■■■■■ 4.35
RPS6KA1-212ENST00000526040 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.17■■■■■ 4.34
RPS6KA1-212ENST00000526040 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.17■■■■■ 4.34
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAP3K1Q13233 1512 aa42.16■■■■■ 4.34
RPS6KA1-212ENST00000526040 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
RPS6KA1-212ENST00000526040 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 AGLP35573 1532 aa42.07■■■■■ 4.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.07■■■■■ 4.33
RPS6KA1-212ENST00000526040 ATP7AQ04656 1500 aa42.06■■■■■ 4.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 MBD5Q9P267 1494 aa42.05■■■■■ 4.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
RPS6KA1-212ENST00000526040 APLP2Q06481 763 aa41.99■■■■■ 4.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.98■■■■■ 4.31
RPS6KA1-212ENST00000526040 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.91■■■■■ 4.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.89■■■■■ 4.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 A2MP01023 1474 aa41.89■■■■■ 4.3
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.88■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.88■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.87■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLXNC1O60486 1568 aa41.85■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.82■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.82■■■■■ 4.29
RPS6KA1-212ENST00000526040 MIA2Q96PC5 1412 aa41.79■■■■■ 4.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 C3P01024 1663 aa41.76■■■■■ 4.28
RPS6KA1-212ENST00000526040 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.75■■■■■ 4.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSPY4P0CV99 314 aa41.74■■■■■ 4.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSPY10P0CW01 314 aa41.74■■■■■ 4.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 HSPA2P54652 639 aa41.7■■■■■ 4.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.7■■■■■ 4.27
RPS6KA1-212ENST00000526040 GGT6Q6P531 493 aa41.69■■■■■ 4.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 MROH2AA6NES4 1674 aa41.65■■■■■ 4.26
RPS6KA1-212ENST00000526040 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.61■■■■■ 4.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZMYM3Q14202 1370 aa41.61■■■■■ 4.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.6■■■■■ 4.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.58■■■■■ 4.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF3BO15066 747 aa41.57■■■■■ 4.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.57■■■■■ 4.25
RPS6KA1-212ENST00000526040 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.52■■■■■ 4.24
RPS6KA1-212ENST00000526040 NPATQ14207 1427 aa41.48■■■■■ 4.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCC5O15440 1437 aa41.44■■■■■ 4.23
RPS6KA1-212ENST00000526040 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.42■■■■■ 4.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.39■■■■■ 4.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 DAPK1P53355 1430 aa41.38■■■■■ 4.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTPRKQ15262 1439 aa41.38■■■■■ 4.22
RPS6KA1-212ENST00000526040 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.36■■■■■ 4.21
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