RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522111.2

TRNP1-201, Transcript of TMF1-regulated nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRNP1, Length 1,958 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1-201ENST00000522111 PREX2Q70Z35 1606 aa40.71■■■■■ 4.11
TRNP1-201ENST00000522111 ASXL2Q76L83 1435 aa40.7■■■■■ 4.11
TRNP1-201ENST00000522111 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.7■■■■■ 4.11
TRNP1-201ENST00000522111 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.66■■■■■ 4.1
TRNP1-201ENST00000522111 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.65■■■■■ 4.1
TRNP1-201ENST00000522111 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
TRNP1-201ENST00000522111 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.63■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.63■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 DAPK1P53355 1430 aa40.62■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.61■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC5O15440 1437 aa40.58■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.55■■■■■ 4.08
TRNP1-201ENST00000522111 HFM1A2PYH4 1435 aa40.51■■■■■ 4.08
TRNP1-201ENST00000522111 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.5■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 PLCH2O75038 1416 aa40.49■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.47■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 NAIPQ13075 1403 aa40.47■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.46■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.45■■■■■ 4.073e-6■□□□□ 9
TRNP1-201ENST00000522111 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.4■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.4■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 AKNAQ7Z591 1439 aa40.39■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 MBD5Q9P267 1494 aa40.37■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 MAPKBP1O60336 1514 aa40.36■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.36■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.36■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.35■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ROCK1Q13464 1354 aa40.34■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.32■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.3■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.29■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.29■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 KDM6BO15054 1643 aa40.28■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.28■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 FANCAO15360 1455 aa40.27■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.27■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC1P33527 1531 aa40.26■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 TSPY4P0CV99 314 aa40.26■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 TSPY10P0CW01 314 aa40.26■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 NCOA1Q15788 1441 aa40.25■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.25■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 ADGRL2O95490 1459 aa40.24■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 CD109Q6YHK3 1445 aa40.21■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.21■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.19■■■■■ 4.02
TRNP1-201ENST00000522111 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.13■■■■■ 4.01
TRNP1-201ENST00000522111 ADGRL1O94910 1474 aa40.11■■■■■ 4.01
TRNP1-201ENST00000522111 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.07■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 TRIM52Q96A61 297 aa40.06■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.06■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 KIF15Q9NS87 1388 aa40.06■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 DIP2BQ9P265 1576 aa40.05■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.04■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.03■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 AFAP1Q8N556 730 aa40.03■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.02■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.02■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 GLI2P10070 1586 aa40.02■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.01■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 PLXNC1O60486 1568 aa39.95■■■■□ 3.99
TRNP1-201ENST00000522111 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
TRNP1-201ENST00000522111 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.9■■■■□ 3.98
TRNP1-201ENST00000522111 TSPOAP1O95153 1857 aa39.87■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 NEO1Q92859 1461 aa39.87■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 ATP7AQ04656 1500 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.82■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.81■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.8■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.79■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.79■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 PZPP20742 1482 aa39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 NEUROD1Q13562 356 aa39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 FOXD1Q16676 465 aa39.72■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 KDM5CP41229 1560 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 NUP155O75694 1391 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 RAPGEF3O95398 923 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 ERBINQ96RT1 1412 aa39.69■■■■□ 3.94
TRNP1-201ENST00000522111 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.64■■■■□ 3.94
TRNP1-201ENST00000522111 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.64■■■■□ 3.94
TRNP1-201ENST00000522111 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.63■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 RICTORQ6R327 1708 aa39.63■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.62■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 UNC13BO14795 1591 aa39.62■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.61■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.58■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 PKD2Q13563 968 aa39.55■■■■□ 3.92
TRNP1-201ENST00000522111 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.55■■■■□ 3.92
TRNP1-201ENST00000522111 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.54■■■■□ 3.92
TRNP1-201ENST00000522111 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
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