RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522111.2

TRNP1-201, Transcript of TMF1-regulated nuclear protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRNP1, Length 1,958 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1-201ENST00000522111 PREX2Q70Z35 1606 aa40.71■■■■■ 4.11
TRNP1-201ENST00000522111 ASXL2Q76L83 1435 aa40.7■■■■■ 4.11
TRNP1-201ENST00000522111 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.7■■■■■ 4.11
TRNP1-201ENST00000522111 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.66■■■■■ 4.1
TRNP1-201ENST00000522111 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.65■■■■■ 4.1
TRNP1-201ENST00000522111 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
TRNP1-201ENST00000522111 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.63■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.63■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 DAPK1P53355 1430 aa40.62■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.61■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC5O15440 1437 aa40.58■■■■■ 4.09
TRNP1-201ENST00000522111 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.55■■■■■ 4.08
TRNP1-201ENST00000522111 HFM1A2PYH4 1435 aa40.51■■■■■ 4.08
TRNP1-201ENST00000522111 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.5■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 PLCH2O75038 1416 aa40.49■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.47■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 NAIPQ13075 1403 aa40.47■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.46■■■■■ 4.07
TRNP1-201ENST00000522111 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.45■■■■■ 4.073e-6■□□□□ 9
TRNP1-201ENST00000522111 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.4■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.4■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 AKNAQ7Z591 1439 aa40.39■■■■■ 4.06
TRNP1-201ENST00000522111 MBD5Q9P267 1494 aa40.37■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 MAPKBP1O60336 1514 aa40.36■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.36■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.36■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.35■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ROCK1Q13464 1354 aa40.34■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.32■■■■■ 4.05
TRNP1-201ENST00000522111 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.3■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.29■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.29■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 KDM6BO15054 1643 aa40.28■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.28■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 FANCAO15360 1455 aa40.27■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.27■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 ABCC1P33527 1531 aa40.26■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 TSPY4P0CV99 314 aa40.26■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 TSPY10P0CW01 314 aa40.26■■■■■ 4.04
TRNP1-201ENST00000522111 NCOA1Q15788 1441 aa40.25■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.25■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 ADGRL2O95490 1459 aa40.24■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 CD109Q6YHK3 1445 aa40.21■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.21■■■■■ 4.03
TRNP1-201ENST00000522111 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.19■■■■■ 4.02
TRNP1-201ENST00000522111 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.13■■■■■ 4.01
TRNP1-201ENST00000522111 ADGRL1O94910 1474 aa40.11■■■■■ 4.01
TRNP1-201ENST00000522111 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.07■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 TRIM52Q96A61 297 aa40.06■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.06■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 KIF15Q9NS87 1388 aa40.06■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 DIP2BQ9P265 1576 aa40.05■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.04■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.03■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 AFAP1Q8N556 730 aa40.03■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.02■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.02■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 GLI2P10070 1586 aa40.02■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.01■■■■■ 4
TRNP1-201ENST00000522111 PLXNC1O60486 1568 aa39.95■■■■□ 3.99
TRNP1-201ENST00000522111 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
TRNP1-201ENST00000522111 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.9■■■■□ 3.98
TRNP1-201ENST00000522111 TSPOAP1O95153 1857 aa39.87■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 NEO1Q92859 1461 aa39.87■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 ATP7AQ04656 1500 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.83■■■■□ 3.97
TRNP1-201ENST00000522111 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.82■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.81■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.8■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.79■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.79■■■■□ 3.96
TRNP1-201ENST00000522111 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 PZPP20742 1482 aa39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 NEUROD1Q13562 356 aa39.75■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 FOXD1Q16676 465 aa39.72■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 KDM5CP41229 1560 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 NUP155O75694 1391 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 RAPGEF3O95398 923 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.71■■■■□ 3.95
TRNP1-201ENST00000522111 ERBINQ96RT1 1412 aa39.69■■■■□ 3.94
TRNP1-201ENST00000522111 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.64■■■■□ 3.94
TRNP1-201ENST00000522111 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.64■■■■□ 3.94
TRNP1-201ENST00000522111 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.63■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 RICTORQ6R327 1708 aa39.63■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.62■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 UNC13BO14795 1591 aa39.62■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.61■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.58■■■■□ 3.93
TRNP1-201ENST00000522111 PKD2Q13563 968 aa39.55■■■■□ 3.92
TRNP1-201ENST00000522111 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.55■■■■□ 3.92
TRNP1-201ENST00000522111 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.54■■■■□ 3.92
TRNP1-201ENST00000522111 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.6 ms