RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521545.6

LAPTM4B-203, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAPTM4B, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-203ENST00000521545 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.86■■■■■ 4.29
LAPTM4B-203ENST00000521545 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.86■■■■■ 4.29
LAPTM4B-203ENST00000521545 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.85■■■■■ 4.29
LAPTM4B-203ENST00000521545 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.84■■■■■ 4.29
LAPTM4B-203ENST00000521545 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.83■■■■■ 4.29
LAPTM4B-203ENST00000521545 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.81■■■■■ 4.28
LAPTM4B-203ENST00000521545 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.79■■■■■ 4.28
LAPTM4B-203ENST00000521545 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.76■■■■■ 4.28
LAPTM4B-203ENST00000521545 PTPRMP28827 1452 aa41.75■■■■■ 4.27
LAPTM4B-203ENST00000521545 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.7■■■■■ 4.27
LAPTM4B-203ENST00000521545 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.69■■■■■ 4.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 MADDQ8WXG6 1647 aa41.68■■■■■ 4.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 AFAP1Q8N556 730 aa41.67■■■■■ 4.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.66■■■■■ 4.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 PREX2Q70Z35 1606 aa41.65■■■■■ 4.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 ATP10AO60312 1499 aa41.64■■■■■ 4.26
LAPTM4B-203ENST00000521545 CEP162Q5TB80 1403 aa41.61■■■■■ 4.25
LAPTM4B-203ENST00000521545 MLECQ14165 292 aa41.59■■■■■ 4.25
LAPTM4B-203ENST00000521545 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.58■■■■■ 4.25
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LAPTM4B-203ENST00000521545 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.55■■■■■ 4.24
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCC1P33527 1531 aa41.51■■■■■ 4.24
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.48■■■■■ 4.23
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LAPTM4B-203ENST00000521545 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.46■■■■■ 4.23
LAPTM4B-203ENST00000521545 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.46■■■■■ 4.23
LAPTM4B-203ENST00000521545 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.45■■■■■ 4.23
LAPTM4B-203ENST00000521545 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.45■■■■■ 4.23
LAPTM4B-203ENST00000521545 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.43■■■■■ 4.22
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LAPTM4B-203ENST00000521545 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.38■■■■■ 4.22
LAPTM4B-203ENST00000521545 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.38■■■■■ 4.22
LAPTM4B-203ENST00000521545 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.35■■■■■ 4.21
LAPTM4B-203ENST00000521545 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.213e-6■■■■□ 24.7
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ABCA6Q8N139 1617 aa41.33■■■■■ 4.21
LAPTM4B-203ENST00000521545 REREQ9P2R6 1566 aa41.32■■■■■ 4.2
LAPTM4B-203ENST00000521545 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.31■■■■■ 4.2
LAPTM4B-203ENST00000521545 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.3■■■■■ 4.2
LAPTM4B-203ENST00000521545 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.28■■■■■ 4.2
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LAPTM4B-203ENST00000521545 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.26■■■■■ 4.2
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
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LAPTM4B-203ENST00000521545 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.98■■■■■ 4.15
LAPTM4B-203ENST00000521545 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.97■■■■■ 4.15
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LAPTM4B-203ENST00000521545 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.93■■■■■ 4.14
LAPTM4B-203ENST00000521545 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.93■■■■■ 4.14
LAPTM4B-203ENST00000521545 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.9■■■■■ 4.14
LAPTM4B-203ENST00000521545 MAP3K1Q13233 1512 aa40.9■■■■■ 4.14
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LAPTM4B-203ENST00000521545 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.87■■■■■ 4.13
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LAPTM4B-203ENST00000521545 TSPY10P0CW01 314 aa40.8■■■■■ 4.12
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LAPTM4B-203ENST00000521545 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.74■■■■■ 4.11
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LAPTM4B-203ENST00000521545 NPATQ14207 1427 aa40.73■■■■■ 4.11
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LAPTM4B-203ENST00000521545 STRCQ7RTU9 1775 aa40.61■■■■■ 4.09
LAPTM4B-203ENST00000521545 PTPRKQ15262 1439 aa40.57■■■■■ 4.08
LAPTM4B-203ENST00000521545 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.52■■■■■ 4.08
LAPTM4B-203ENST00000521545 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.52■■■■■ 4.08
LAPTM4B-203ENST00000521545 CERKQ8TCT0 537 aa40.51■■■■■ 4.08
LAPTM4B-203ENST00000521545 PTPRTO14522 1441 aa40.49■■■■■ 4.07
LAPTM4B-203ENST00000521545 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.47■■■■■ 4.07
LAPTM4B-203ENST00000521545 NCOA1Q15788 1441 aa40.47■■■■■ 4.07
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