RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.77■■■■□ 3.96
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LAPTM4B-202ENST00000517924 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.76■■■■□ 3.96
LAPTM4B-202ENST00000517924 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.74■■■■□ 3.95
LAPTM4B-202ENST00000517924 PREX2Q70Z35 1606 aa39.72■■■■□ 3.95
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.7■■■■□ 3.95
LAPTM4B-202ENST00000517924 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.69■■■■□ 3.94
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.67■■■■□ 3.94
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.66■■■■□ 3.94
LAPTM4B-202ENST00000517924 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.65■■■■□ 3.94
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.54■■■■□ 3.92
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.54■■■■□ 3.92
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM5CP41229 1560 aa39.53■■■■□ 3.92
LAPTM4B-202ENST00000517924 MADDQ8WXG6 1647 aa39.53■■■■□ 3.92
LAPTM4B-202ENST00000517924 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.53■■■■□ 3.92
LAPTM4B-202ENST00000517924 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.51■■■■□ 3.92
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LAPTM4B-202ENST00000517924 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.46■■■■□ 3.91
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPRMP28827 1452 aa39.45■■■■□ 3.91
LAPTM4B-202ENST00000517924 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.44■■■■□ 3.9
LAPTM4B-202ENST00000517924 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.44■■■■□ 3.9
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP10AO60312 1499 aa39.43■■■■□ 3.9
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
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LAPTM4B-202ENST00000517924 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.38■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 TIAM1Q13009 1591 aa39.38■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.38■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCA6Q8N139 1617 aa39.37■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.36■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.34■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.33■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 MLECQ14165 292 aa39.33■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.31■■■■□ 3.88
LAPTM4B-202ENST00000517924 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.29■■■■□ 3.88
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LAPTM4B-202ENST00000517924 NCOA2Q15596 1464 aa39.21■■■■□ 3.87
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.21■■■■□ 3.87
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.19■■■■□ 3.86
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.17■■■■□ 3.86
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.14■■■■□ 3.86
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LAPTM4B-202ENST00000517924 MBD5Q9P267 1494 aa39.08■■■■□ 3.85
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LAPTM4B-202ENST00000517924 C3P01024 1663 aa38.9■■■■□ 3.82
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.89■■■■□ 3.82
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.83■■■■□ 3.81
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.82■■■■□ 3.81
LAPTM4B-202ENST00000517924 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.82■■■■□ 3.81
LAPTM4B-202ENST00000517924 APLP2Q06481 763 aa38.79■■■■□ 3.8
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LAPTM4B-202ENST00000517924 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.73■■■■□ 3.79
LAPTM4B-202ENST00000517924 GGT6Q6P531 493 aa38.71■■■■□ 3.79
LAPTM4B-202ENST00000517924 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ZMYM3Q14202 1370 aa38.64■■■■□ 3.78
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.64■■■■□ 3.78
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.63■■■■□ 3.78
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LAPTM4B-202ENST00000517924 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.55■■■■□ 3.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 STRCQ7RTU9 1775 aa38.53■■■■□ 3.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 NPATQ14207 1427 aa38.52■■■■□ 3.76
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.5■■■■□ 3.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC5O15440 1437 aa38.49■■■■□ 3.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPRKQ15262 1439 aa38.48■■■■□ 3.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
LAPTM4B-202ENST00000517924 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.44■■■■□ 3.74
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