RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIF3CO14782 793 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 MFSD10Q14728 455 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 C2orf72A6NCS6 295 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 LHX8Q68G74 356 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-410P-201ENST00000517006 PDE4AP27815 886 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMC2Q8TDI7 906 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 OTUD5Q96G74 571 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 DSG2Q14126 1118 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOXK1P85037 733 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-410P-201ENST00000517006 CAMK2BQ13554 666 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLPP6Q8IY26 295 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-410P-201ENST00000517006 WDR70Q9NW82 654 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-410P-201ENST00000517006 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-410P-201ENST00000517006 E2F4Q16254 413 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-410P-201ENST00000517006 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-410P-201ENST00000517006 P3H3Q8IVL6 736 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-410P-201ENST00000517006 SLC34A2O95436 690 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-410P-201ENST00000517006 OXER1Q8TDS5 423 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-410P-201ENST00000517006 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-410P-201ENST00000517006 DOK7Q18PE1 504 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 DPYSL4O14531 572 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 SNPHO15079 494 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 PDIA6Q15084 440 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPR153Q6NV75 609 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-410P-201ENST00000517006 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 RIMBP2O15034 1052 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAP3K9P80192 1104 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARSIQ5FYB1 569 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 TBC1D12O60347 775 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 EVI5O60447 810 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 NUDT7P0C024 238 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 SEMA3EO15041 775 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 ST18O60284 1047 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 NBR1Q14596 966 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 BCANQ96GW7 911 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTGER2P43116 358 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 LHX6Q9UPM6 363 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 DDX12PQ92771 950 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 MARVELD3Q96A59 401 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 JPH4Q96JJ6 628 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOSBP53539 338 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 PHF14O94880 888 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 EMP3P54852 163 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 OSBPP22059 807 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 POTEB3A0JP26 581 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 POTEBQ6S5H4 581 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 EPAS1Q99814 870 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 ERBB3P21860 1342 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM205CA6NFA0 338 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 FBXW7Q969H0 707 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDHR5Q9HBB8 845 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 GPR37O15354 613 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAP3K7O43318 606 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms