RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 FOXD1Q16676 465 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 MLECQ14165 292 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 CLIP1P30622 1438 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-208ENST00000511807 KIF14Q15058 1648 aa18.2■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.19■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.18■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.17■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.16■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ATP10AO60312 1499 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 AFAP1Q8N556 730 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.15■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.14■□□□□ 0.5
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.14■□□□□ 0.49
UBE2B-208ENST00000511807 HSPA2P54652 639 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.13■□□□□ 0.49
UBE2B-208ENST00000511807 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.12■□□□□ 0.49
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO41Q8TF61 875 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 KDM5CP41229 1560 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.07■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.06■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.05■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 PREX2Q70Z35 1606 aa18.04■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.03■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.03■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ABCC1P33527 1531 aa18.03■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.02■□□□□ 0.48
UBE2B-208ENST00000511807 ABCA6Q8N139 1617 aa17.99■□□□□ 0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
UBE2B-208ENST00000511807 REREQ9P2R6 1566 aa17.97■□□□□ 0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 AGLP35573 1532 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 CEP162Q5TB80 1403 aa17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.93■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.92■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.91■□□□□ 0.46
UBE2B-208ENST00000511807 CERKQ8TCT0 537 aa17.89■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.88■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.88■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.87■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 CNTLNQ9NXG0 1405 aa17.87■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 C3P01024 1663 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 ATP7AQ04656 1500 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-208ENST00000511807 A2MP01023 1474 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 GGT6Q6P531 493 aa17.81■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 TIAM1Q13009 1591 aa17.81■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 ZMYM3Q14202 1370 aa17.8■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.79■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 ADRA2BP18089 450 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 NPATQ14207 1427 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 STRCQ7RTU9 1775 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 PLXNC1O60486 1568 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-208ENST00000511807 MBD5Q9P267 1494 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 PTPRTO14522 1441 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 MROH2AA6NES4 1674 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 NCOA1Q15788 1441 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 NCOA2Q15596 1464 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-208ENST00000511807 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.71■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 PTPRKQ15262 1439 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 KIF3BO15066 747 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa17.69■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.68■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 MYO3AQ8NEV4 1616 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 TSPY4P0CV99 314 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 TSPY10P0CW01 314 aa17.65■□□□□ 0.42
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-208ENST00000511807 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
UBE2B-208ENST00000511807 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms