RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.79■■■□□ 2.04
UBE2B-208ENST00000511807 ABCC9O60706 1549 aa25■■□□□ 1.59
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.87■■□□□ 1.57
UBE2B-208ENST00000511807 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.74■■□□□ 1.39
UBE2B-208ENST00000511807 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.59■■□□□ 1.37
UBE2B-208ENST00000511807 NACADO15069 1562 aa23.56■■□□□ 1.36
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.45■■□□□ 1.34
UBE2B-208ENST00000511807 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
UBE2B-208ENST00000511807 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
UBE2B-208ENST00000511807 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.21■■□□□ 1.31
UBE2B-208ENST00000511807 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.09■■□□□ 1.29
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2B-208ENST00000511807 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2B-208ENST00000511807 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.96■■□□□ 1.27
UBE2B-208ENST00000511807 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.92■■□□□ 1.26
UBE2B-208ENST00000511807 SCRIBQ14160 1630 aa22.75■■□□□ 1.23
UBE2B-208ENST00000511807 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.71■■□□□ 1.23
UBE2B-208ENST00000511807 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.53■■□□□ 1.2
UBE2B-208ENST00000511807 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.51■■□□□ 1.19
UBE2B-208ENST00000511807 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
UBE2B-208ENST00000511807 NCAPD3P42695 1498 aa21.77■■□□□ 1.08
UBE2B-208ENST00000511807 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.72■■□□□ 1.07
UBE2B-208ENST00000511807 SMARCA4P51532 1647 aa21.66■■□□□ 1.06
UBE2B-208ENST00000511807 SMARCA2P51531 1590 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2B-208ENST00000511807 ERCC6Q03468 1493 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2B-208ENST00000511807 HMGXB3Q12766 1538 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2B-208ENST00000511807 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
UBE2B-208ENST00000511807 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2B-208ENST00000511807 CUX2O14529 1486 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2B-208ENST00000511807 NESP48681 1621 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2B-208ENST00000511807 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2B-208ENST00000511807 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2B-208ENST00000511807 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2B-208ENST00000511807 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.19■□□□□ 0.98
UBE2B-208ENST00000511807 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
UBE2B-208ENST00000511807 WIZO95785 1651 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2B-208ENST00000511807 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2B-208ENST00000511807 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.1■□□□□ 0.97
UBE2B-208ENST00000511807 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
UBE2B-208ENST00000511807 MRC2Q9UBG0 1479 aa21■□□□□ 0.95
UBE2B-208ENST00000511807 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2B-208ENST00000511807 WDR62O43379 1518 aa20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-208ENST00000511807 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.9■□□□□ 0.94
UBE2B-208ENST00000511807 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
UBE2B-208ENST00000511807 CFTRP13569 1480 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-208ENST00000511807 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.69■□□□□ 0.9
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM41Q8WV44 630 aa20.65■□□□□ 0.9
UBE2B-208ENST00000511807 OSCARQ8IYS5 282 aa20.57■□□□□ 0.88
UBE2B-208ENST00000511807 PRDM2Q13029 1718 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2B-208ENST00000511807 IFT140Q96RY7 1462 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2B-208ENST00000511807 TOPBP1Q92547 1522 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-208ENST00000511807 ABCC8Q09428 1581 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2B-208ENST00000511807 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2B-208ENST00000511807 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
UBE2B-208ENST00000511807 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.841e-7■■■□□ 17.1
UBE2B-208ENST00000511807 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-208ENST00000511807 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 FBLN2P98095 1184 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SOGA1O94964 1423 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF11O15085 1522 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2B-208ENST00000511807 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBE2B-208ENST00000511807 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.17■□□□□ 0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CUX1P39880 1505 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CHD1O14646 1710 aa20.13■□□□□ 0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.12■□□□□ 0.81
UBE2B-208ENST00000511807 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.09■□□□□ 0.81
UBE2B-208ENST00000511807 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2B-208ENST00000511807 WDR97A6NE52 1622 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2B-208ENST00000511807 GRIN2BQ13224 1484 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2B-208ENST00000511807 ARAP1Q96P48 1450 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.96■□□□□ 0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SYNJ2O15056 1496 aa19.95■□□□□ 0.78
UBE2B-208ENST00000511807 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.94■□□□□ 0.78
UBE2B-208ENST00000511807 SYNJ1O43426 1573 aa19.94■□□□□ 0.78
UBE2B-208ENST00000511807 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-208ENST00000511807 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-208ENST00000511807 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-208ENST00000511807 PBRM1Q86U86 1689 aa19.87■□□□□ 0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-208ENST00000511807 TOP2BQ02880 1626 aa19.79■□□□□ 0.76
UBE2B-208ENST00000511807 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-208ENST00000511807 GRIN2AQ12879 1464 aa19.76■□□□□ 0.75
UBE2B-208ENST00000511807 ADAMTS12P58397 1594 aa19.73■□□□□ 0.75
UBE2B-208ENST00000511807 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.7■□□□□ 0.74
UBE2B-208ENST00000511807 NUP160Q12769 1436 aa19.68■□□□□ 0.74
UBE2B-208ENST00000511807 CEP170Q5SW79 1584 aa19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-208ENST00000511807 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
UBE2B-208ENST00000511807 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.66■□□□□ 0.74
UBE2B-208ENST00000511807 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.66■□□□□ 0.74
UBE2B-208ENST00000511807 SHROOM2Q13796 1616 aa19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms