RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
RABGEF1-208ENST00000510829 PTPRGP23470 1445 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 DAPK1P53355 1430 aa15.62■□□□□ 0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCC5O15440 1437 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TSPY4P0CV99 314 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TSPY10P0CW01 314 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-208ENST00000510829 AKNAQ7Z591 1439 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ANP32CO43423 234 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNH8Q96L42 1107 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ROCK1Q13464 1354 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP10BO94823 1461 aa15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.54■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.084e-6■■■□□ 18.3
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.53■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
RABGEF1-208ENST00000510829 KDM6BO15054 1643 aa15.52■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF14Q15058 1648 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.5■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 PKD2Q13563 968 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 NCOA1Q15788 1441 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCA8O94911 1581 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGEF1-208ENST00000510829 NUP155O75694 1391 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.44■□□□□ 0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16.6
RABGEF1-208ENST00000510829 CHD1O14646 1710 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-208ENST00000510829 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF15Q9NS87 1388 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CCER2I3L3R5 266 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.36■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.35■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ADGRL2O95490 1459 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 PZPP20742 1482 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.34■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.33■□□□□ 0.05
RABGEF1-208ENST00000510829 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.31■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 RGL3Q3MIN7 710 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.3■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 ABCC2Q92887 1545 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.27■□□□□ 0.04
RABGEF1-208ENST00000510829 MBD5Q9P267 1494 aa15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC7Q96M83 1385 aa15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 NEFLP07196 543 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 SHROOM2Q13796 1616 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 14.4
RABGEF1-208ENST00000510829 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 USP47Q96K76 1375 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 AFAP1Q8N556 730 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 BCANQ96GW7 911 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 PREX2Q70Z35 1606 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-208ENST00000510829 MRS2Q9HD23 443 aa15.21■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PLCH2O75038 1416 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 FKBP8Q14318 412 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 OSCARQ8IYS5 282 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-208ENST00000510829 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-208ENST00000510829 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.14■□□□□ 0.01
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