RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 AKNAQ7Z591 1439 aa41.96■■■■■ 4.31
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SH3BP2-212ENST00000508338 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
SH3BP2-212ENST00000508338 NCOA2Q15596 1464 aa41.91■■■■■ 4.3
SH3BP2-212ENST00000508338 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.9■■■■■ 4.3
SH3BP2-212ENST00000508338 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
SH3BP2-212ENST00000508338 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
SH3BP2-212ENST00000508338 ADGRL1O94910 1474 aa41.85■■■■■ 4.29
SH3BP2-212ENST00000508338 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
SH3BP2-212ENST00000508338 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
SH3BP2-212ENST00000508338 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.76■■■■■ 4.28
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.74■■■■■ 4.27
SH3BP2-212ENST00000508338 RICTORQ6R327 1708 aa41.71■■■■■ 4.27
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SH3BP2-212ENST00000508338 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.69■■■■■ 4.26
SH3BP2-212ENST00000508338 RAPGEF3O95398 923 aa41.68■■■■■ 4.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.66■■■■■ 4.26
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SH3BP2-212ENST00000508338 MIA2Q96PC5 1412 aa41.63■■■■■ 4.26
SH3BP2-212ENST00000508338 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.61■■■■■ 4.25
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.59■■■■■ 4.25
SH3BP2-212ENST00000508338 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.54■■■■■ 4.24
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM5CP41229 1560 aa41.54■■■■■ 4.24
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.53■■■■■ 4.24
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SH3BP2-212ENST00000508338 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.5■■■■■ 4.23
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SH3BP2-212ENST00000508338 AFAP1Q8N556 730 aa41.47■■■■■ 4.23
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.44■■■■■ 4.22
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SH3BP2-212ENST00000508338 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.43■■■■■ 4.22
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SH3BP2-212ENST00000508338 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.42■■■■■ 4.22
SH3BP2-212ENST00000508338 MBD5Q9P267 1494 aa41.41■■■■■ 4.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.38■■■■■ 4.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.37■■■■■ 4.21
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.36■■■■■ 4.21
SH3BP2-212ENST00000508338 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.35■■■■■ 4.21
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SH3BP2-212ENST00000508338 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
SH3BP2-212ENST00000508338 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.3■■■■■ 4.2
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP10AO60312 1499 aa41.28■■■■■ 4.2
SH3BP2-212ENST00000508338 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.27■■■■■ 4.2
SH3BP2-212ENST00000508338 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.27■■■■■ 4.2
SH3BP2-212ENST00000508338 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP7AQ04656 1500 aa41.25■■■■■ 4.19
SH3BP2-212ENST00000508338 TSPY4P0CV99 314 aa41.25■■■■■ 4.19
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SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.23■■■■■ 4.19
SH3BP2-212ENST00000508338 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.21■■■■■ 4.19
SH3BP2-212ENST00000508338 REREQ9P2R6 1566 aa41.2■■■■■ 4.19
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SH3BP2-212ENST00000508338 DAPK1P53355 1430 aa41.09■■■■■ 4.17
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SH3BP2-212ENST00000508338 ROCK1Q13464 1354 aa40.78■■■■■ 4.12
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
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SH3BP2-212ENST00000508338 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGAEP38570 1179 aa40.69■■■■■ 4.1
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SH3BP2-212ENST00000508338 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.67■■■■■ 4.1
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