RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504717.1

LMF2-203, Transcript of lipase maturation factor 2, humanhuman

TSL 5

Gene LMF2, Length 1,233 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF2-203ENST00000504717 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.3■■■■■ 4.36
LMF2-203ENST00000504717 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.29■■■■■ 4.36
LMF2-203ENST00000504717 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.27■■■■■ 4.36
LMF2-203ENST00000504717 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.26■■■■■ 4.36
LMF2-203ENST00000504717 PREX2Q70Z35 1606 aa42.24■■■■■ 4.35
LMF2-203ENST00000504717 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.24■■■■■ 4.35
LMF2-203ENST00000504717 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.2■■■■■ 4.35
LMF2-203ENST00000504717 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.19■■■■■ 4.34
LMF2-203ENST00000504717 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
LMF2-203ENST00000504717 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.17■■■■■ 4.34
LMF2-203ENST00000504717 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.17■■■■■ 4.34
LMF2-203ENST00000504717 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.15■■■■■ 4.34
LMF2-203ENST00000504717 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
LMF2-203ENST00000504717 AFAP1Q8N556 730 aa42.08■■■■■ 4.33
LMF2-203ENST00000504717 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.08■■■■■ 4.33
LMF2-203ENST00000504717 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.07■■■■■ 4.33
LMF2-203ENST00000504717 ABCC1P33527 1531 aa42.06■■■■■ 4.32
LMF2-203ENST00000504717 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.05■■■■■ 4.32
LMF2-203ENST00000504717 KDM5CP41229 1560 aa42.05■■■■■ 4.32
LMF2-203ENST00000504717 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.04■■■■■ 4.32
LMF2-203ENST00000504717 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.03■■■■■ 4.32
LMF2-203ENST00000504717 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
LMF2-203ENST00000504717 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 ATP10AO60312 1499 aa42■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.99■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.98■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.98■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.96■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.95■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.95■■■■■ 4.31
LMF2-203ENST00000504717 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.94■■■■■ 4.3
LMF2-203ENST00000504717 MADDQ8WXG6 1647 aa41.93■■■■■ 4.3
LMF2-203ENST00000504717 PTPRMP28827 1452 aa41.92■■■■■ 4.3
LMF2-203ENST00000504717 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.92■■■■■ 4.3
LMF2-203ENST00000504717 TIAM1Q13009 1591 aa41.91■■■■■ 4.3
LMF2-203ENST00000504717 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.87■■■■■ 4.29
LMF2-203ENST00000504717 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.86■■■■■ 4.29
LMF2-203ENST00000504717 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.85■■■■■ 4.29
LMF2-203ENST00000504717 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.84■■■■■ 4.29
LMF2-203ENST00000504717 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.29
LMF2-203ENST00000504717 MLECQ14165 292 aa41.83■■■■■ 4.29
LMF2-203ENST00000504717 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
LMF2-203ENST00000504717 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
LMF2-203ENST00000504717 NCOA2Q15596 1464 aa41.79■■■■■ 4.28
LMF2-203ENST00000504717 ABCA6Q8N139 1617 aa41.79■■■■■ 4.28
LMF2-203ENST00000504717 REREQ9P2R6 1566 aa41.76■■■■■ 4.28
LMF2-203ENST00000504717 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.76■■■■■ 4.28
LMF2-203ENST00000504717 MAP3K1Q13233 1512 aa41.75■■■■■ 4.27
LMF2-203ENST00000504717 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.75■■■■■ 4.27
LMF2-203ENST00000504717 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
LMF2-203ENST00000504717 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
LMF2-203ENST00000504717 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.68■■■■■ 4.26
LMF2-203ENST00000504717 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
LMF2-203ENST00000504717 AGLP35573 1532 aa41.64■■■■■ 4.26
LMF2-203ENST00000504717 ATP7AQ04656 1500 aa41.63■■■■■ 4.25
LMF2-203ENST00000504717 MBD5Q9P267 1494 aa41.61■■■■■ 4.25
LMF2-203ENST00000504717 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
LMF2-203ENST00000504717 APLP2Q06481 763 aa41.59■■■■■ 4.25
LMF2-203ENST00000504717 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.58■■■■■ 4.25
LMF2-203ENST00000504717 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.55■■■■■ 4.24
LMF2-203ENST00000504717 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.49■■■■■ 4.23
LMF2-203ENST00000504717 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.47■■■■■ 4.23
LMF2-203ENST00000504717 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.46■■■■■ 4.23
LMF2-203ENST00000504717 A2MP01023 1474 aa41.46■■■■■ 4.23
LMF2-203ENST00000504717 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
LMF2-203ENST00000504717 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.42■■■■■ 4.22
LMF2-203ENST00000504717 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.42■■■■■ 4.22
LMF2-203ENST00000504717 PLXNC1O60486 1568 aa41.42■■■■■ 4.22
LMF2-203ENST00000504717 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.41■■■■■ 4.22
LMF2-203ENST00000504717 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
LMF2-203ENST00000504717 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.39■■■■■ 4.22
LMF2-203ENST00000504717 MIA2Q96PC5 1412 aa41.39■■■■■ 4.22
LMF2-203ENST00000504717 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.34■■■■■ 4.21
LMF2-203ENST00000504717 TSPY4P0CV99 314 aa41.32■■■■■ 4.21
LMF2-203ENST00000504717 TSPY10P0CW01 314 aa41.32■■■■■ 4.21
LMF2-203ENST00000504717 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
LMF2-203ENST00000504717 C3P01024 1663 aa41.27■■■■■ 4.2
LMF2-203ENST00000504717 GGT6Q6P531 493 aa41.25■■■■■ 4.19
LMF2-203ENST00000504717 HSPA2P54652 639 aa41.23■■■■■ 4.19
LMF2-203ENST00000504717 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.23■■■■■ 4.19
LMF2-203ENST00000504717 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
LMF2-203ENST00000504717 MROH2AA6NES4 1674 aa41.2■■■■■ 4.19
LMF2-203ENST00000504717 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.19■■■■■ 4.18
LMF2-203ENST00000504717 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.16■■■■■ 4.18
LMF2-203ENST00000504717 ZMYM3Q14202 1370 aa41.16■■■■■ 4.18
LMF2-203ENST00000504717 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.14■■■■■ 4.18
LMF2-203ENST00000504717 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.14■■■■■ 4.18
LMF2-203ENST00000504717 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
LMF2-203ENST00000504717 KIF3BO15066 747 aa41.13■■■■■ 4.17
LMF2-203ENST00000504717 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.11■■■■■ 4.17
LMF2-203ENST00000504717 NPATQ14207 1427 aa41.06■■■■■ 4.16
LMF2-203ENST00000504717 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
LMF2-203ENST00000504717 ABCC5O15440 1437 aa41.01■■■■■ 4.16
LMF2-203ENST00000504717 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.99■■■■■ 4.15
LMF2-203ENST00000504717 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.98■■■■■ 4.15
LMF2-203ENST00000504717 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.97■■■■■ 4.15
LMF2-203ENST00000504717 DAPK1P53355 1430 aa40.96■■■■■ 4.15
LMF2-203ENST00000504717 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
LMF2-203ENST00000504717 PTPRKQ15262 1439 aa40.94■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.2 ms