RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504717.1

LMF2-203, Transcript of lipase maturation factor 2, humanhuman

TSL 5

Gene LMF2, Length 1,233 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF2-203ENST00000504717 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.92■■■■■ 7.98
LMF2-203ENST00000504717 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.92■■■■■ 6.86
LMF2-203ENST00000504717 ABCC9O60706 1549 aa57.16■■■■■ 6.74
LMF2-203ENST00000504717 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.78■■■■■ 6.36
LMF2-203ENST00000504717 NACADO15069 1562 aa54.59■■■■■ 6.33
LMF2-203ENST00000504717 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.51■■■■■ 6.32
LMF2-203ENST00000504717 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.1■■■■■ 6.25
LMF2-203ENST00000504717 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.96■■■■■ 6.23
LMF2-203ENST00000504717 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.69■■■■■ 6.19
LMF2-203ENST00000504717 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.49■■■■■ 6.15
LMF2-203ENST00000504717 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.35■■■■■ 6.13
LMF2-203ENST00000504717 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.1■■■■■ 6.09
LMF2-203ENST00000504717 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.91■■■■■ 6.06
LMF2-203ENST00000504717 SCRIBQ14160 1630 aa52.8■■■■■ 6.04
LMF2-203ENST00000504717 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.53■■■■■ 6
LMF2-203ENST00000504717 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.76■■■■■ 5.88
LMF2-203ENST00000504717 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.67■■■■■ 5.86
LMF2-203ENST00000504717 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.42■■■■■ 5.82
LMF2-203ENST00000504717 SMARCA4P51532 1647 aa50.47■■■■■ 5.67
LMF2-203ENST00000504717 NCAPD3P42695 1498 aa50.39■■■■■ 5.66
LMF2-203ENST00000504717 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.36■■■■■ 5.65
LMF2-203ENST00000504717 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.33■■■■■ 5.65
LMF2-203ENST00000504717 SMARCA2P51531 1590 aa50.26■■■■■ 5.64
LMF2-203ENST00000504717 HMGXB3Q12766 1538 aa50.08■■■■■ 5.61
LMF2-203ENST00000504717 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.01■■■■■ 5.6
LMF2-203ENST00000504717 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.98■■■■■ 5.59
LMF2-203ENST00000504717 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.9■■■■■ 5.58
LMF2-203ENST00000504717 WIZO95785 1651 aa49.45■■■■■ 5.51
LMF2-203ENST00000504717 ERCC6Q03468 1493 aa49.32■■■■■ 5.49
LMF2-203ENST00000504717 NESP48681 1621 aa49.31■■■■■ 5.48
LMF2-203ENST00000504717 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.28■■■■■ 5.48
LMF2-203ENST00000504717 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.13■■■■■ 5.46
LMF2-203ENST00000504717 CUX2O14529 1486 aa48.97■■■■■ 5.43
LMF2-203ENST00000504717 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.9■■■■■ 5.42
LMF2-203ENST00000504717 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
LMF2-203ENST00000504717 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.84■■■■■ 5.41
LMF2-203ENST00000504717 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.7■■■■■ 5.39
LMF2-203ENST00000504717 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
LMF2-203ENST00000504717 CFTRP13569 1480 aa48.49■■■■■ 5.35
LMF2-203ENST00000504717 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.35■■■■■ 5.33
LMF2-203ENST00000504717 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.34■■■■■ 5.33
LMF2-203ENST00000504717 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.33■■■■■ 5.33
LMF2-203ENST00000504717 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.32■■■■■ 5.33
LMF2-203ENST00000504717 WDR62O43379 1518 aa48.19■■■■■ 5.31
LMF2-203ENST00000504717 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.07■■■■■ 5.29
LMF2-203ENST00000504717 PRDM2Q13029 1718 aa48.06■■■■■ 5.28
LMF2-203ENST00000504717 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.86■■■■■ 5.25
LMF2-203ENST00000504717 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
LMF2-203ENST00000504717 TOPBP1Q92547 1522 aa47.5■■■■■ 5.19
LMF2-203ENST00000504717 ABCC8Q09428 1581 aa47.49■■■■■ 5.19
LMF2-203ENST00000504717 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.4■■■■■ 5.18
LMF2-203ENST00000504717 IFT140Q96RY7 1462 aa47.33■■■■■ 5.17
LMF2-203ENST00000504717 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
LMF2-203ENST00000504717 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
LMF2-203ENST00000504717 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
LMF2-203ENST00000504717 CUX1P39880 1505 aa46.95■■■■■ 5.11
LMF2-203ENST00000504717 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
LMF2-203ENST00000504717 OSCARQ8IYS5 282 aa46.9■■■■■ 5.1
LMF2-203ENST00000504717 SOGA1O94964 1423 aa46.88■■■■■ 5.1
LMF2-203ENST00000504717 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.88■■■■■ 5.09
LMF2-203ENST00000504717 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.86■■■■■ 5.09
LMF2-203ENST00000504717 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.83■■■■■ 5.091e-13■■■■□ 22.1
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LMF2-203ENST00000504717 WDR97A6NE52 1622 aa46.61■■■■■ 5.05
LMF2-203ENST00000504717 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.49■■■■■ 5.03
LMF2-203ENST00000504717 CHD1O14646 1710 aa46.43■■■■■ 5.02
LMF2-203ENST00000504717 TOP2BQ02880 1626 aa46.43■■■■■ 5.02
LMF2-203ENST00000504717 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.41■■■■■ 5.02
LMF2-203ENST00000504717 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.4■■■■■ 5.02
LMF2-203ENST00000504717 FBLN2P98095 1184 aa46.4■■■■■ 5.02
LMF2-203ENST00000504717 GRIN2BQ13224 1484 aa46.38■■■■■ 5.02
LMF2-203ENST00000504717 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.38■■■■■ 5.01
LMF2-203ENST00000504717 SYNJ1O43426 1573 aa46.37■■■■■ 5.01
LMF2-203ENST00000504717 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.32■■■■■ 5.01
LMF2-203ENST00000504717 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
LMF2-203ENST00000504717 TRIM41Q8WV44 630 aa46.28■■■■■ 5
LMF2-203ENST00000504717 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.24■■■■■ 4.99
LMF2-203ENST00000504717 PBRM1Q86U86 1689 aa46.23■■■■■ 4.99
LMF2-203ENST00000504717 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
LMF2-203ENST00000504717 SYNJ2O15056 1496 aa46.14■■■■■ 4.98
LMF2-203ENST00000504717 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.14■■■■■ 4.98
LMF2-203ENST00000504717 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.14■■■■■ 4.98
LMF2-203ENST00000504717 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.14■■■■■ 4.98
LMF2-203ENST00000504717 ARHGEF11O15085 1522 aa46.09■■■■■ 4.97
LMF2-203ENST00000504717 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.92■■■■■ 4.94
LMF2-203ENST00000504717 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.84■■■■■ 4.93
LMF2-203ENST00000504717 ADAMTS12P58397 1594 aa45.84■■■■■ 4.93
LMF2-203ENST00000504717 GRIN2AQ12879 1464 aa45.78■■■■■ 4.92
LMF2-203ENST00000504717 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.77■■■■■ 4.92
LMF2-203ENST00000504717 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.73■■■■■ 4.91
LMF2-203ENST00000504717 ARAP1Q96P48 1450 aa45.68■■■■■ 4.9
LMF2-203ENST00000504717 NUP160Q12769 1436 aa45.6■■■■■ 4.89
LMF2-203ENST00000504717 KIF27Q86VH2 1401 aa45.57■■■■■ 4.89
LMF2-203ENST00000504717 CEP170Q5SW79 1584 aa45.56■■■■■ 4.88
LMF2-203ENST00000504717 IGF1RP08069 1367 aa45.44■■■■■ 4.86
LMF2-203ENST00000504717 CUL7Q14999 1698 aa45.32■■■■■ 4.85
LMF2-203ENST00000504717 SHROOM2Q13796 1616 aa45.3■■■■■ 4.84
LMF2-203ENST00000504717 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.24■■■■■ 4.83
LMF2-203ENST00000504717 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.17■■■■■ 4.82
LMF2-203ENST00000504717 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.16■■■■■ 4.82
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