RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498562.2

CUL4A-211, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene CUL4A, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-211ENST00000498562 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.5■■■■■ 4.39
CUL4A-211ENST00000498562 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.5■■■■■ 4.39
CUL4A-211ENST00000498562 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.49■■■■■ 4.39
CUL4A-211ENST00000498562 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.49■■■■■ 4.39
CUL4A-211ENST00000498562 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
CUL4A-211ENST00000498562 CLIP1P30622 1438 aa42.44■■■■■ 4.38
CUL4A-211ENST00000498562 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
CUL4A-211ENST00000498562 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.41■■■■■ 4.38
CUL4A-211ENST00000498562 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.4■■■■■ 4.38
CUL4A-211ENST00000498562 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.37■■■■■ 4.37
CUL4A-211ENST00000498562 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.36■■■■■ 4.37
CUL4A-211ENST00000498562 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.32■■■■■ 4.36
CUL4A-211ENST00000498562 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.28■■■■■ 4.36
CUL4A-211ENST00000498562 KDM5CP41229 1560 aa42.27■■■■■ 4.36
CUL4A-211ENST00000498562 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.27■■■■■ 4.36
CUL4A-211ENST00000498562 PREX2Q70Z35 1606 aa42.27■■■■■ 4.36
CUL4A-211ENST00000498562 ATP10AO60312 1499 aa42.25■■■■■ 4.35
CUL4A-211ENST00000498562 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.23■■■■■ 4.35
CUL4A-211ENST00000498562 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.23■■■■■ 4.35
CUL4A-211ENST00000498562 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.23■■■■■ 4.35
CUL4A-211ENST00000498562 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.15■■■■■ 4.34
CUL4A-211ENST00000498562 MLECQ14165 292 aa42.15■■■■■ 4.34
CUL4A-211ENST00000498562 ABCC1P33527 1531 aa42.15■■■■■ 4.34
CUL4A-211ENST00000498562 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.15■■■■■ 4.34
CUL4A-211ENST00000498562 AFAP1Q8N556 730 aa42.14■■■■■ 4.34
CUL4A-211ENST00000498562 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.11■■■■■ 4.33
CUL4A-211ENST00000498562 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.11■■■■■ 4.33
CUL4A-211ENST00000498562 ABCA6Q8N139 1617 aa42.06■■■■■ 4.32
CUL4A-211ENST00000498562 REREQ9P2R6 1566 aa42.05■■■■■ 4.32
CUL4A-211ENST00000498562 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.05■■■■■ 4.32
CUL4A-211ENST00000498562 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.04■■■■■ 4.32
CUL4A-211ENST00000498562 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.03■■■■■ 4.32
CUL4A-211ENST00000498562 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.96■■■■■ 4.31
CUL4A-211ENST00000498562 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.94■■■■■ 4.3
CUL4A-211ENST00000498562 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.93■■■■■ 4.3
CUL4A-211ENST00000498562 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
CUL4A-211ENST00000498562 HSPA2P54652 639 aa41.9■■■■■ 4.3
CUL4A-211ENST00000498562 AGLP35573 1532 aa41.88■■■■■ 4.29
CUL4A-211ENST00000498562 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.87■■■■■ 4.29
CUL4A-211ENST00000498562 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.87■■■■■ 4.29
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
CUL4A-211ENST00000498562 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
CUL4A-211ENST00000498562 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.78■■■■■ 4.28
CUL4A-211ENST00000498562 CEP162Q5TB80 1403 aa41.78■■■■■ 4.28
CUL4A-211ENST00000498562 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.75■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 C3P01024 1663 aa41.74■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.73■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.73■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 FBXO41Q8TF61 875 aa41.72■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 TIAM1Q13009 1591 aa41.71■■■■■ 4.27
CUL4A-211ENST00000498562 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.271e-8■■■■■ 89.9
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CUL4A-211ENST00000498562 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
CUL4A-211ENST00000498562 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CUL4A-211ENST00000498562 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.64■■■■■ 4.26
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CUL4A-211ENST00000498562 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.59■■■■■ 4.25
CUL4A-211ENST00000498562 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CUL4A-211ENST00000498562 MROH2AA6NES4 1674 aa41.55■■■■■ 4.24
CUL4A-211ENST00000498562 STRCQ7RTU9 1775 aa41.55■■■■■ 4.24
CUL4A-211ENST00000498562 A2MP01023 1474 aa41.52■■■■■ 4.24
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CUL4A-211ENST00000498562 MBD5Q9P267 1494 aa41.5■■■■■ 4.23
CUL4A-211ENST00000498562 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.48■■■■■ 4.23
CUL4A-211ENST00000498562 NCOA2Q15596 1464 aa41.44■■■■■ 4.22
CUL4A-211ENST00000498562 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
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CUL4A-211ENST00000498562 ZMYM3Q14202 1370 aa41.37■■■■■ 4.21
CUL4A-211ENST00000498562 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.37■■■■■ 4.21
CUL4A-211ENST00000498562 CERKQ8TCT0 537 aa41.35■■■■■ 4.21
CUL4A-211ENST00000498562 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.35■■■■■ 4.21
CUL4A-211ENST00000498562 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.34■■■■■ 4.21
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CUL4A-211ENST00000498562 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.31■■■■■ 4.2
CUL4A-211ENST00000498562 GGT6Q6P531 493 aa41.28■■■■■ 4.2
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CUL4A-211ENST00000498562 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.25■■■■■ 4.19
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CUL4A-211ENST00000498562 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
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CUL4A-211ENST00000498562 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.21■■■■■ 4.19
CUL4A-211ENST00000498562 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.2■■■■■ 4.19
CUL4A-211ENST00000498562 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.2■■■■■ 4.19
CUL4A-211ENST00000498562 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.16■■■■■ 4.18
CUL4A-211ENST00000498562 MAP3K1Q13233 1512 aa41.15■■■■■ 4.18
CUL4A-211ENST00000498562 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
CUL4A-211ENST00000498562 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.08■■■■■ 4.17
CUL4A-211ENST00000498562 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.06■■■■■ 4.16
CUL4A-211ENST00000498562 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.06■■■■■ 4.16
CUL4A-211ENST00000498562 KIF3BO15066 747 aa41.05■■■■■ 4.16
CUL4A-211ENST00000498562 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
CUL4A-211ENST00000498562 PLA2R1Q13018 1463 aa41.04■■■■■ 4.16
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