RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ANKRD54-210ENST00000498417 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 CEP170Q5SW79 1584 aa21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 SYNJ2O15056 1496 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 FBLN2P98095 1184 aa21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54-210ENST00000498417 JPH4Q96JJ6 628 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-210ENST00000498417 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54-210ENST00000498417 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-210ENST00000498417 NUP160Q12769 1436 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-210ENST00000498417 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-210ENST00000498417 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-210ENST00000498417 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-210ENST00000498417 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF14Q15058 1648 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.81■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 NCOA1Q15788 1441 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.78■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 PZPP20742 1482 aa21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.77■■□□□ 1.08
ANKRD54-210ENST00000498417 FKBP8Q14318 412 aa21.75■■□□□ 1.07
ANKRD54-210ENST00000498417 ADGRL2O95490 1459 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCA8O94911 1581 aa21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54-210ENST00000498417 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54-210ENST00000498417 BCANQ96GW7 911 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP10BO94823 1461 aa21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54-210ENST00000498417 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC7Q96M83 1385 aa21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.66■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 PKD2Q13563 968 aa21.65■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.64■■□□□ 1.06
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC184Q52MB2 194 aa21.64■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 NEFLP07196 543 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 MBD5Q9P267 1494 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD54-210ENST00000498417 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.58■■□□□ 1.04
ANKRD54-210ENST00000498417 PTPRGP23470 1445 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD54-210ENST00000498417 NUP155O75694 1391 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-210ENST00000498417 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-210ENST00000498417 TSPY4P0CV99 314 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-210ENST00000498417 TSPY10P0CW01 314 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-210ENST00000498417 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 USP47Q96K76 1375 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF15Q9NS87 1388 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 MRS2Q9HD23 443 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-210ENST00000498417 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 KDM5CP41229 1560 aa21.43■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.42■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 PREX2Q70Z35 1606 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.41■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 CHD1O14646 1710 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.39■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.39■■□□□ 1.02
ANKRD54-210ENST00000498417 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 SHROOM2Q13796 1616 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
ANKRD54-210ENST00000498417 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.32■■□□□ 1
ANKRD54-210ENST00000498417 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.31■■□□□ 1
ANKRD54-210ENST00000498417 MYT1Q01538 1121 aa21.31■■□□□ 1
ANKRD54-210ENST00000498417 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.29■■□□□ 1
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCC2Q92887 1545 aa21.28■■□□□ 1
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