RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496169.5

MKRN1-215, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 1,625 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-215ENST00000496169 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.12■■■■□ 3.53
MKRN1-215ENST00000496169 PREX2Q70Z35 1606 aa37.09■■■■□ 3.53
MKRN1-215ENST00000496169 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.08■■■■□ 3.53
MKRN1-215ENST00000496169 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.07■■■■□ 3.52
MKRN1-215ENST00000496169 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.05■■■■□ 3.52
MKRN1-215ENST00000496169 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.02■■■■□ 3.52
MKRN1-215ENST00000496169 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.02■■■■□ 3.52
MKRN1-215ENST00000496169 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.97■■■■□ 3.51
MKRN1-215ENST00000496169 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.96■■■■□ 3.51
MKRN1-215ENST00000496169 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
MKRN1-215ENST00000496169 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.94■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.91■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.91■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 TIAM1Q13009 1591 aa36.91■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.9■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.9■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 AFAP1Q8N556 730 aa36.89■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 ABCC1P33527 1531 aa36.89■■■■□ 3.5
MKRN1-215ENST00000496169 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
MKRN1-215ENST00000496169 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.87■■■■□ 3.49
MKRN1-215ENST00000496169 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.86■■■■□ 3.49
MKRN1-215ENST00000496169 KDM5CP41229 1560 aa36.85■■■■□ 3.49
MKRN1-215ENST00000496169 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
MKRN1-215ENST00000496169 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
MKRN1-215ENST00000496169 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.83■■■■□ 3.49
MKRN1-215ENST00000496169 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.81■■■■□ 3.48
MKRN1-215ENST00000496169 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
MKRN1-215ENST00000496169 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.79■■■■□ 3.48
MKRN1-215ENST00000496169 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.77■■■■□ 3.48
MKRN1-215ENST00000496169 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.77■■■■□ 3.48
MKRN1-215ENST00000496169 MAP3K1Q13233 1512 aa36.76■■■■□ 3.48
MKRN1-215ENST00000496169 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.76■■■■□ 3.48
MKRN1-215ENST00000496169 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.76■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 ATP10AO60312 1499 aa36.75■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 NCOA2Q15596 1464 aa36.75■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.75■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.74■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.72■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.71■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
MKRN1-215ENST00000496169 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.69■■■■□ 3.46
MKRN1-215ENST00000496169 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.68■■■■□ 3.46
MKRN1-215ENST00000496169 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
MKRN1-215ENST00000496169 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.66■■■■□ 3.46
MKRN1-215ENST00000496169 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.65■■■■□ 3.46
MKRN1-215ENST00000496169 MADDQ8WXG6 1647 aa36.64■■■■□ 3.46
MKRN1-215ENST00000496169 ABCA6Q8N139 1617 aa36.64■■■■□ 3.46
MKRN1-215ENST00000496169 APLP2Q06481 763 aa36.62■■■■□ 3.45
MKRN1-215ENST00000496169 MLECQ14165 292 aa36.59■■■■□ 3.45
MKRN1-215ENST00000496169 PTPRMP28827 1452 aa36.58■■■■□ 3.45
MKRN1-215ENST00000496169 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
MKRN1-215ENST00000496169 REREQ9P2R6 1566 aa36.56■■■■□ 3.44
MKRN1-215ENST00000496169 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
MKRN1-215ENST00000496169 MBD5Q9P267 1494 aa36.54■■■■□ 3.44
MKRN1-215ENST00000496169 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.51■■■■□ 3.44
MKRN1-215ENST00000496169 ATP7AQ04656 1500 aa36.5■■■■□ 3.43
MKRN1-215ENST00000496169 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
MKRN1-215ENST00000496169 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.48■■■■□ 3.43
MKRN1-215ENST00000496169 AGLP35573 1532 aa36.45■■■■□ 3.43
MKRN1-215ENST00000496169 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.42■■■■□ 3.42
MKRN1-215ENST00000496169 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.4■■■■□ 3.42
MKRN1-215ENST00000496169 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.39■■■■□ 3.42
MKRN1-215ENST00000496169 MIA2Q96PC5 1412 aa36.38■■■■□ 3.41
MKRN1-215ENST00000496169 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.36■■■■□ 3.41
MKRN1-215ENST00000496169 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.36■■■■□ 3.41
MKRN1-215ENST00000496169 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.34■■■■□ 3.41
MKRN1-215ENST00000496169 A2MP01023 1474 aa36.34■■■■□ 3.41
MKRN1-215ENST00000496169 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.33■■■■□ 3.41
MKRN1-215ENST00000496169 PLXNC1O60486 1568 aa36.31■■■■□ 3.4
MKRN1-215ENST00000496169 TSPY4P0CV99 314 aa36.27■■■■□ 3.4
MKRN1-215ENST00000496169 TSPY10P0CW01 314 aa36.27■■■■□ 3.4
MKRN1-215ENST00000496169 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
MKRN1-215ENST00000496169 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
MKRN1-215ENST00000496169 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.22■■■■□ 3.39
MKRN1-215ENST00000496169 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
MKRN1-215ENST00000496169 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.18■■■■□ 3.38
MKRN1-215ENST00000496169 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.16■■■■□ 3.38
MKRN1-215ENST00000496169 GGT6Q6P531 493 aa36.15■■■■□ 3.38
MKRN1-215ENST00000496169 C3P01024 1663 aa36.15■■■■□ 3.38
MKRN1-215ENST00000496169 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.14■■■■□ 3.38
MKRN1-215ENST00000496169 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.13■■■■□ 3.37
MKRN1-215ENST00000496169 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
MKRN1-215ENST00000496169 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
MKRN1-215ENST00000496169 MROH2AA6NES4 1674 aa36.07■■■■□ 3.37
MKRN1-215ENST00000496169 ABCC5O15440 1437 aa36.07■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 KIF3BO15066 747 aa36.07■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.06■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.05■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.03■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 ZMYM3Q14202 1370 aa36.02■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 DAPK1P53355 1430 aa36.01■■■■□ 3.36
MKRN1-215ENST00000496169 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36■■■■□ 3.35
MKRN1-215ENST00000496169 HSPA2P54652 639 aa35.98■■■■□ 3.35
MKRN1-215ENST00000496169 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
MKRN1-215ENST00000496169 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
MKRN1-215ENST00000496169 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.92■■■■□ 3.34
MKRN1-215ENST00000496169 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms