RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRU-208ENST00000493601 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRU-208ENST00000493601 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PTPRU-208ENST00000493601 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-208ENST00000493601 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-208ENST00000493601 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRU-208ENST00000493601 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRU-208ENST00000493601 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRU-208ENST00000493601 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.16■■□□□ 1.94
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PTPRU-208ENST00000493601 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.12■■□□□ 1.93
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PTPRU-208ENST00000493601 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.09■■□□□ 1.93
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PTPRU-208ENST00000493601 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRU-208ENST00000493601 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRU-208ENST00000493601 ATP10AO60312 1499 aa27.05■■□□□ 1.92
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PTPRU-208ENST00000493601 LMTK3Q96Q04 1460 aa27■■□□□ 1.91
PTPRU-208ENST00000493601 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRU-208ENST00000493601 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRU-208ENST00000493601 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRU-208ENST00000493601 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRU-208ENST00000493601 MLECQ14165 292 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-208ENST00000493601 AFAP1Q8N556 730 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-208ENST00000493601 REREQ9P2R6 1566 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-208ENST00000493601 ABCA6Q8N139 1617 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRU-208ENST00000493601 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.92■■□□□ 1.9
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PTPRU-208ENST00000493601 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRU-208ENST00000493601 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.87■■□□□ 1.89
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PTPRU-208ENST00000493601 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.84■■□□□ 1.89
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PTPRU-208ENST00000493601 AGLP35573 1532 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRU-208ENST00000493601 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRU-208ENST00000493601 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-208ENST00000493601 CEP162Q5TB80 1403 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-208ENST00000493601 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PTPRU-208ENST00000493601 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRU-208ENST00000493601 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRU-208ENST00000493601 HSPA2P54652 639 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRU-208ENST00000493601 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRU-208ENST00000493601 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-208ENST00000493601 C3P01024 1663 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRU-208ENST00000493601 TIAM1Q13009 1591 aa26.71■■□□□ 1.87
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PTPRU-208ENST00000493601 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.66■■□□□ 1.86
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PTPRU-208ENST00000493601 MROH2AA6NES4 1674 aa26.63■■□□□ 1.85
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PTPRU-208ENST00000493601 A2MP01023 1474 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRU-208ENST00000493601 STRCQ7RTU9 1775 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRU-208ENST00000493601 NCOA2Q15596 1464 aa26.55■■□□□ 1.84
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PTPRU-208ENST00000493601 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRU-208ENST00000493601 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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PTPRU-208ENST00000493601 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.51■■□□□ 1.83
PTPRU-208ENST00000493601 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.5■■□□□ 1.83
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PTPRU-208ENST00000493601 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRU-208ENST00000493601 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.48■■□□□ 1.83
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PTPRU-208ENST00000493601 PTPRTO14522 1441 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRU-208ENST00000493601 NCOA1Q15788 1441 aa26.39■■□□□ 1.82
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PTPRU-208ENST00000493601 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRU-208ENST00000493601 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRU-208ENST00000493601 PTPRKQ15262 1439 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRU-208ENST00000493601 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRU-208ENST00000493601 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PTPRU-208ENST00000493601 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRU-208ENST00000493601 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRU-208ENST00000493601 KIF3BO15066 747 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRU-208ENST00000493601 PLA2R1Q13018 1463 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRU-208ENST00000493601 TSPY4P0CV99 314 aa26.27■■□□□ 1.8
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