RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.56■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 MADDQ8WXG6 1647 aa26.55■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 CLIP1P30622 1438 aa26.54■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.54■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 MLECQ14165 292 aa26.52■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.52■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.52■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.52■■□□□ 1.84
RBM3-211ENST00000491240 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.51■■□□□ 1.83
RBM3-211ENST00000491240 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.49■■□□□ 1.83
RBM3-211ENST00000491240 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RBM3-211ENST00000491240 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.45■■□□□ 1.82
RBM3-211ENST00000491240 AFAP1Q8N556 730 aa26.45■■□□□ 1.82
RBM3-211ENST00000491240 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.45■■□□□ 1.82
RBM3-211ENST00000491240 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.43■■□□□ 1.82
RBM3-211ENST00000491240 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.4■■□□□ 1.82
RBM3-211ENST00000491240 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RBM3-211ENST00000491240 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.39■■□□□ 1.82
RBM3-211ENST00000491240 ATP10AO60312 1499 aa26.37■■□□□ 1.81
RBM3-211ENST00000491240 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.36■■□□□ 1.81
RBM3-211ENST00000491240 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.35■■□□□ 1.81
RBM3-211ENST00000491240 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
RBM3-211ENST00000491240 PREX2Q70Z35 1606 aa26.35■■□□□ 1.81
RBM3-211ENST00000491240 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.33■■□□□ 1.81
RBM3-211ENST00000491240 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
RBM3-211ENST00000491240 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.3■■□□□ 1.8
RBM3-211ENST00000491240 KDM5CP41229 1560 aa26.3■■□□□ 1.8
RBM3-211ENST00000491240 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.3■■□□□ 1.8
RBM3-211ENST00000491240 HSPA2P54652 639 aa26.29■■□□□ 1.8
RBM3-211ENST00000491240 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.29■■□□□ 1.8
RBM3-211ENST00000491240 ABCC1P33527 1531 aa26.29■■□□□ 1.8
RBM3-211ENST00000491240 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.26■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.25■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 ABCA6Q8N139 1617 aa26.24■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 CEP162Q5TB80 1403 aa26.22■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.21■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.21■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.2■■□□□ 1.79
RBM3-211ENST00000491240 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.19■■□□□ 1.78
RBM3-211ENST00000491240 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RBM3-211ENST00000491240 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.18■■□□□ 1.78
RBM3-211ENST00000491240 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.17■■□□□ 1.78
RBM3-211ENST00000491240 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.15■■□□□ 1.78
RBM3-211ENST00000491240 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
RBM3-211ENST00000491240 REREQ9P2R6 1566 aa26.11■■□□□ 1.77
RBM3-211ENST00000491240 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
RBM3-211ENST00000491240 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
RBM3-211ENST00000491240 AGLP35573 1532 aa26.06■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.06■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 TIAM1Q13009 1591 aa26.05■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.03■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.03■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.02■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 ATP7AQ04656 1500 aa26.02■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
RBM3-211ENST00000491240 C3P01024 1663 aa26.01■■□□□ 1.75
RBM3-211ENST00000491240 FBXO41Q8TF61 875 aa25.98■■□□□ 1.75
RBM3-211ENST00000491240 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.97■■□□□ 1.75
RBM3-211ENST00000491240 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
RBM3-211ENST00000491240 NCOA2Q15596 1464 aa25.96■■□□□ 1.75
RBM3-211ENST00000491240 A2MP01023 1474 aa25.95■■□□□ 1.74
RBM3-211ENST00000491240 GGT6Q6P531 493 aa25.94■■□□□ 1.74
RBM3-211ENST00000491240 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RBM3-211ENST00000491240 MBD5Q9P267 1494 aa25.92■■□□□ 1.74
RBM3-211ENST00000491240 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.91■■□□□ 1.74
RBM3-211ENST00000491240 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.9■■□□□ 1.74
RBM3-211ENST00000491240 PLXNC1O60486 1568 aa25.89■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 ZMYM3Q14202 1370 aa25.88■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.86■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 STRCQ7RTU9 1775 aa25.86■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.83■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 CERKQ8TCT0 537 aa25.83■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.83■■□□□ 1.73
RBM3-211ENST00000491240 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.82■■□□□ 1.72
RBM3-211ENST00000491240 MROH2AA6NES4 1674 aa25.81■■□□□ 1.72
RBM3-211ENST00000491240 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.8■■□□□ 1.72
RBM3-211ENST00000491240 KIF3BO15066 747 aa25.78■■□□□ 1.72
RBM3-211ENST00000491240 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.78■■□□□ 1.72
RBM3-211ENST00000491240 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RBM3-211ENST00000491240 NPATQ14207 1427 aa25.76■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 PTPRKQ15262 1439 aa25.73■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 TSPY4P0CV99 314 aa25.73■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 TSPY10P0CW01 314 aa25.73■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.72■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.71■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 NCOA1Q15788 1441 aa25.71■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.7■■□□□ 1.71
RBM3-211ENST00000491240 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.69■■□□□ 1.7
RBM3-211ENST00000491240 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.69■■□□□ 1.7
RBM3-211ENST00000491240 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.68■■□□□ 1.7
RBM3-211ENST00000491240 PTPRTO14522 1441 aa25.68■■□□□ 1.7
RBM3-211ENST00000491240 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
RBM3-211ENST00000491240 MAP3K1Q13233 1512 aa25.66■■□□□ 1.7
RBM3-211ENST00000491240 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.65■■□□□ 1.7
RBM3-211ENST00000491240 APLP2Q06481 763 aa25.65■■□□□ 1.7
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