RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.75	■■■□□ 2.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		27.7	■■■□□ 2.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.7	■■■□□ 2.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.7	■■■□□ 2.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.69	■■■□□ 2.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		27.68	■■■□□ 2.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.67	■■■□□ 2.02
HDAC10-216	ENST00000489424	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.64	■■■□□ 2.02
HDAC10-216	ENST00000489424	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.64	■■■□□ 2.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP10A	O60312	1499 aa		27.64	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM5C	P41229	1560 aa		27.61	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.61	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRM	P28827	1452 aa		27.6	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	AFAP1	Q8N556	730 aa		27.6	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.6	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		27.59	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.58	■■■□□ 2.01
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		27.58	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.56	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		27.55	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC1	P33527	1531 aa		27.54	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.54	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		27.53	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.53	■■■□□ 2
HDAC10-216	ENST00000489424	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.51	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		27.51	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		27.5	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		27.49	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.49	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.49	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.46	■■□□□ 1.99
HDAC10-216	ENST00000489424	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		27.43	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	AGL	P35573	1532 aa		27.42	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.42	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	MLEC	Q14165	292 aa		27.4	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		27.39	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		27.39	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.39	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.39	■■□□□ 1.98
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	27.39	■■□□□ 1.97
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	27.38	■■□□□ 1.97
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.38	■■□□□ 1.97
HDAC10-216	ENST00000489424	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		27.35	■■□□□ 1.97
HDAC10-216	ENST00000489424	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.33	■■□□□ 1.97
HDAC10-216	ENST00000489424	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		27.32	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA6	Q8N139	1617 aa		27.32	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.32	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.31	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	MBD5	Q9P267	1494 aa		27.3	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.29	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		27.27	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.27	■■□□□ 1.96
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.26	■■□□□ 1.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP7A	Q04656	1500 aa		27.26	■■□□□ 1.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
HDAC10-216	ENST00000489424	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
HDAC10-216	ENST00000489424	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	27.22	■■□□□ 1.95
HDAC10-216	ENST00000489424	A2M	P01023	1474 aa		27.19	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.17	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.17	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	PLXNC1	O60486	1568 aa		27.17	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPA2	P54652	639 aa		27.16	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	APLP2	Q06481	763 aa		27.16	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.15	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.15	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		27.14	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	27.14	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	27.14	■■□□□ 1.94
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.13	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.13	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.12	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.1	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.1	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	NPAT	Q14207	1427 aa		27.09	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		27.09	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		27.08	■■□□□ 1.93
HDAC10-216	ENST00000489424	C3	P01024	1663 aa		27.07	■■□□□ 1.92
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYM3	Q14202	1370 aa		27.07	■■□□□ 1.92
HDAC10-216	ENST00000489424	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.05	■■□□□ 1.92
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.03	■■□□□ 1.92
HDAC10-216	ENST00000489424	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		27.03	■■□□□ 1.92
HDAC10-216	ENST00000489424	GGT6	Q6P531	493 aa		27.02	■■□□□ 1.92
HDAC10-216	ENST00000489424	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		26.98	■■□□□ 1.91
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF3B	O15066	747 aa		26.96	■■□□□ 1.91
HDAC10-216	ENST00000489424	STRC	Q7RTU9	1775 aa		26.92	■■□□□ 1.9
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRK	Q15262	1439 aa		26.91	■■□□□ 1.9
HDAC10-216	ENST00000489424	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	26.91	■■□□□ 1.9
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO41	Q8TF61	875 aa		26.9	■■□□□ 1.9
HDAC10-216	ENST00000489424	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		26.88	■■□□□ 1.89
HDAC10-216	ENST00000489424	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	26.87	■■□□□ 1.89
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRT	O14522	1441 aa		26.87	■■□□□ 1.89
HDAC10-216	ENST00000489424	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		26.87	■■□□□ 1.89

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