RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.57■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.57■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.57■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 PTPRMP28827 1452 aa36.56■■■■□ 3.44
PTPN4-211ENST00000488279 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPN4-211ENST00000488279 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.55■■■■□ 3.44
PTPN4-211ENST00000488279 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.53■■■■□ 3.44
PTPN4-211ENST00000488279 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.53■■■■□ 3.44
PTPN4-211ENST00000488279 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.52■■■■□ 3.44
PTPN4-211ENST00000488279 AFAP1Q8N556 730 aa36.46■■■■□ 3.43
PTPN4-211ENST00000488279 MADDQ8WXG6 1647 aa36.43■■■■□ 3.42
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.43■■■■□ 3.42
PTPN4-211ENST00000488279 ATP10AO60312 1499 aa36.41■■■■□ 3.42
PTPN4-211ENST00000488279 MLECQ14165 292 aa36.4■■■■□ 3.42
PTPN4-211ENST00000488279 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.39■■■■□ 3.42
PTPN4-211ENST00000488279 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.34■■■■□ 3.41
PTPN4-211ENST00000488279 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.34■■■■□ 3.41
PTPN4-211ENST00000488279 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.31■■■■□ 3.4
PTPN4-211ENST00000488279 PREX2Q70Z35 1606 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPN4-211ENST00000488279 KDM5CP41229 1560 aa36.3■■■■□ 3.4
PTPN4-211ENST00000488279 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.29■■■■□ 3.4
PTPN4-211ENST00000488279 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
PTPN4-211ENST00000488279 CEP162Q5TB80 1403 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.25■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.24■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.24■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 ABCC1P33527 1531 aa36.24■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.2■■■■□ 3.39
PTPN4-211ENST00000488279 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
PTPN4-211ENST00000488279 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.17■■■■□ 3.38
PTPN4-211ENST00000488279 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.15■■■■□ 3.38
PTPN4-211ENST00000488279 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.381e-9■■■■■ 28.9
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PTPN4-211ENST00000488279 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.14■■■■□ 3.38
PTPN4-211ENST00000488279 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.13■■■■□ 3.37
PTPN4-211ENST00000488279 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.12■■■■□ 3.37
PTPN4-211ENST00000488279 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.11■■■■□ 3.37
PTPN4-211ENST00000488279 REREQ9P2R6 1566 aa36.09■■■■□ 3.37
PTPN4-211ENST00000488279 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.08■■■■□ 3.37
PTPN4-211ENST00000488279 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.08■■■■□ 3.37
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PTPN4-211ENST00000488279 ABCA6Q8N139 1617 aa36.07■■■■□ 3.36
PTPN4-211ENST00000488279 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.05■■■■□ 3.36
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PTPN4-211ENST00000488279 HSPA2P54652 639 aa36.05■■■■□ 3.36
PTPN4-211ENST00000488279 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.04■■■■□ 3.36
PTPN4-211ENST00000488279 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
PTPN4-211ENST00000488279 AGLP35573 1532 aa36.02■■■■□ 3.36
PTPN4-211ENST00000488279 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.01■■■■□ 3.36
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PTPN4-211ENST00000488279 TIAM1Q13009 1591 aa35.91■■■■□ 3.34
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PTPN4-211ENST00000488279 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.84■■■■□ 3.33
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PTPN4-211ENST00000488279 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.8■■■■□ 3.32
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PTPN4-211ENST00000488279 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
PTPN4-211ENST00000488279 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.77■■■■□ 3.32
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PTPN4-211ENST00000488279 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPN4-211ENST00000488279 GGT6Q6P531 493 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPN4-211ENST00000488279 C3P01024 1663 aa35.74■■■■□ 3.31
PTPN4-211ENST00000488279 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.73■■■■□ 3.31
PTPN4-211ENST00000488279 ZMYM3Q14202 1370 aa35.72■■■■□ 3.31
PTPN4-211ENST00000488279 PLXNC1O60486 1568 aa35.72■■■■□ 3.31
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PTPN4-211ENST00000488279 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.68■■■■□ 3.3
PTPN4-211ENST00000488279 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPN4-211ENST00000488279 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
PTPN4-211ENST00000488279 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.67■■■■□ 3.3
PTPN4-211ENST00000488279 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
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PTPN4-211ENST00000488279 TSPY4P0CV99 314 aa35.64■■■■□ 3.3
PTPN4-211ENST00000488279 TSPY10P0CW01 314 aa35.64■■■■□ 3.3
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PTPN4-211ENST00000488279 MROH2AA6NES4 1674 aa35.6■■■■□ 3.29
PTPN4-211ENST00000488279 APLP2Q06481 763 aa35.57■■■■□ 3.28
PTPN4-211ENST00000488279 KIF3BO15066 747 aa35.56■■■■□ 3.28
PTPN4-211ENST00000488279 CERKQ8TCT0 537 aa35.54■■■■□ 3.28
PTPN4-211ENST00000488279 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
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PTPN4-211ENST00000488279 PTPRKQ15262 1439 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPN4-211ENST00000488279 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPN4-211ENST00000488279 MIA2Q96PC5 1412 aa35.49■■■■□ 3.27
PTPN4-211ENST00000488279 PTPRTO14522 1441 aa35.45■■■■□ 3.27
PTPN4-211ENST00000488279 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.43■■■■□ 3.26
PTPN4-211ENST00000488279 NCOA1Q15788 1441 aa35.42■■■■□ 3.26
PTPN4-211ENST00000488279 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.36■■■■□ 3.25
PTPN4-211ENST00000488279 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
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