RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487791.1

HBA1-204, Transcript of hemoglobin subunit alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HBA1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1-204ENST00000487791 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
HBA1-204ENST00000487791 PREX2Q70Z35 1606 aa35.58■■■■□ 3.29
HBA1-204ENST00000487791 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.57■■■■□ 3.28
HBA1-204ENST00000487791 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
HBA1-204ENST00000487791 AKNAQ7Z591 1439 aa35.56■■■■□ 3.28
HBA1-204ENST00000487791 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.55■■■■□ 3.28
HBA1-204ENST00000487791 KDM6BO15054 1643 aa35.55■■■■□ 3.28
HBA1-204ENST00000487791 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.52■■■■□ 3.28
HBA1-204ENST00000487791 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
HBA1-204ENST00000487791 ADGRL1O94910 1474 aa35.47■■■■□ 3.27
HBA1-204ENST00000487791 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.44■■■■□ 3.26
HBA1-204ENST00000487791 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
HBA1-204ENST00000487791 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.43■■■■□ 3.26
HBA1-204ENST00000487791 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.41■■■■□ 3.26
HBA1-204ENST00000487791 MIA2Q96PC5 1412 aa35.4■■■■□ 3.26
HBA1-204ENST00000487791 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.34■■■■□ 3.25
HBA1-204ENST00000487791 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
HBA1-204ENST00000487791 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
HBA1-204ENST00000487791 ABCC1P33527 1531 aa35.32■■■■□ 3.24
HBA1-204ENST00000487791 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.31■■■■□ 3.24
HBA1-204ENST00000487791 RAPGEF3O95398 923 aa35.31■■■■□ 3.24
HBA1-204ENST00000487791 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.3■■■■□ 3.24
HBA1-204ENST00000487791 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.3■■■■□ 3.24
HBA1-204ENST00000487791 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.29■■■■□ 3.24
HBA1-204ENST00000487791 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.25■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.24■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 RICTORQ6R327 1708 aa35.23■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.22■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.22■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.2■■■■□ 3.23
HBA1-204ENST00000487791 AFAP1Q8N556 730 aa35.19■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.18■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.16■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.16■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.15■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.15■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 TSPY4P0CV99 314 aa35.14■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 TSPY10P0CW01 314 aa35.14■■■■□ 3.22
HBA1-204ENST00000487791 KDM5CP41229 1560 aa35.13■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.11■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 MBD5Q9P267 1494 aa35.11■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.11■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.09■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.08■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.07■■■■□ 3.21
HBA1-204ENST00000487791 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.2
HBA1-204ENST00000487791 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.01■■■■□ 3.2
HBA1-204ENST00000487791 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.99■■■■□ 3.19
HBA1-204ENST00000487791 ATP7AQ04656 1500 aa34.97■■■■□ 3.19
HBA1-204ENST00000487791 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
HBA1-204ENST00000487791 ATP10AO60312 1499 aa34.96■■■■□ 3.19
HBA1-204ENST00000487791 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 DAPK1P53355 1430 aa34.94■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.94■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.92■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.91■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.91■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 ABCC5O15440 1437 aa34.9■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.89■■■■□ 3.18
HBA1-204ENST00000487791 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.86■■■■□ 3.17
HBA1-204ENST00000487791 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.86■■■■□ 3.17
HBA1-204ENST00000487791 ABCA6Q8N139 1617 aa34.84■■■■□ 3.17
HBA1-204ENST00000487791 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.82■■■■□ 3.16
HBA1-204ENST00000487791 REREQ9P2R6 1566 aa34.82■■■■□ 3.16
HBA1-204ENST00000487791 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.82■■■■□ 3.16
HBA1-204ENST00000487791 ITGAEP38570 1179 aa34.79■■■■□ 3.16
HBA1-204ENST00000487791 A2MP01023 1474 aa34.78■■■■□ 3.16
HBA1-204ENST00000487791 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.78■■■■□ 3.16
HBA1-204ENST00000487791 PLXNC1O60486 1568 aa34.76■■■■□ 3.16
HBA1-204ENST00000487791 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
HBA1-204ENST00000487791 AGLP35573 1532 aa34.71■■■■□ 3.15
HBA1-204ENST00000487791 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.71■■■■□ 3.15
HBA1-204ENST00000487791 KIF15Q9NS87 1388 aa34.71■■■■□ 3.15
HBA1-204ENST00000487791 ADGRL2O95490 1459 aa34.71■■■■□ 3.15
HBA1-204ENST00000487791 ROCK1Q13464 1354 aa34.69■■■■□ 3.14
HBA1-204ENST00000487791 NCOA1Q15788 1441 aa34.69■■■■□ 3.14
HBA1-204ENST00000487791 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.69■■■■□ 3.14
HBA1-204ENST00000487791 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
HBA1-204ENST00000487791 MLECQ14165 292 aa34.61■■■■□ 3.13
HBA1-204ENST00000487791 PTPRKQ15262 1439 aa34.61■■■■□ 3.13
HBA1-204ENST00000487791 KIF3BO15066 747 aa34.6■■■■□ 3.13
HBA1-204ENST00000487791 ERBINQ96RT1 1412 aa34.6■■■■□ 3.13
HBA1-204ENST00000487791 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.58■■■■□ 3.13
HBA1-204ENST00000487791 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.58■■■■□ 3.13
HBA1-204ENST00000487791 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
HBA1-204ENST00000487791 GGT6Q6P531 493 aa34.54■■■■□ 3.12
HBA1-204ENST00000487791 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.53■■■■□ 3.12
HBA1-204ENST00000487791 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.52■■■■□ 3.12
HBA1-204ENST00000487791 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.47■■■■□ 3.11
HBA1-204ENST00000487791 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.46■■■■□ 3.11
HBA1-204ENST00000487791 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.45■■■■□ 3.11
HBA1-204ENST00000487791 KANK1Q14678 1352 aa34.44■■■■□ 3.1
HBA1-204ENST00000487791 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.43■■■■□ 3.1
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