RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487791.1

HBA1-204, Transcript of hemoglobin subunit alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HBA1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1-204ENST00000487791 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.54■■■■■ 6.32
HBA1-204ENST00000487791 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.34■■■■■ 5.33
HBA1-204ENST00000487791 ABCC9O60706 1549 aa46.78■■■■■ 5.08
HBA1-204ENST00000487791 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.53■■■■■ 4.88
HBA1-204ENST00000487791 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
HBA1-204ENST00000487791 NACADO15069 1562 aa45.37■■■■■ 4.85
HBA1-204ENST00000487791 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.33■■■■■ 4.85
HBA1-204ENST00000487791 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.26■■■■■ 4.84
HBA1-204ENST00000487791 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.21■■■■■ 4.83
HBA1-204ENST00000487791 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.1■■■■■ 4.65
HBA1-204ENST00000487791 SCRIBQ14160 1630 aa44.06■■■■■ 4.64
HBA1-204ENST00000487791 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.79■■■■■ 4.6
HBA1-204ENST00000487791 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.72■■■■■ 4.59
HBA1-204ENST00000487791 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.57■■■■■ 4.56
HBA1-204ENST00000487791 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
HBA1-204ENST00000487791 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.38■■■■■ 4.37
HBA1-204ENST00000487791 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.34■■■■■ 4.37
HBA1-204ENST00000487791 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
HBA1-204ENST00000487791 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.32■■■■■ 4.37
HBA1-204ENST00000487791 SMARCA4P51532 1647 aa42.2■■■■■ 4.35
HBA1-204ENST00000487791 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.97■■■■■ 4.31
HBA1-204ENST00000487791 SMARCA2P51531 1590 aa41.95■■■■■ 4.31
HBA1-204ENST00000487791 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.87■■■■■ 4.29
HBA1-204ENST00000487791 NCAPD3P42695 1498 aa41.82■■■■■ 4.29
HBA1-204ENST00000487791 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.8■■■■■ 4.28
HBA1-204ENST00000487791 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
HBA1-204ENST00000487791 HMGXB3Q12766 1538 aa41.66■■■■■ 4.26
HBA1-204ENST00000487791 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
HBA1-204ENST00000487791 WIZO95785 1651 aa41.54■■■■■ 4.24
HBA1-204ENST00000487791 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
HBA1-204ENST00000487791 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
HBA1-204ENST00000487791 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.7■■■■■ 4.11
HBA1-204ENST00000487791 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.69■■■■■ 4.1
HBA1-204ENST00000487791 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.65■■■■■ 4.1
HBA1-204ENST00000487791 NESP48681 1621 aa40.54■■■■■ 4.08
HBA1-204ENST00000487791 CFTRP13569 1480 aa40.47■■■■■ 4.07
HBA1-204ENST00000487791 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.47■■■■■ 4.07
HBA1-204ENST00000487791 ERCC6Q03468 1493 aa40.43■■■■■ 4.06
HBA1-204ENST00000487791 PRDM2Q13029 1718 aa40.21■■■■■ 4.03
HBA1-204ENST00000487791 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.16■■■■■ 4.02
HBA1-204ENST00000487791 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.11■■■■■ 4.01
HBA1-204ENST00000487791 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.11■■■■■ 4.01
HBA1-204ENST00000487791 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.93■■■■□ 3.98
HBA1-204ENST00000487791 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
HBA1-204ENST00000487791 CUX2O14529 1486 aa39.8■■■■□ 3.96
HBA1-204ENST00000487791 ABCC8Q09428 1581 aa39.75■■■■□ 3.95
HBA1-204ENST00000487791 WDR62O43379 1518 aa39.73■■■■□ 3.95
HBA1-204ENST00000487791 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
HBA1-204ENST00000487791 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.57■■■■□ 3.92
HBA1-204ENST00000487791 TOPBP1Q92547 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
HBA1-204ENST00000487791 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
HBA1-204ENST00000487791 CUX1P39880 1505 aa39.35■■■■□ 3.89
HBA1-204ENST00000487791 IFT140Q96RY7 1462 aa39.26■■■■□ 3.88
HBA1-204ENST00000487791 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
HBA1-204ENST00000487791 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.21■■■■□ 3.87
HBA1-204ENST00000487791 TOP2BQ02880 1626 aa39.21■■■■□ 3.87
HBA1-204ENST00000487791 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.18■■■■□ 3.86
HBA1-204ENST00000487791 SOGA1O94964 1423 aa39.15■■■■□ 3.86
HBA1-204ENST00000487791 SYNJ1O43426 1573 aa39.13■■■■□ 3.85
HBA1-204ENST00000487791 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
HBA1-204ENST00000487791 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.01■■■■□ 3.84
HBA1-204ENST00000487791 WDR97A6NE52 1622 aa38.92■■■■□ 3.82
HBA1-204ENST00000487791 TRIM41Q8WV44 630 aa38.9■■■■□ 3.82
HBA1-204ENST00000487791 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.88■■■■□ 3.81
HBA1-204ENST00000487791 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
HBA1-204ENST00000487791 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
HBA1-204ENST00000487791 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
HBA1-204ENST00000487791 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.8
HBA1-204ENST00000487791 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.7■■■■□ 3.79
HBA1-204ENST00000487791 GRIN2BQ13224 1484 aa38.65■■■■□ 3.78
HBA1-204ENST00000487791 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.62■■■■□ 3.77
HBA1-204ENST00000487791 KIF27Q86VH2 1401 aa38.61■■■■□ 3.77
HBA1-204ENST00000487791 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.57■■■■□ 3.76
HBA1-204ENST00000487791 PBRM1Q86U86 1689 aa38.52■■■■□ 3.76
HBA1-204ENST00000487791 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.51■■■■□ 3.76
HBA1-204ENST00000487791 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.47■■■■□ 3.75
HBA1-204ENST00000487791 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.46■■■■□ 3.75
HBA1-204ENST00000487791 FBLN2P98095 1184 aa38.38■■■■□ 3.73
HBA1-204ENST00000487791 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
HBA1-204ENST00000487791 SYNJ2O15056 1496 aa38.33■■■■□ 3.73
HBA1-204ENST00000487791 OSCARQ8IYS5 282 aa38.31■■■■□ 3.72
HBA1-204ENST00000487791 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.29■■■■□ 3.72
HBA1-204ENST00000487791 IGF1RP08069 1367 aa38.27■■■■□ 3.72
HBA1-204ENST00000487791 ADAMTS12P58397 1594 aa38.23■■■■□ 3.71
HBA1-204ENST00000487791 EEA1Q15075 1411 aa38.22■■■■□ 3.71
HBA1-204ENST00000487791 CUL7Q14999 1698 aa38.22■■■■□ 3.71
HBA1-204ENST00000487791 CHD1O14646 1710 aa38.21■■■■□ 3.71
HBA1-204ENST00000487791 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.14■■■■□ 3.7
HBA1-204ENST00000487791 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.13■■■■□ 3.69
HBA1-204ENST00000487791 GRIN2AQ12879 1464 aa38.11■■■■□ 3.69
HBA1-204ENST00000487791 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.05■■■■□ 3.68
HBA1-204ENST00000487791 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38■■■■□ 3.67
HBA1-204ENST00000487791 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.96■■■■□ 3.67
HBA1-204ENST00000487791 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
HBA1-204ENST00000487791 NUP160Q12769 1436 aa37.89■■■■□ 3.66
HBA1-204ENST00000487791 PRXQ9BXM0 1461 aa37.85■■■■□ 3.65
HBA1-204ENST00000487791 CEP170Q5SW79 1584 aa37.8■■■■□ 3.64
HBA1-204ENST00000487791 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.8■■■■□ 3.64
HBA1-204ENST00000487791 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.71■■■■□ 3.63
HBA1-204ENST00000487791 KIF21BO75037 1637 aa37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.8 ms