RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PRAME-212ENST00000485532 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.7■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.68■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.66■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.66■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 CLIP1P30622 1438 aa20.65■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 MLECQ14165 292 aa20.65■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.65■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.64■□□□□ 0.9
PRAME-212ENST00000485532 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.64■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 AFAP1Q8N556 730 aa20.61■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.6■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 ATP10AO60312 1499 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.58■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 PREX2Q70Z35 1606 aa20.58■□□□□ 0.89
PRAME-212ENST00000485532 KDM5CP41229 1560 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.56■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 HSPA2P54652 639 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 ABCC1P33527 1531 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.53■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 ABCA6Q8N139 1617 aa20.52■□□□□ 0.88
PRAME-212ENST00000485532 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.51■□□□□ 0.87
PRAME-212ENST00000485532 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRAME-212ENST00000485532 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.47■□□□□ 0.87
PRAME-212ENST00000485532 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PRAME-212ENST00000485532 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.46■□□□□ 0.87
PRAME-212ENST00000485532 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.45■□□□□ 0.86
PRAME-212ENST00000485532 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRAME-212ENST00000485532 REREQ9P2R6 1566 aa20.43■□□□□ 0.86
PRAME-212ENST00000485532 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.42■□□□□ 0.86
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
PRAME-212ENST00000485532 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.4■□□□□ 0.86
PRAME-212ENST00000485532 AGLP35573 1532 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 FBXO41Q8TF61 875 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 C3P01024 1663 aa20.37■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 CEP162Q5TB80 1403 aa20.36■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.35■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PRAME-212ENST00000485532 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 TIAM1Q13009 1591 aa20.32■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 ATP7AQ04656 1500 aa20.31■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.3■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 STRCQ7RTU9 1775 aa20.3■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.29■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.29■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.28■□□□□ 0.84
PRAME-212ENST00000485532 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.26■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 PLXNC1O60486 1568 aa20.25■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 A2MP01023 1474 aa20.24■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 MBD5Q9P267 1494 aa20.23■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.22■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 MROH2AA6NES4 1674 aa20.22■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 CERKQ8TCT0 537 aa20.21■□□□□ 0.83
PRAME-212ENST00000485532 ZMYM3Q14202 1370 aa20.2■□□□□ 0.82
PRAME-212ENST00000485532 NCOA2Q15596 1464 aa20.19■□□□□ 0.82
PRAME-212ENST00000485532 GGT6Q6P531 493 aa20.19■□□□□ 0.82
PRAME-212ENST00000485532 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.19■□□□□ 0.82
PRAME-212ENST00000485532 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.15■□□□□ 0.82
PRAME-212ENST00000485532 NPATQ14207 1427 aa20.14■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.14■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.12■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.12■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.11■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 NCOA1Q15788 1441 aa20.11■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.11■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 PTPRTO14522 1441 aa20.1■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 PTPRKQ15262 1439 aa20.1■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.1■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.09■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PRAME-212ENST00000485532 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRAME-212ENST00000485532 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.06■□□□□ 0.8
PRAME-212ENST00000485532 KIF3BO15066 747 aa20.06■□□□□ 0.8
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.04■□□□□ 0.8
PRAME-212ENST00000485532 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PRAME-212ENST00000485532 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.03■□□□□ 0.8
PRAME-212ENST00000485532 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.03■□□□□ 0.8
PRAME-212ENST00000485532 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.01■□□□□ 0.79
PRAME-212ENST00000485532 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PRAME-212ENST00000485532 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.99■□□□□ 0.79
PRAME-212ENST00000485532 MAP3K1Q13233 1512 aa19.98■□□□□ 0.79
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