RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP44Q96MT7 982 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-210ENST00000485459 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-210ENST00000485459 C2orf72A6NCS6 295 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-210ENST00000485459 DOK7Q18PE1 504 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-210ENST00000485459 RIMBP2O15034 1052 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-210ENST00000485459 ST18O60284 1047 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF3CO14782 793 aa11.54□□□□□ -0.56
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RABGGTB-210ENST00000485459 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RABGGTB-210ENST00000485459 POTEMA6NI47 508 aa11.47□□□□□ -0.57
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RABGGTB-210ENST00000485459 DSG2Q14126 1118 aa11.47□□□□□ -0.57
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RABGGTB-210ENST00000485459 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.47□□□□□ -0.57
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RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGGTB-210ENST00000485459 ARSIQ5FYB1 569 aa11.4□□□□□ -0.58
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RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.36□□□□□ -0.59
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RABGGTB-210ENST00000485459 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.591e-9■■■□□ 14.8
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RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D12O60347 775 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-210ENST00000485459 PLCB2Q00722 1185 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-210ENST00000485459 MFSD10Q14728 455 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-210ENST00000485459 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-210ENST00000485459 NUDT7P0C024 238 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-210ENST00000485459 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-210ENST00000485459 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR70Q9NW82 654 aa11.32□□□□□ -0.6
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RABGGTB-210ENST00000485459 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
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RABGGTB-210ENST00000485459 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.26□□□□□ -0.61
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RABGGTB-210ENST00000485459 MAP3K9P80192 1104 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-210ENST00000485459 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-210ENST00000485459 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.07□□□□□ -0.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 JPH4Q96JJ6 628 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNH8Q96L42 1107 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 FOSBP53539 338 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 P3H3Q8IVL6 736 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.05□□□□□ -0.64
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RABGGTB-210ENST00000485459 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 DDX12PQ92771 950 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGAP33O14559 1287 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNK17Q96T54 332 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 PHF14O94880 888 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 TYW1BQ6NUM6 668 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 PSEN2P49810 448 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXW7Q969H0 707 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 GRXCR2A6NFK2 248 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 PTPREP23469 700 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 NBR1Q14596 966 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 EPAS1Q99814 870 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAM33Q9BZ11 813 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 PTGER2P43116 358 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-210ENST00000485459 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.95□□□□□ -0.66
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