RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484504.5

GNAS-243, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 2

Gene GNAS, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-243ENST00000484504 RAPGEF3O95398 923 aa44.13■■■■■ 4.66
GNAS-243ENST00000484504 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.13■■■■■ 4.65
GNAS-243ENST00000484504 ADGRL1O94910 1474 aa44.1■■■■■ 4.65
GNAS-243ENST00000484504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.06■■■■■ 4.64
GNAS-243ENST00000484504 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
GNAS-243ENST00000484504 RICTORQ6R327 1708 aa44.05■■■■■ 4.64
GNAS-243ENST00000484504 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.05■■■■■ 4.64
GNAS-243ENST00000484504 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.04■■■■■ 4.64
GNAS-243ENST00000484504 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.02■■■■■ 4.64
GNAS-243ENST00000484504 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
GNAS-243ENST00000484504 APLP2Q06481 763 aa43.98■■■■■ 4.63
GNAS-243ENST00000484504 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.96■■■■■ 4.63
GNAS-243ENST00000484504 NCOA2Q15596 1464 aa43.93■■■■■ 4.62
GNAS-243ENST00000484504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
GNAS-243ENST00000484504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.91■■■■■ 4.62
GNAS-243ENST00000484504 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
GNAS-243ENST00000484504 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.89■■■■■ 4.62
GNAS-243ENST00000484504 ABCC1P33527 1531 aa43.89■■■■■ 4.62
GNAS-243ENST00000484504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.85■■■■■ 4.61
GNAS-243ENST00000484504 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.85■■■■■ 4.61
GNAS-243ENST00000484504 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
GNAS-243ENST00000484504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.84■■■■■ 4.61
GNAS-243ENST00000484504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.8■■■■■ 4.6
GNAS-243ENST00000484504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.79■■■■■ 4.6
GNAS-243ENST00000484504 AFAP1Q8N556 730 aa43.78■■■■■ 4.6
GNAS-243ENST00000484504 KDM5CP41229 1560 aa43.77■■■■■ 4.6
GNAS-243ENST00000484504 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.77■■■■■ 4.6
GNAS-243ENST00000484504 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.77■■■■■ 4.6
GNAS-243ENST00000484504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.74■■■■■ 4.59
GNAS-243ENST00000484504 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
GNAS-243ENST00000484504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.73■■■■■ 4.59
GNAS-243ENST00000484504 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.7■■■■■ 4.59
GNAS-243ENST00000484504 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.68■■■■■ 4.58
GNAS-243ENST00000484504 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.68■■■■■ 4.58
GNAS-243ENST00000484504 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.67■■■■■ 4.582e-13■■□□□ 13.8
GNAS-243ENST00000484504 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.65■■■■■ 4.58
GNAS-243ENST00000484504 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.64■■■■■ 4.58
GNAS-243ENST00000484504 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
GNAS-243ENST00000484504 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.59■■■■■ 4.57
GNAS-243ENST00000484504 ATP10AO60312 1499 aa43.58■■■■■ 4.57
GNAS-243ENST00000484504 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.58■■■■■ 4.57
GNAS-243ENST00000484504 MIA2Q96PC5 1412 aa43.56■■■■■ 4.56
GNAS-243ENST00000484504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.56■■■■■ 4.56
GNAS-243ENST00000484504 MBD5Q9P267 1494 aa43.56■■■■■ 4.56
GNAS-243ENST00000484504 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
GNAS-243ENST00000484504 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
GNAS-243ENST00000484504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.51■■■■■ 4.56
GNAS-243ENST00000484504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.51■■■■■ 4.56
GNAS-243ENST00000484504 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.5■■■■■ 4.55
GNAS-243ENST00000484504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.48■■■■■ 4.55
GNAS-243ENST00000484504 ABCA6Q8N139 1617 aa43.46■■■■■ 4.55
GNAS-243ENST00000484504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.43■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.42■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 REREQ9P2R6 1566 aa43.42■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 ATP7AQ04656 1500 aa43.41■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.41■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.4■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.38■■■■■ 4.54
GNAS-243ENST00000484504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.36■■■■■ 4.53
GNAS-243ENST00000484504 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.33■■■■■ 4.53
GNAS-243ENST00000484504 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.32■■■■■ 4.53
GNAS-243ENST00000484504 TSPY4P0CV99 314 aa43.28■■■■■ 4.52
GNAS-243ENST00000484504 TSPY10P0CW01 314 aa43.28■■■■■ 4.52
GNAS-243ENST00000484504 AGLP35573 1532 aa43.27■■■■■ 4.52
GNAS-243ENST00000484504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
GNAS-243ENST00000484504 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.22■■■■■ 4.51
GNAS-243ENST00000484504 MADDQ8WXG6 1647 aa43.22■■■■■ 4.51
GNAS-243ENST00000484504 MLECQ14165 292 aa43.21■■■■■ 4.51
GNAS-243ENST00000484504 A2MP01023 1474 aa43.2■■■■■ 4.51
GNAS-243ENST00000484504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.17■■■■■ 4.5
GNAS-243ENST00000484504 PLXNC1O60486 1568 aa43.16■■■■■ 4.5
GNAS-243ENST00000484504 PTPRMP28827 1452 aa43.13■■■■■ 4.49
GNAS-243ENST00000484504 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
GNAS-243ENST00000484504 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.11■■■■■ 4.49
GNAS-243ENST00000484504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
GNAS-243ENST00000484504 ABCC5O15440 1437 aa43.1■■■■■ 4.49
GNAS-243ENST00000484504 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
GNAS-243ENST00000484504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
GNAS-243ENST00000484504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.06■■■■■ 4.48
GNAS-243ENST00000484504 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.06■■■■■ 4.48
GNAS-243ENST00000484504 DAPK1P53355 1430 aa43.05■■■■■ 4.48
GNAS-243ENST00000484504 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
GNAS-243ENST00000484504 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
GNAS-243ENST00000484504 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.9■■■■■ 4.46
GNAS-243ENST00000484504 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.89■■■■■ 4.46
GNAS-243ENST00000484504 GGT6Q6P531 493 aa42.88■■■■■ 4.45
GNAS-243ENST00000484504 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.88■■■■■ 4.454e-16■■■□□ 16.9
GNAS-243ENST00000484504 KIF3BO15066 747 aa42.87■■■■■ 4.45
GNAS-243ENST00000484504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.87■■■■■ 4.45
GNAS-243ENST00000484504 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.84■■■■■ 4.45
GNAS-243ENST00000484504 KIF15Q9NS87 1388 aa42.83■■■■■ 4.45
GNAS-243ENST00000484504 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.82■■■■■ 4.45
GNAS-243ENST00000484504 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.81■■■■■ 4.44
GNAS-243ENST00000484504 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
GNAS-243ENST00000484504 ADGRL2O95490 1459 aa42.8■■■■■ 4.44
GNAS-243ENST00000484504 NCOA1Q15788 1441 aa42.79■■■■■ 4.44
GNAS-243ENST00000484504 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
GNAS-243ENST00000484504 MROH2AA6NES4 1674 aa42.77■■■■■ 4.44
GNAS-243ENST00000484504 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.77■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms