RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484349.1

CHTF18-210, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-210ENST00000484349 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.57■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.56■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 PREX2Q70Z35 1606 aa29.56■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.54■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.53■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.52■■■□□ 2.32
CHTF18-210ENST00000484349 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.51■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.47■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CHTF18-210ENST00000484349 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.45■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.44■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.44■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 AFAP1Q8N556 730 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 TIAM1Q13009 1591 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC1P33527 1531 aa29.41■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CHTF18-210ENST00000484349 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.38■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 KDM5CP41229 1560 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.34■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CHTF18-210ENST00000484349 MAP3K1Q13233 1512 aa29.32■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.31■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 ATP10AO60312 1499 aa29.31■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.31■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.3■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 NCOA2Q15596 1464 aa29.3■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.3■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.29■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.29■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.28■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.28■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.27■■■□□ 2.28
CHTF18-210ENST00000484349 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.25■■■□□ 2.27
CHTF18-210ENST00000484349 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CHTF18-210ENST00000484349 APLP2Q06481 763 aa29.23■■■□□ 2.27
CHTF18-210ENST00000484349 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CHTF18-210ENST00000484349 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.22■■■□□ 2.27
CHTF18-210ENST00000484349 MADDQ8WXG6 1647 aa29.2■■■□□ 2.27
CHTF18-210ENST00000484349 ABCA6Q8N139 1617 aa29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-210ENST00000484349 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-210ENST00000484349 MLECQ14165 292 aa29.18■■■□□ 2.26
CHTF18-210ENST00000484349 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.18■■■□□ 2.26
CHTF18-210ENST00000484349 PTPRMP28827 1452 aa29.17■■■□□ 2.26
CHTF18-210ENST00000484349 REREQ9P2R6 1566 aa29.16■■■□□ 2.26
CHTF18-210ENST00000484349 MBD5Q9P267 1494 aa29.13■■■□□ 2.25
CHTF18-210ENST00000484349 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CHTF18-210ENST00000484349 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.11■■■□□ 2.25
CHTF18-210ENST00000484349 ATP7AQ04656 1500 aa29.1■■■□□ 2.25
CHTF18-210ENST00000484349 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CHTF18-210ENST00000484349 AGLP35573 1532 aa29.07■■■□□ 2.24
CHTF18-210ENST00000484349 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.06■■■□□ 2.24
CHTF18-210ENST00000484349 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.05■■■□□ 2.24
CHTF18-210ENST00000484349 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.04■■■□□ 2.24
CHTF18-210ENST00000484349 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.03■■■□□ 2.24
CHTF18-210ENST00000484349 MIA2Q96PC5 1412 aa29.03■■■□□ 2.24
CHTF18-210ENST00000484349 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.01■■■□□ 2.23
CHTF18-210ENST00000484349 A2MP01023 1474 aa28.99■■■□□ 2.23
CHTF18-210ENST00000484349 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.99■■■□□ 2.23
CHTF18-210ENST00000484349 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.98■■■□□ 2.23
CHTF18-210ENST00000484349 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.96■■■□□ 2.23
CHTF18-210ENST00000484349 TSPY4P0CV99 314 aa28.95■■■□□ 2.22
CHTF18-210ENST00000484349 TSPY10P0CW01 314 aa28.95■■■□□ 2.22
CHTF18-210ENST00000484349 PLXNC1O60486 1568 aa28.94■■■□□ 2.22
CHTF18-210ENST00000484349 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CHTF18-210ENST00000484349 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CHTF18-210ENST00000484349 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
CHTF18-210ENST00000484349 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.87■■■□□ 2.21
CHTF18-210ENST00000484349 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.86■■■□□ 2.21
CHTF18-210ENST00000484349 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.85■■■□□ 2.21
CHTF18-210ENST00000484349 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.84■■■□□ 2.21
CHTF18-210ENST00000484349 GGT6Q6P531 493 aa28.83■■■□□ 2.21
CHTF18-210ENST00000484349 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CHTF18-210ENST00000484349 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.8■■■□□ 2.2
CHTF18-210ENST00000484349 C3P01024 1663 aa28.79■■■□□ 2.2
CHTF18-210ENST00000484349 KIF3BO15066 747 aa28.77■■■□□ 2.2
CHTF18-210ENST00000484349 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.77■■■□□ 2.2
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC5O15440 1437 aa28.76■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 MROH2AA6NES4 1674 aa28.75■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 ZMYM3Q14202 1370 aa28.73■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 DAPK1P53355 1430 aa28.72■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.72■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.72■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.71■■■□□ 2.19
CHTF18-210ENST00000484349 HSPA2P54652 639 aa28.68■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.66■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CHTF18-210ENST00000484349 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms