RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 RICTORQ6R327 1708 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP4-209ENST00000484097 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.47■■■□□ 2.47
SH3BP4-209ENST00000484097 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.46■■■□□ 2.47
SH3BP4-209ENST00000484097 PREX2Q70Z35 1606 aa30.46■■■□□ 2.47
SH3BP4-209ENST00000484097 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BP4-209ENST00000484097 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.44■■■□□ 2.46
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.43■■■□□ 2.46
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SH3BP4-209ENST00000484097 TIAM1Q13009 1591 aa30.4■■■□□ 2.46
SH3BP4-209ENST00000484097 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.39■■■□□ 2.46
SH3BP4-209ENST00000484097 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
SH3BP4-209ENST00000484097 APLP2Q06481 763 aa30.38■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.36■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.35■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.34■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 AFAP1Q8N556 730 aa30.34■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.33■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
SH3BP4-209ENST00000484097 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP3K1Q13233 1512 aa30.31■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.31■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.3■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCC1P33527 1531 aa30.29■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.29■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.27■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.27■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 NCOA2Q15596 1464 aa30.26■■■□□ 2.44
SH3BP4-209ENST00000484097 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.25■■■□□ 2.43
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.25■■■□□ 2.43
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.24■■■□□ 2.43
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.438e-7■■■□□ 17.3
SH3BP4-209ENST00000484097 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.24■■■□□ 2.43
SH3BP4-209ENST00000484097 KDM5CP41229 1560 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.2■■■□□ 2.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP10AO60312 1499 aa30.19■■■□□ 2.42
SH3BP4-209ENST00000484097 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.19■■■□□ 2.42
SH3BP4-209ENST00000484097 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.18■■■□□ 2.42
SH3BP4-209ENST00000484097 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.17■■■□□ 2.42
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SH3BP4-209ENST00000484097 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.14■■■□□ 2.42
SH3BP4-209ENST00000484097 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.13■■■□□ 2.41
SH3BP4-209ENST00000484097 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
SH3BP4-209ENST00000484097 MLECQ14165 292 aa30.1■■■□□ 2.41
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.1■■■□□ 2.41
SH3BP4-209ENST00000484097 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.07■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.07■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCA6Q8N139 1617 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 MBD5Q9P267 1494 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP4-209ENST00000484097 MADDQ8WXG6 1647 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 MIA2Q96PC5 1412 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP7AQ04656 1500 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 REREQ9P2R6 1566 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 PTPRMP28827 1452 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPY4P0CV99 314 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPY10P0CW01 314 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP4-209ENST00000484097 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SH3BP4-209ENST00000484097 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP4-209ENST00000484097 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP4-209ENST00000484097 AGLP35573 1532 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP4-209ENST00000484097 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP4-209ENST00000484097 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.9■■■□□ 2.38
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SH3BP4-209ENST00000484097 A2MP01023 1474 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP4-209ENST00000484097 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.84■■■□□ 2.37
SH3BP4-209ENST00000484097 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.82■■■□□ 2.36
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SH3BP4-209ENST00000484097 GGT6Q6P531 493 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP4-209ENST00000484097 PLXNC1O60486 1568 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP4-209ENST00000484097 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SH3BP4-209ENST00000484097 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF3BO15066 747 aa29.72■■■□□ 2.35
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SH3BP4-209ENST00000484097 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.71■■■□□ 2.35
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCC5O15440 1437 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BP4-209ENST00000484097 DAPK1P53355 1430 aa29.67■■■□□ 2.34
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SH3BP4-209ENST00000484097 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.64■■■□□ 2.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 C3P01024 1663 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.62■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.61■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ZMYM3Q14202 1370 aa29.61■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 MROH2AA6NES4 1674 aa29.59■■■□□ 2.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.57■■■□□ 2.32
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.57■■■□□ 2.32
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF15Q9NS87 1388 aa29.57■■■□□ 2.32
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