RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482048.1

ALG3-212, Transcript of ALG3, alpha-1,3- mannosyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALG3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALG3-212ENST00000482048 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.28■■■□□ 2.28
ALG3-212ENST00000482048 AKNAQ7Z591 1439 aa29.28■■■□□ 2.28
ALG3-212ENST00000482048 PREX2Q70Z35 1606 aa29.27■■■□□ 2.28
ALG3-212ENST00000482048 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
ALG3-212ENST00000482048 KDM6BO15054 1643 aa29.23■■■□□ 2.27
ALG3-212ENST00000482048 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.23■■■□□ 2.27
ALG3-212ENST00000482048 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ALG3-212ENST00000482048 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.2■■■□□ 2.27
ALG3-212ENST00000482048 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
ALG3-212ENST00000482048 ADGRL1O94910 1474 aa29.19■■■□□ 2.26
ALG3-212ENST00000482048 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.18■■■□□ 2.26
ALG3-212ENST00000482048 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.18■■■□□ 2.26
ALG3-212ENST00000482048 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.17■■■□□ 2.26
ALG3-212ENST00000482048 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ALG3-212ENST00000482048 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
ALG3-212ENST00000482048 MIA2Q96PC5 1412 aa29.12■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.12■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 RAPGEF3O95398 923 aa29.12■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 ABCC1P33527 1531 aa29.1■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.1■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.1■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.09■■■□□ 2.25
ALG3-212ENST00000482048 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.05■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.04■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.04■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.04■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.03■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.03■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.02■■■□□ 2.24
ALG3-212ENST00000482048 AFAP1Q8N556 730 aa29.01■■■□□ 2.23
ALG3-212ENST00000482048 MBD5Q9P267 1494 aa28.98■■■□□ 2.23
ALG3-212ENST00000482048 RICTORQ6R327 1708 aa28.98■■■□□ 2.23
ALG3-212ENST00000482048 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.96■■■□□ 2.23
ALG3-212ENST00000482048 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.96■■■□□ 2.23
ALG3-212ENST00000482048 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 KDM5CP41229 1560 aa28.94■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.94■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.94■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.91■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.89■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.89■■■□□ 2.22
ALG3-212ENST00000482048 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.88■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.86■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.86■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.85■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 TSPY4P0CV99 314 aa28.84■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 TSPY10P0CW01 314 aa28.84■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.83■■■□□ 2.21
ALG3-212ENST00000482048 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.8■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 ABCC5O15440 1437 aa28.8■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 ATP7AQ04656 1500 aa28.79■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 DAPK1P53355 1430 aa28.78■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 ATP10AO60312 1499 aa28.77■■■□□ 2.2
ALG3-212ENST00000482048 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.76■■■□□ 2.19
ALG3-212ENST00000482048 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.75■■■□□ 2.19
ALG3-212ENST00000482048 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
ALG3-212ENST00000482048 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.74■■■□□ 2.19
ALG3-212ENST00000482048 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.73■■■□□ 2.19
ALG3-212ENST00000482048 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.72■■■□□ 2.19
ALG3-212ENST00000482048 ABCA6Q8N139 1617 aa28.71■■■□□ 2.19
ALG3-212ENST00000482048 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
ALG3-212ENST00000482048 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.66■■■□□ 2.18
ALG3-212ENST00000482048 REREQ9P2R6 1566 aa28.66■■■□□ 2.18
ALG3-212ENST00000482048 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.65■■■□□ 2.18
ALG3-212ENST00000482048 A2MP01023 1474 aa28.65■■■□□ 2.18
ALG3-212ENST00000482048 ITGAEP38570 1179 aa28.64■■■□□ 2.18
ALG3-212ENST00000482048 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.62■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 PTPRKQ15262 1439 aa28.62■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 PLXNC1O60486 1568 aa28.6■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 ADGRL2O95490 1459 aa28.59■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.59■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 KIF15Q9NS87 1388 aa28.59■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 AGLP35573 1532 aa28.59■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 NCOA1Q15788 1441 aa28.58■■■□□ 2.17
ALG3-212ENST00000482048 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.58■■■□□ 2.16
ALG3-212ENST00000482048 ROCK1Q13464 1354 aa28.56■■■□□ 2.16
ALG3-212ENST00000482048 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.54■■■□□ 2.16
ALG3-212ENST00000482048 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.53■■■□□ 2.16
ALG3-212ENST00000482048 MLECQ14165 292 aa28.5■■■□□ 2.15
ALG3-212ENST00000482048 ERBINQ96RT1 1412 aa28.48■■■□□ 2.15
ALG3-212ENST00000482048 KIF3BO15066 747 aa28.47■■■□□ 2.15
ALG3-212ENST00000482048 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.45■■■□□ 2.14
ALG3-212ENST00000482048 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.45■■■□□ 2.14
ALG3-212ENST00000482048 GGT6Q6P531 493 aa28.42■■■□□ 2.14
ALG3-212ENST00000482048 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.42■■■□□ 2.14
ALG3-212ENST00000482048 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ALG3-212ENST00000482048 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.38■■■□□ 2.13
ALG3-212ENST00000482048 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.38■■■□□ 2.13
ALG3-212ENST00000482048 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ALG3-212ENST00000482048 HFM1A2PYH4 1435 aa28.35■■■□□ 2.13
ALG3-212ENST00000482048 NAIPQ13075 1403 aa28.34■■■□□ 2.13
ALG3-212ENST00000482048 MADDQ8WXG6 1647 aa28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms