RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 MLECQ14165 292 aa14.13□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 EEA1Q15075 1411 aa14.12□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.12□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.12□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 FANCAO15360 1455 aa14.12□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 MADDQ8WXG6 1647 aa14.12□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.11□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.11□□□□□ -0.15
CTPS1-208ENST00000479480 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.07□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 PLCH2O75038 1416 aa14.07□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 RICTORQ6R327 1708 aa14.05□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.05□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.05□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.05□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 AFAP1Q8N556 730 aa14.03□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.03□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.03□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 HECW1Q76N89 1606 aa14.02□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.02□□□□□ -0.16
CTPS1-208ENST00000479480 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.01□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.01□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.01□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 CERKQ8TCT0 537 aa14.01□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 ATP10AO60312 1499 aa13.99□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.99□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.97□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.96□□□□□ -0.17
CTPS1-208ENST00000479480 FMN1Q68DA7 1419 aa13.96□□□□□ -0.18
CTPS1-208ENST00000479480 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.94□□□□□ -0.18
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.94□□□□□ -0.18
CTPS1-208ENST00000479480 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
CTPS1-208ENST00000479480 KIF14Q15058 1648 aa13.91□□□□□ -0.18
CTPS1-208ENST00000479480 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.9□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.89□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa13.88□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.87□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 CLIP1P30622 1438 aa13.86□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.85□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 DCAF8L1A6NGE4 600 aa13.85□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.85□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 KDM5CP41229 1560 aa13.84□□□□□ -0.19
CTPS1-208ENST00000479480 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.83□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.83□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa13.82□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 ILDR2Q71H61 639 aa13.82□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa13.81□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 STRCQ7RTU9 1775 aa13.81□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.8□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 ABCA6Q8N139 1617 aa13.79□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.79□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 AGLP35573 1532 aa13.79□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRTO14522 1441 aa13.78□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 REREQ9P2R6 1566 aa13.78□□□□□ -0.2
CTPS1-208ENST00000479480 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 ABCC1P33527 1531 aa13.77□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZMYM3Q14202 1370 aa13.77□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.77□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.76□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC18Q5T9S5 1454 aa13.75□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 C3P01024 1663 aa13.75□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.74□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 PREX2Q70Z35 1606 aa13.73□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 GGT6Q6P531 493 aa13.73□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 NCOA1Q15788 1441 aa13.73□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.73□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.72□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.72□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.72□□□□□ -0.21
CTPS1-208ENST00000479480 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.7□□□□□ -0.226e-6■■□□□ 13.7
CTPS1-208ENST00000479480 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa13.7□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.69□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.69□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.69□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 FYCO1Q9BQS8 1478 aa13.68□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 NPATQ14207 1427 aa13.68□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 SOCS7O14512 581 aa13.68□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.67□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 A2MP01023 1474 aa13.67□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 PTPRKQ15262 1439 aa13.66□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 PKD2Q13563 968 aa13.65□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.65□□□□□ -0.22
CTPS1-208ENST00000479480 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.64□□□□□ -0.23
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