RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472351.5

SZRD1-204, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-204ENST00000472351 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.5■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.5■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 CLIP1P30622 1438 aa23.48■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.47■■□□□ 1.35
SZRD1-204ENST00000472351 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SZRD1-204ENST00000472351 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.45■■□□□ 1.34
SZRD1-204ENST00000472351 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.43■■□□□ 1.34
SZRD1-204ENST00000472351 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.42■■□□□ 1.34
SZRD1-204ENST00000472351 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.41■■□□□ 1.34
SZRD1-204ENST00000472351 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.38■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.37■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 ATP10AO60312 1499 aa23.37■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.37■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.37■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.36■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 KDM5CP41229 1560 aa23.35■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 PREX2Q70Z35 1606 aa23.35■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 MLECQ14165 292 aa23.35■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.33■■□□□ 1.33
SZRD1-204ENST00000472351 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.31■■□□□ 1.32
SZRD1-204ENST00000472351 AFAP1Q8N556 730 aa23.3■■□□□ 1.32
SZRD1-204ENST00000472351 ABCC1P33527 1531 aa23.29■■□□□ 1.32
SZRD1-204ENST00000472351 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.28■■□□□ 1.32
SZRD1-204ENST00000472351 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.28■■□□□ 1.32
SZRD1-204ENST00000472351 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.27■■□□□ 1.32
SZRD1-204ENST00000472351 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.27■■□□□ 1.32
SZRD1-204ENST00000472351 ABCA6Q8N139 1617 aa23.25■■□□□ 1.31
SZRD1-204ENST00000472351 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.24■■□□□ 1.31
SZRD1-204ENST00000472351 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.24■■□□□ 1.31
SZRD1-204ENST00000472351 REREQ9P2R6 1566 aa23.23■■□□□ 1.31
SZRD1-204ENST00000472351 HSPA2P54652 639 aa23.21■■□□□ 1.31
SZRD1-204ENST00000472351 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.17■■□□□ 1.3
SZRD1-204ENST00000472351 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.17■■□□□ 1.3
SZRD1-204ENST00000472351 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.17■■□□□ 1.3
SZRD1-204ENST00000472351 AGLP35573 1532 aa23.15■■□□□ 1.3
SZRD1-204ENST00000472351 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SZRD1-204ENST00000472351 FBXO41Q8TF61 875 aa23.15■■□□□ 1.3
SZRD1-204ENST00000472351 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SZRD1-204ENST00000472351 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SZRD1-204ENST00000472351 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.13■■□□□ 1.29
SZRD1-204ENST00000472351 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.1■■□□□ 1.29
SZRD1-204ENST00000472351 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.09■■□□□ 1.29
SZRD1-204ENST00000472351 C3P01024 1663 aa23.09■■□□□ 1.29
SZRD1-204ENST00000472351 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.07■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.283e-7■■■■□ 24.6
SZRD1-204ENST00000472351 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 CEP162Q5TB80 1403 aa23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.05■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 ATP7AQ04656 1500 aa23.04■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 TIAM1Q13009 1591 aa23.03■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.02■■□□□ 1.28
SZRD1-204ENST00000472351 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SZRD1-204ENST00000472351 STRCQ7RTU9 1775 aa22.99■■□□□ 1.27
SZRD1-204ENST00000472351 PLXNC1O60486 1568 aa22.97■■□□□ 1.27
SZRD1-204ENST00000472351 MROH2AA6NES4 1674 aa22.97■■□□□ 1.27
SZRD1-204ENST00000472351 A2MP01023 1474 aa22.96■■□□□ 1.27
SZRD1-204ENST00000472351 CERKQ8TCT0 537 aa22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-204ENST00000472351 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.93■■□□□ 1.26
SZRD1-204ENST00000472351 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-204ENST00000472351 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.92■■□□□ 1.26
SZRD1-204ENST00000472351 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SZRD1-204ENST00000472351 MBD5Q9P267 1494 aa22.91■■□□□ 1.26
SZRD1-204ENST00000472351 NPATQ14207 1427 aa22.9■■□□□ 1.26
SZRD1-204ENST00000472351 ZMYM3Q14202 1370 aa22.89■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 NCOA2Q15596 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.86■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 PTPRTO14522 1441 aa22.85■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 GGT6Q6P531 493 aa22.85■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.85■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 NCOA1Q15788 1441 aa22.83■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.83■■□□□ 1.25
SZRD1-204ENST00000472351 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.82■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.81■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.81■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.79■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 PTPRKQ15262 1439 aa22.79■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.78■■□□□ 1.24
SZRD1-204ENST00000472351 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.76■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.76■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.76■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.71■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 KIF3BO15066 747 aa22.71■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 PLA2R1Q13018 1463 aa22.71■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.71■■□□□ 1.23
SZRD1-204ENST00000472351 MAP3K1Q13233 1512 aa22.7■■□□□ 1.22
SZRD1-204ENST00000472351 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.7■■□□□ 1.22
SZRD1-204ENST00000472351 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms