RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472351.5

SZRD1-204, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-204ENST00000472351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.88■■■■□ 3.33
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SZRD1-204ENST00000472351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.63■■■□□ 2.49
SZRD1-204ENST00000472351 NACADO15069 1562 aa30.42■■■□□ 2.46
SZRD1-204ENST00000472351 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.23■■■□□ 2.43
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SZRD1-204ENST00000472351 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.01■■■□□ 2.4
SZRD1-204ENST00000472351 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.96■■■□□ 2.39
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SZRD1-204ENST00000472351 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
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SZRD1-204ENST00000472351 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.35■■■□□ 2.29
SZRD1-204ENST00000472351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.05■■■□□ 2.24
SZRD1-204ENST00000472351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SZRD1-204ENST00000472351 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.95■■■□□ 2.22
SZRD1-204ENST00000472351 NCAPD3P42695 1498 aa28.06■■■□□ 2.08
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SZRD1-204ENST00000472351 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.99■■■□□ 2.07
SZRD1-204ENST00000472351 SMARCA2P51531 1590 aa27.93■■■□□ 2.06
SZRD1-204ENST00000472351 HMGXB3Q12766 1538 aa27.89■■■□□ 2.06
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SZRD1-204ENST00000472351 CUX2O14529 1486 aa27.7■■■□□ 2.02
SZRD1-204ENST00000472351 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.65■■■□□ 2.02
SZRD1-204ENST00000472351 NESP48681 1621 aa27.62■■■□□ 2.01
SZRD1-204ENST00000472351 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.58■■■□□ 2.01
SZRD1-204ENST00000472351 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.46■■□□□ 1.99
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SZRD1-204ENST00000472351 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.3■■□□□ 1.96
SZRD1-204ENST00000472351 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.27■■□□□ 1.96
SZRD1-204ENST00000472351 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.21■■□□□ 1.95
SZRD1-204ENST00000472351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
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SZRD1-204ENST00000472351 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
SZRD1-204ENST00000472351 WDR62O43379 1518 aa26.99■■□□□ 1.91
SZRD1-204ENST00000472351 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.95■■□□□ 1.91
SZRD1-204ENST00000472351 CFTRP13569 1480 aa26.92■■□□□ 1.9
SZRD1-204ENST00000472351 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.92■■□□□ 1.9
SZRD1-204ENST00000472351 PRDM2Q13029 1718 aa26.72■■□□□ 1.87
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SZRD1-204ENST00000472351 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.66■■□□□ 1.86
SZRD1-204ENST00000472351 TOPBP1Q92547 1522 aa26.42■■□□□ 1.82
SZRD1-204ENST00000472351 TRIM41Q8WV44 630 aa26.41■■□□□ 1.82
SZRD1-204ENST00000472351 IFT140Q96RY7 1462 aa26.41■■□□□ 1.82
SZRD1-204ENST00000472351 OSCARQ8IYS5 282 aa26.39■■□□□ 1.82
SZRD1-204ENST00000472351 ABCC8Q09428 1581 aa26.36■■□□□ 1.81
SZRD1-204ENST00000472351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SZRD1-204ENST00000472351 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.34■■□□□ 1.81
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SZRD1-204ENST00000472351 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.1■■□□□ 1.77
SZRD1-204ENST00000472351 CHD1O14646 1710 aa26.05■■□□□ 1.76
SZRD1-204ENST00000472351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.04■■□□□ 1.76
SZRD1-204ENST00000472351 ARHGEF11O15085 1522 aa26.01■■□□□ 1.75
SZRD1-204ENST00000472351 SOGA1O94964 1423 aa26.01■■□□□ 1.75
SZRD1-204ENST00000472351 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26■■□□□ 1.75
SZRD1-204ENST00000472351 CUX1P39880 1505 aa25.98■■□□□ 1.75
SZRD1-204ENST00000472351 WDR97A6NE52 1622 aa25.95■■□□□ 1.74
SZRD1-204ENST00000472351 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SZRD1-204ENST00000472351 FBLN2P98095 1184 aa25.92■■□□□ 1.74
SZRD1-204ENST00000472351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SZRD1-204ENST00000472351 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.87■■□□□ 1.73
SZRD1-204ENST00000472351 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SZRD1-204ENST00000472351 GRIN2BQ13224 1484 aa25.79■■□□□ 1.72
SZRD1-204ENST00000472351 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.77■■□□□ 1.72
SZRD1-204ENST00000472351 ARAP1Q96P48 1450 aa25.76■■□□□ 1.71
SZRD1-204ENST00000472351 PBRM1Q86U86 1689 aa25.74■■□□□ 1.71
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SZRD1-204ENST00000472351 SYNJ1O43426 1573 aa25.73■■□□□ 1.71
SZRD1-204ENST00000472351 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.73■■□□□ 1.71
SZRD1-204ENST00000472351 SYNJ2O15056 1496 aa25.71■■□□□ 1.71
SZRD1-204ENST00000472351 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.71■■□□□ 1.71
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SZRD1-204ENST00000472351 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.68■■□□□ 1.7
SZRD1-204ENST00000472351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.6■■□□□ 1.69
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SZRD1-204ENST00000472351 ADAMTS12P58397 1594 aa25.49■■□□□ 1.67
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SZRD1-204ENST00000472351 GRIN2AQ12879 1464 aa25.47■■□□□ 1.67
SZRD1-204ENST00000472351 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.39■■□□□ 1.66
SZRD1-204ENST00000472351 CEP170Q5SW79 1584 aa25.39■■□□□ 1.65
SZRD1-204ENST00000472351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.38■■□□□ 1.65
SZRD1-204ENST00000472351 NUP160Q12769 1436 aa25.37■■□□□ 1.65
SZRD1-204ENST00000472351 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.33■■□□□ 1.65
SZRD1-204ENST00000472351 SHROOM2Q13796 1616 aa25.28■■□□□ 1.64
SZRD1-204ENST00000472351 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SZRD1-204ENST00000472351 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
SZRD1-204ENST00000472351 JPH4Q96JJ6 628 aa25.09■■□□□ 1.61
SZRD1-204ENST00000472351 KIF27Q86VH2 1401 aa25.06■■□□□ 1.6
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