RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470199.2

LMNA-211, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 4

Gene LMNA, Length 551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNA-211ENST00000470199 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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LMNA-211ENST00000470199 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.13■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 PREX2Q70Z35 1606 aa28.13■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.11■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.11■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 ADGRL1O94910 1474 aa28.1■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.09■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 NCOA2Q15596 1464 aa28.09■■■□□ 2.09
LMNA-211ENST00000470199 APLP2Q06481 763 aa28.07■■■□□ 2.08
LMNA-211ENST00000470199 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
LMNA-211ENST00000470199 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
LMNA-211ENST00000470199 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
LMNA-211ENST00000470199 RICTORQ6R327 1708 aa28.03■■■□□ 2.08
LMNA-211ENST00000470199 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.02■■■□□ 2.08
LMNA-211ENST00000470199 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.01■■■□□ 2.07
LMNA-211ENST00000470199 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28■■■□□ 2.07
LMNA-211ENST00000470199 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
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LMNA-211ENST00000470199 AFAP1Q8N556 730 aa27.98■■■□□ 2.07
LMNA-211ENST00000470199 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.96■■■□□ 2.07
LMNA-211ENST00000470199 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
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LMNA-211ENST00000470199 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.92■■■□□ 2.06
LMNA-211ENST00000470199 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.92■■■□□ 2.06
LMNA-211ENST00000470199 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.92■■■□□ 2.06
LMNA-211ENST00000470199 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.89■■■□□ 2.05
LMNA-211ENST00000470199 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
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LMNA-211ENST00000470199 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.85■■■□□ 2.05
LMNA-211ENST00000470199 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.85■■■□□ 2.05
LMNA-211ENST00000470199 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.84■■■□□ 2.05
LMNA-211ENST00000470199 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.84■■■□□ 2.05
LMNA-211ENST00000470199 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.83■■■□□ 2.05
LMNA-211ENST00000470199 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.83■■■□□ 2.05
LMNA-211ENST00000470199 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.83■■■□□ 2.04
LMNA-211ENST00000470199 MBD5Q9P267 1494 aa27.83■■■□□ 2.04
LMNA-211ENST00000470199 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.82■■■□□ 2.04
LMNA-211ENST00000470199 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.8■■■□□ 2.04
LMNA-211ENST00000470199 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.77■■■□□ 2.04
LMNA-211ENST00000470199 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.77■■■□□ 2.04
LMNA-211ENST00000470199 MIA2Q96PC5 1412 aa27.76■■■□□ 2.04
LMNA-211ENST00000470199 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.76■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.73■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 ATP10AO60312 1499 aa27.73■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 ABCA6Q8N139 1617 aa27.73■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.73■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.71■■■□□ 2.03
LMNA-211ENST00000470199 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.68■■■□□ 2.02
LMNA-211ENST00000470199 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.68■■■□□ 2.02
LMNA-211ENST00000470199 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.67■■■□□ 2.02
LMNA-211ENST00000470199 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
LMNA-211ENST00000470199 ATP7AQ04656 1500 aa27.67■■■□□ 2.02
LMNA-211ENST00000470199 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.65■■■□□ 2.02
LMNA-211ENST00000470199 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
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LMNA-211ENST00000470199 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.6■■■□□ 2.01
LMNA-211ENST00000470199 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.58■■■□□ 2.01
LMNA-211ENST00000470199 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
LMNA-211ENST00000470199 ABCC5O15440 1437 aa27.58■■■□□ 2
LMNA-211ENST00000470199 REREQ9P2R6 1566 aa27.57■■■□□ 2
LMNA-211ENST00000470199 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.57■■■□□ 2
LMNA-211ENST00000470199 TSPY4P0CV99 314 aa27.57■■■□□ 2
LMNA-211ENST00000470199 TSPY10P0CW01 314 aa27.57■■■□□ 2
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LMNA-211ENST00000470199 A2MP01023 1474 aa27.53■■■□□ 2
LMNA-211ENST00000470199 DAPK1P53355 1430 aa27.52■■■□□ 2
LMNA-211ENST00000470199 MADDQ8WXG6 1647 aa27.52■■■□□ 2
LMNA-211ENST00000470199 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.51■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 AGLP35573 1532 aa27.51■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 PLXNC1O60486 1568 aa27.49■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.49■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.48■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.46■■□□□ 1.99
LMNA-211ENST00000470199 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.44■■□□□ 1.98
LMNA-211ENST00000470199 PTPRMP28827 1452 aa27.43■■□□□ 1.98
LMNA-211ENST00000470199 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
LMNA-211ENST00000470199 PTPRKQ15262 1439 aa27.42■■□□□ 1.98
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LMNA-211ENST00000470199 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.39■■□□□ 1.98
LMNA-211ENST00000470199 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.38■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 KIF3BO15066 747 aa27.38■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 GGT6Q6P531 493 aa27.38■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 ITGAEP38570 1179 aa27.37■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 KIF15Q9NS87 1388 aa27.36■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 NCOA1Q15788 1441 aa27.33■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
LMNA-211ENST00000470199 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.32■■□□□ 1.96
LMNA-211ENST00000470199 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.31■■□□□ 1.96
LMNA-211ENST00000470199 ADGRL2O95490 1459 aa27.31■■□□□ 1.96
LMNA-211ENST00000470199 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
LMNA-211ENST00000470199 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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