RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462548.6

RPRD1B-203, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 5

Gene RPRD1B, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-203ENST00000462548 PREX2Q70Z35 1606 aa22.42■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 DAPK1P53355 1430 aa22.4■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.4■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 ABCC5O15440 1437 aa22.4■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.38■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 ASXL2Q76L83 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 HFM1A2PYH4 1435 aa22.36■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.36■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.35■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 NAIPQ13075 1403 aa22.35■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.35■■□□□ 1.17
RPRD1B-203ENST00000462548 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.32■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.32■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 PLCH2O75038 1416 aa22.3■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.3■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 AKNAQ7Z591 1439 aa22.29■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.28■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 MBD5Q9P267 1494 aa22.28■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.28■■□□□ 1.16
RPRD1B-203ENST00000462548 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 27.2
RPRD1B-203ENST00000462548 ROCK1Q13464 1354 aa22.26■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 KDM6BO15054 1643 aa22.26■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.25■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.24■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.22■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.22■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 ADGRL2O95490 1459 aa22.22■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.21■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.21■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 NCOA1Q15788 1441 aa22.2■■□□□ 1.15
RPRD1B-203ENST00000462548 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.2■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.19■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.19■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 MAPKBP1O60336 1514 aa22.19■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.19■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 ABCC1P33527 1531 aa22.17■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.17■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.15■■□□□ 1.14
RPRD1B-203ENST00000462548 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.14■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 FANCAO15360 1455 aa22.14■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 TSPY4P0CV99 314 aa22.14■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 TSPY10P0CW01 314 aa22.14■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.12■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.11■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.1■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 CD109Q6YHK3 1445 aa22.1■■□□□ 1.13
RPRD1B-203ENST00000462548 KIF15Q9NS87 1388 aa22.06■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 TRIM52Q96A61 297 aa22.05■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.05■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 ADGRL1O94910 1474 aa22.04■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.03■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 AFAP1Q8N556 730 aa22.02■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 GLI2P10070 1586 aa22.02■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.02■■□□□ 1.12
RPRD1B-203ENST00000462548 PLXNC1O60486 1568 aa22.01■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 DIP2BQ9P265 1576 aa22.01■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.99■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.98■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.98■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.97■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.96■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 PZPP20742 1482 aa21.96■■□□□ 1.11
RPRD1B-203ENST00000462548 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.94■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 NEO1Q92859 1461 aa21.92■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 ATP7AQ04656 1500 aa21.91■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.91■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 NEUROD1Q13562 356 aa21.91■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 FOXD1Q16676 465 aa21.9■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.89■■□□□ 1.1
RPRD1B-203ENST00000462548 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.89■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.88■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 NUP155O75694 1391 aa21.87■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 KDM5CP41229 1560 aa21.87■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.87■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.87■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 ERBINQ96RT1 1412 aa21.86■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 TSPOAP1O95153 1857 aa21.86■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 UNC13BO14795 1591 aa21.85■■□□□ 1.09
RPRD1B-203ENST00000462548 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.82■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 RAPGEF3O95398 923 aa21.82■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.81■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 RICTORQ6R327 1708 aa21.8■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 PKD2Q13563 968 aa21.8■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.8■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.79■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.79■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.79■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.085e-8■■■□□ 16.1
RPRD1B-203ENST00000462548 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.77■■□□□ 1.08
RPRD1B-203ENST00000462548 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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