RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-209ENST00000441099 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC12-209ENST00000441099 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 TIAM1Q13009 1591 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 AFAP1Q8N556 730 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAP3K1Q13233 1512 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC12-209ENST00000441099 PREX2Q70Z35 1606 aa25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 RICTORQ6R327 1708 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 NCOA2Q15596 1464 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
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TRAPPC12-209ENST00000441099 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 APLP2Q06481 763 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 KDM5CP41229 1560 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC12-209ENST00000441099 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC12-209ENST00000441099 ATP10AO60312 1499 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC12-209ENST00000441099 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12-209ENST00000441099 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC12-209ENST00000441099 MBD5Q9P267 1494 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC12-209ENST00000441099 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12-209ENST00000441099 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC12-209ENST00000441099 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC12-209ENST00000441099 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC12-209ENST00000441099 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC12-209ENST00000441099 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 MIA2Q96PC5 1412 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 MLECQ14165 292 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCA6Q8N139 1617 aa24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 REREQ9P2R6 1566 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 PTPRMP28827 1452 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 ATP7AQ04656 1500 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 AGLP35573 1532 aa24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC12-209ENST00000441099 TSPY4P0CV99 314 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12-209ENST00000441099 TSPY10P0CW01 314 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC12-209ENST00000441099 MADDQ8WXG6 1647 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12-209ENST00000441099 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC12-209ENST00000441099 A2MP01023 1474 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC12-209ENST00000441099 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC12-209ENST00000441099 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLXNC1O60486 1568 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCC5O15440 1437 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC12-209ENST00000441099 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC12-209ENST00000441099 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 GGT6Q6P531 493 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 DAPK1P53355 1430 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF3BO15066 747 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC12-209ENST00000441099 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC12-209ENST00000441099 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC12-209ENST00000441099 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12-209ENST00000441099 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC12-209ENST00000441099 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZMYM3Q14202 1370 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF15Q9NS87 1388 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC12-209ENST00000441099 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12-209ENST00000441099 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12-209ENST00000441099 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC12-209ENST00000441099 NCOA1Q15788 1441 aa24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12-209ENST00000441099 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12-209ENST00000441099 PTPRKQ15262 1439 aa24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12-209ENST00000441099 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.56e-6■■■□□ 18.9
TRAPPC12-209ENST00000441099 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.43■■□□□ 1.5
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