RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 FMN1Q68DA7 1419 aa15.78■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 NUP155O75694 1391 aa15.78■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.78■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 FOXD1Q16676 465 aa15.77■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.77■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
NEK1-201ENST00000439128 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
NEK1-201ENST00000439128 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
NEK1-201ENST00000439128 EVA1CP58658 441 aa15.72■□□□□ 0.11
NEK1-201ENST00000439128 CASC1Q6TDU7 716 aa15.71■□□□□ 0.11
NEK1-201ENST00000439128 MSH5O43196 834 aa15.71■□□□□ 0.11
NEK1-201ENST00000439128 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.71■□□□□ 0.1
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NEK1-201ENST00000439128 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
NEK1-201ENST00000439128 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.7■□□□□ 0.1
NEK1-201ENST00000439128 WIZO95785 1651 aa15.7■□□□□ 0.1
NEK1-201ENST00000439128 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.69■□□□□ 0.1
NEK1-201ENST00000439128 G3V3G9 751 aa15.68■□□□□ 0.1
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NEK1-201ENST00000439128 AMPHP49418 695 aa15.66■□□□□ 0.1
NEK1-201ENST00000439128 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.66■□□□□ 0.1
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NEK1-201ENST00000439128 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
NEK1-201ENST00000439128 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 FGD1P98174 961 aa15.63■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 20.3
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NEK1-201ENST00000439128 KCNJ4P48050 445 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.62■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 KLHL34Q8N239 644 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.61■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.59■□□□□ 0.09
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NEK1-201ENST00000439128 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 ATF3P18847 181 aa15.58■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.58■□□□□ 0.09
NEK1-201ENST00000439128 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.58■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.57■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 MS4A1P11836 297 aa15.57■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 MIER1Q8N108 512 aa15.57■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.56■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.56■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.55■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 PSME1Q06323 249 aa15.54■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.54■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
NEK1-201ENST00000439128 CLSTN1O94985 981 aa15.53■□□□□ 0.08
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NEK1-201ENST00000439128 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 GORABQ5T7V8 394 aa15.5■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 APBB1O00213 710 aa15.5■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.5■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 STK31Q9BXU1 1019 aa15.49■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 BECN1Q14457 450 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.48■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.47■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 COG3Q96JB2 828 aa15.46■□□□□ 0.07
NEK1-201ENST00000439128 RGS3P49796 1198 aa15.46■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 PIP4K2BP78356 416 aa15.44■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 UACAQ9BZF9 1416 aa15.44■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.43■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.42■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.41■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.4■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.4■□□□□ 0.06
NEK1-201ENST00000439128 PRDM2Q13029 1718 aa15.39■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 EVC2Q86UK5 1308 aa15.39■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.39■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.38■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 NESP48681 1621 aa15.38■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 NGEFQ8N5V2 710 aa15.38■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.38■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 GRIN2BQ13224 1484 aa15.37■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.37■□□□□ 0.05
NEK1-201ENST00000439128 NCAPD3P42695 1498 aa15.37■□□□□ 0.05
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