RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.25■■□□□ 1.47
CNGA3-205ENST00000436404 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
CNGA3-205ENST00000436404 ASXL2Q76L83 1435 aa24.24■■□□□ 1.47
CNGA3-205ENST00000436404 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CNGA3-205ENST00000436404 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.23■■□□□ 1.47
CNGA3-205ENST00000436404 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.22■■□□□ 1.47
CNGA3-205ENST00000436404 MIA2Q96PC5 1412 aa24.2■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.18■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 KCNH8Q96L42 1107 aa24.18■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 MAPKBP1O60336 1514 aa24.17■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 PREX2Q70Z35 1606 aa24.17■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.15■■□□□ 1.46
CNGA3-205ENST00000436404 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.14■■□□□ 1.45
CNGA3-205ENST00000436404 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CNGA3-205ENST00000436404 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CNGA3-205ENST00000436404 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.08■■□□□ 1.45
CNGA3-205ENST00000436404 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.06■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 PLCH2O75038 1416 aa24.05■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.05■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRKQ15262 1439 aa24.04■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 ITGAEP38570 1179 aa24.04■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.03■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.02■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CNGA3-205ENST00000436404 DIP2BQ9P265 1576 aa23.98■■□□□ 1.43
CNGA3-205ENST00000436404 GLI2P10070 1586 aa23.97■■□□□ 1.43
CNGA3-205ENST00000436404 DAPK1P53355 1430 aa23.96■■□□□ 1.43
CNGA3-205ENST00000436404 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.96■■□□□ 1.43
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC5O15440 1437 aa23.96■■□□□ 1.43
CNGA3-205ENST00000436404 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.96■■□□□ 1.43
CNGA3-205ENST00000436404 MBD5Q9P267 1494 aa23.94■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.93■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.92■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 CD109Q6YHK3 1445 aa23.92■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC1P33527 1531 aa23.91■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.91■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.91■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 FANCAO15360 1455 aa23.91■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.9■■□□□ 1.42
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.88■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 BCANQ96GW7 911 aa23.85■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 AKNAQ7Z591 1439 aa23.85■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.85■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.84■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.84■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.84■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.83■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 HFM1A2PYH4 1435 aa23.83■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.83■■□□□ 1.41
CNGA3-205ENST00000436404 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.83■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 FKBP8Q14318 412 aa23.82■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.81■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 NAIPQ13075 1403 aa23.81■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRL2O95490 1459 aa23.81■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 ROCK1Q13464 1354 aa23.8■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.8■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 TSPOAP1O95153 1857 aa23.8■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRL1O94910 1474 aa23.79■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.79■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.78■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.78■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.77■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 NEO1Q92859 1461 aa23.77■■□□□ 1.4
CNGA3-205ENST00000436404 NCOA1Q15788 1441 aa23.76■■□□□ 1.39
CNGA3-205ENST00000436404 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.76■■□□□ 1.39
CNGA3-205ENST00000436404 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CNGA3-205ENST00000436404 KDM6BO15054 1643 aa23.76■■□□□ 1.39
CNGA3-205ENST00000436404 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.75■■□□□ 1.39
CNGA3-205ENST00000436404 TSPY4P0CV99 314 aa23.71■■□□□ 1.39
CNGA3-205ENST00000436404 TSPY10P0CW01 314 aa23.71■■□□□ 1.39
CNGA3-205ENST00000436404 AFAP1Q8N556 730 aa23.7■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.69■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 PLXNC1O60486 1568 aa23.69■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 MSH5O43196 834 aa23.68■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.68■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 NEFLP07196 543 aa23.67■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.67■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 KDM5CP41229 1560 aa23.66■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 RICTORQ6R327 1708 aa23.66■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.65■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.65■■□□□ 1.38
CNGA3-205ENST00000436404 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.63■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.63■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 KIF15Q9NS87 1388 aa23.63■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 ATP7AQ04656 1500 aa23.62■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.62■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CNGA3-205ENST00000436404 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.6■■□□□ 1.37
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