RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433071.2

AP000251.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP000251.1, Length 822 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000251.1-201ENST00000433071 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
AP000251.1-201ENST00000433071 ADGRL1O94910 1474 aa40.65■■■■■ 4.1
AP000251.1-201ENST00000433071 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.65■■■■■ 4.1
AP000251.1-201ENST00000433071 MAP3K1Q13233 1512 aa40.62■■■■■ 4.09
AP000251.1-201ENST00000433071 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
AP000251.1-201ENST00000433071 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.6■■■■■ 4.09
AP000251.1-201ENST00000433071 RICTORQ6R327 1708 aa40.6■■■■■ 4.09
AP000251.1-201ENST00000433071 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.58■■■■■ 4.09
AP000251.1-201ENST00000433071 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.58■■■■■ 4.09
AP000251.1-201ENST00000433071 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
AP000251.1-201ENST00000433071 APLP2Q06481 763 aa40.52■■■■■ 4.08
AP000251.1-201ENST00000433071 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
AP000251.1-201ENST00000433071 NCOA2Q15596 1464 aa40.51■■■■■ 4.07
AP000251.1-201ENST00000433071 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.5■■■■■ 4.07
AP000251.1-201ENST00000433071 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
AP000251.1-201ENST00000433071 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
AP000251.1-201ENST00000433071 ABCC1P33527 1531 aa40.46■■■■■ 4.07
AP000251.1-201ENST00000433071 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.45■■■■■ 4.07
AP000251.1-201ENST00000433071 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.44■■■■■ 4.06
AP000251.1-201ENST00000433071 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.43■■■■■ 4.06
AP000251.1-201ENST00000433071 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.41■■■■■ 4.06
AP000251.1-201ENST00000433071 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.39■■■■■ 4.06
AP000251.1-201ENST00000433071 AFAP1Q8N556 730 aa40.36■■■■■ 4.05
AP000251.1-201ENST00000433071 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.34■■■■■ 4.05
AP000251.1-201ENST00000433071 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.34■■■■■ 4.05
AP000251.1-201ENST00000433071 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.33■■■■■ 4.05
AP000251.1-201ENST00000433071 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.32■■■■■ 4.05
AP000251.1-201ENST00000433071 KDM5CP41229 1560 aa40.32■■■■■ 4.05
AP000251.1-201ENST00000433071 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.32■■■■■ 4.04
AP000251.1-201ENST00000433071 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.31■■■■■ 4.04
AP000251.1-201ENST00000433071 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.3■■■■■ 4.04
AP000251.1-201ENST00000433071 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
AP000251.1-201ENST00000433071 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
AP000251.1-201ENST00000433071 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.27■■■■■ 4.04
AP000251.1-201ENST00000433071 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.26■■■■■ 4.04
AP000251.1-201ENST00000433071 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.23■■■■■ 4.03
AP000251.1-201ENST00000433071 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.2■■■■■ 4.03
AP000251.1-201ENST00000433071 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.19■■■■■ 4.02
AP000251.1-201ENST00000433071 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.17■■■■■ 4.02
AP000251.1-201ENST00000433071 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.17■■■■■ 4.02
AP000251.1-201ENST00000433071 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
AP000251.1-201ENST00000433071 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
AP000251.1-201ENST00000433071 ATP10AO60312 1499 aa40.13■■■■■ 4.02
AP000251.1-201ENST00000433071 MBD5Q9P267 1494 aa40.13■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.11■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.1■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 MIA2Q96PC5 1412 aa40.09■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.09■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 ABCA6Q8N139 1617 aa40.09■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.08■■■■■ 4.01
AP000251.1-201ENST00000433071 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.02■■■■■ 4
AP000251.1-201ENST00000433071 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
AP000251.1-201ENST00000433071 ATP7AQ04656 1500 aa40.01■■■■■ 4
AP000251.1-201ENST00000433071 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40■■■■□ 3.99
AP000251.1-201ENST00000433071 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.98■■■■□ 3.99
AP000251.1-201ENST00000433071 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.98■■■■□ 3.99
AP000251.1-201ENST00000433071 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.97■■■■□ 3.99
AP000251.1-201ENST00000433071 REREQ9P2R6 1566 aa39.97■■■■□ 3.99
AP000251.1-201ENST00000433071 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.95■■■■□ 3.99
AP000251.1-201ENST00000433071 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.94■■■■□ 3.99
AP000251.1-201ENST00000433071 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
AP000251.1-201ENST00000433071 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.9■■■■□ 3.98
AP000251.1-201ENST00000433071 MLECQ14165 292 aa39.89■■■■□ 3.98
AP000251.1-201ENST00000433071 MADDQ8WXG6 1647 aa39.87■■■■□ 3.97
AP000251.1-201ENST00000433071 TSPY4P0CV99 314 aa39.85■■■■□ 3.97
AP000251.1-201ENST00000433071 TSPY10P0CW01 314 aa39.85■■■■□ 3.97
AP000251.1-201ENST00000433071 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
AP000251.1-201ENST00000433071 AGLP35573 1532 aa39.84■■■■□ 3.97
AP000251.1-201ENST00000433071 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.82■■■■□ 3.96
AP000251.1-201ENST00000433071 A2MP01023 1474 aa39.81■■■■□ 3.96
AP000251.1-201ENST00000433071 PLXNC1O60486 1568 aa39.77■■■■□ 3.96
AP000251.1-201ENST00000433071 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.77■■■■□ 3.96
AP000251.1-201ENST00000433071 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
AP000251.1-201ENST00000433071 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.74■■■■□ 3.95
AP000251.1-201ENST00000433071 PTPRMP28827 1452 aa39.74■■■■□ 3.95
AP000251.1-201ENST00000433071 ABCC5O15440 1437 aa39.73■■■■□ 3.95
AP000251.1-201ENST00000433071 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
AP000251.1-201ENST00000433071 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.71■■■■□ 3.95
AP000251.1-201ENST00000433071 DAPK1P53355 1430 aa39.69■■■■□ 3.94
AP000251.1-201ENST00000433071 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
AP000251.1-201ENST00000433071 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
AP000251.1-201ENST00000433071 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.66■■■■□ 3.94
AP000251.1-201ENST00000433071 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.55■■■■□ 3.92
AP000251.1-201ENST00000433071 GGT6Q6P531 493 aa39.54■■■■□ 3.92
AP000251.1-201ENST00000433071 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
AP000251.1-201ENST00000433071 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.53■■■■□ 3.92
AP000251.1-201ENST00000433071 KIF3BO15066 747 aa39.52■■■■□ 3.92
AP000251.1-201ENST00000433071 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.49■■■■□ 3.91
AP000251.1-201ENST00000433071 KIF15Q9NS87 1388 aa39.48■■■■□ 3.91
AP000251.1-201ENST00000433071 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.48■■■■□ 3.91
AP000251.1-201ENST00000433071 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.46■■■■□ 3.91
AP000251.1-201ENST00000433071 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.46■■■■□ 3.91
AP000251.1-201ENST00000433071 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
AP000251.1-201ENST00000433071 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.44■■■■□ 3.9
AP000251.1-201ENST00000433071 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
AP000251.1-201ENST00000433071 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
AP000251.1-201ENST00000433071 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.41■■■■□ 3.9
AP000251.1-201ENST00000433071 ADGRL2O95490 1459 aa39.41■■■■□ 3.9
AP000251.1-201ENST00000433071 C3P01024 1663 aa39.41■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms