RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430525.5

TTC28-AS1-210, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 524 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.68■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-210ENST00000430525 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.65■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.64■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-210ENST00000430525 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.63■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.62■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.61■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CLIP1P30622 1438 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.59■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PREX2Q70Z35 1606 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ATP10AO60312 1499 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MLECQ14165 292 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 AFAP1Q8N556 730 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KDM5CP41229 1560 aa23.52■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.51■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-210ENST00000430525 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.5■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.47■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ABCC1P33527 1531 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.46■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ABCA6Q8N139 1617 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-210ENST00000430525 HSPA2P54652 639 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 REREQ9P2R6 1566 aa23.39■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.38■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.32■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.31■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-210ENST00000430525 AGLP35573 1532 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-210ENST00000430525 C3P01024 1663 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-210ENST00000430525 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CEP162Q5TB80 1403 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FBXO41Q8TF61 875 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TIAM1Q13009 1591 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 STRCQ7RTU9 1775 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ATP7AQ04656 1500 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.2■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.16■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PLXNC1O60486 1568 aa23.14■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MROH2AA6NES4 1674 aa23.14■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.13■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MBD5Q9P267 1494 aa23.12■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.12■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 A2MP01023 1474 aa23.11■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NCOA2Q15596 1464 aa23.08■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZMYM3Q14202 1370 aa23.07■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CERKQ8TCT0 537 aa23.06■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NPATQ14207 1427 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GGT6Q6P531 493 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 VPS8Q8N3P4 1428 aa23■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PTPRTO14522 1441 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PTPRKQ15262 1439 aa22.96■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NCOA1Q15788 1441 aa22.96■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.94■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MAP3K1Q13233 1512 aa22.89■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KIF3BO15066 747 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-210ENST00000430525 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TSPY4P0CV99 314 aa22.84■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TSPY10P0CW01 314 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.6 ms