RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.72■■■□□ 2.67
TSTA3-201ENST00000425753 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.72■■■□□ 2.67
TSTA3-201ENST00000425753 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.72■■■□□ 2.67
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.7■■■□□ 2.67
TSTA3-201ENST00000425753 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.67■■■□□ 2.66
TSTA3-201ENST00000425753 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.67■■■□□ 2.66
TSTA3-201ENST00000425753 AKNAQ7Z591 1439 aa31.64■■■□□ 2.65
TSTA3-201ENST00000425753 MIA2Q96PC5 1412 aa31.63■■■□□ 2.65
TSTA3-201ENST00000425753 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
TSTA3-201ENST00000425753 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.58■■■□□ 2.65
TSTA3-201ENST00000425753 ADGRL1O94910 1474 aa31.57■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 ABCC1P33527 1531 aa31.57■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.55■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.54■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.54■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 KDM6BO15054 1643 aa31.53■■■□□ 2.64
TSTA3-201ENST00000425753 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.5■■■□□ 2.63
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TSTA3-201ENST00000425753 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.49■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.47■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.46■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.45■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.45■■■□□ 2.63
TSTA3-201ENST00000425753 MBD5Q9P267 1494 aa31.44■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 RICTORQ6R327 1708 aa31.43■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.42■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 KDM5CP41229 1560 aa31.4■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.39■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.39■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.39■■■□□ 2.62
TSTA3-201ENST00000425753 RAPGEF3O95398 923 aa31.37■■■□□ 2.61
TSTA3-201ENST00000425753 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.36■■■□□ 2.615e-6■■■■■ 46.2
TSTA3-201ENST00000425753 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
TSTA3-201ENST00000425753 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.34■■■□□ 2.61
TSTA3-201ENST00000425753 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.34■■■□□ 2.61
TSTA3-201ENST00000425753 AFAP1Q8N556 730 aa31.31■■■□□ 2.6
TSTA3-201ENST00000425753 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.31■■■□□ 2.6
TSTA3-201ENST00000425753 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.29■■■□□ 2.6
TSTA3-201ENST00000425753 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
TSTA3-201ENST00000425753 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.26■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 ABCC5O15440 1437 aa31.25■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.24■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 DAPK1P53355 1430 aa31.23■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.23■■■□□ 2.59
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TSTA3-201ENST00000425753 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.22■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.22■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.2■■■□□ 2.59
TSTA3-201ENST00000425753 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.2■■■□□ 2.58
TSTA3-201ENST00000425753 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
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TSTA3-201ENST00000425753 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.15■■■□□ 2.58
TSTA3-201ENST00000425753 TSPY4P0CV99 314 aa31.15■■■□□ 2.58
TSTA3-201ENST00000425753 TSPY10P0CW01 314 aa31.15■■■□□ 2.58
TSTA3-201ENST00000425753 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.13■■■□□ 2.57
TSTA3-201ENST00000425753 ABCA6Q8N139 1617 aa31.12■■■□□ 2.57
TSTA3-201ENST00000425753 PTPRKQ15262 1439 aa31.1■■■□□ 2.57
TSTA3-201ENST00000425753 PLXNC1O60486 1568 aa31.09■■■□□ 2.57
TSTA3-201ENST00000425753 REREQ9P2R6 1566 aa31.09■■■□□ 2.57
TSTA3-201ENST00000425753 ADGRL2O95490 1459 aa31.09■■■□□ 2.57
TSTA3-201ENST00000425753 ATP10AO60312 1499 aa31.08■■■□□ 2.57
TSTA3-201ENST00000425753 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.02■■■□□ 2.56
TSTA3-201ENST00000425753 ROCK1Q13464 1354 aa31.01■■■□□ 2.56
TSTA3-201ENST00000425753 NCOA1Q15788 1441 aa31.01■■■□□ 2.56
TSTA3-201ENST00000425753 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.01■■■□□ 2.55
TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31■■■□□ 2.55
TSTA3-201ENST00000425753 A2MP01023 1474 aa30.99■■■□□ 2.55
TSTA3-201ENST00000425753 AGLP35573 1532 aa30.96■■■□□ 2.55
TSTA3-201ENST00000425753 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
TSTA3-201ENST00000425753 KIF15Q9NS87 1388 aa30.95■■■□□ 2.55
TSTA3-201ENST00000425753 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.95■■■□□ 2.55
TSTA3-201ENST00000425753 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.94■■■□□ 2.54
TSTA3-201ENST00000425753 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.94■■■□□ 2.54
TSTA3-201ENST00000425753 ITGAEP38570 1179 aa30.92■■■□□ 2.54
TSTA3-201ENST00000425753 ERBINQ96RT1 1412 aa30.89■■■□□ 2.54
TSTA3-201ENST00000425753 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.87■■■□□ 2.53
TSTA3-201ENST00000425753 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.87■■■□□ 2.53
TSTA3-201ENST00000425753 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
TSTA3-201ENST00000425753 HFM1A2PYH4 1435 aa30.83■■■□□ 2.53
TSTA3-201ENST00000425753 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.81■■■□□ 2.52
TSTA3-201ENST00000425753 NAIPQ13075 1403 aa30.81■■■□□ 2.52
TSTA3-201ENST00000425753 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.78■■■□□ 2.52
TSTA3-201ENST00000425753 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
TSTA3-201ENST00000425753 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
TSTA3-201ENST00000425753 KIF3BO15066 747 aa30.72■■■□□ 2.51
TSTA3-201ENST00000425753 DEPDC5O75140 1603 aa30.71■■■□□ 2.51
TSTA3-201ENST00000425753 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.7■■■□□ 2.5
TSTA3-201ENST00000425753 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.7■■■□□ 2.5
TSTA3-201ENST00000425753 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.69■■■□□ 2.5
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