RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
CTU1-201ENST00000421832 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
CTU1-201ENST00000421832 PREX2Q70Z35 1606 aa36.65■■■■□ 3.46
CTU1-201ENST00000421832 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.62■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 MAPKBP1O60336 1514 aa36.59■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.57■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.56■■■■□ 3.44
CTU1-201ENST00000421832 PTPRKQ15262 1439 aa36.54■■■■□ 3.44
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.51■■■■□ 3.44
CTU1-201ENST00000421832 PLCH2O75038 1416 aa36.49■■■■□ 3.43
CTU1-201ENST00000421832 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.49■■■■□ 3.43
CTU1-201ENST00000421832 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
CTU1-201ENST00000421832 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.41■■■■□ 3.42
CTU1-201ENST00000421832 ABCC5O15440 1437 aa36.41■■■■□ 3.42
CTU1-201ENST00000421832 DAPK1P53355 1430 aa36.41■■■■□ 3.42
CTU1-201ENST00000421832 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.38■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.35■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 MBD5Q9P267 1494 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.32■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 CD109Q6YHK3 1445 aa36.32■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 DIP2BQ9P265 1576 aa36.32■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 FANCAO15360 1455 aa36.29■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.29■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 GLI2P10070 1586 aa36.28■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.28■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.26■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 ABCC1P33527 1531 aa36.26■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.24■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 AKNAQ7Z591 1439 aa36.23■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.23■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.23■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.22■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.22■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.21■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 HFM1A2PYH4 1435 aa36.21■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.2■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 NAIPQ13075 1403 aa36.2■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.18■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.18■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.15■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.15■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.15■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.14■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 ROCK1Q13464 1354 aa36.14■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 ADGRL1O94910 1474 aa36.13■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 ADGRL2O95490 1459 aa36.12■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 TSPOAP1O95153 1857 aa36.11■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.11■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 NCOA1Q15788 1441 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 TSPY4P0CV99 314 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 TSPY10P0CW01 314 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 KDM6BO15054 1643 aa36.09■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.08■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 AFAP1Q8N556 730 aa36.04■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.04■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 NEO1Q92859 1461 aa36.03■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.03■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CTU1-201ENST00000421832 KIF15Q9NS87 1388 aa35.93■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 PLXNC1O60486 1568 aa35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.89■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.86■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.86■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 ATP7AQ04656 1500 aa35.85■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 KDM5CP41229 1560 aa35.85■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.85■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 RAPGEF3O95398 923 aa35.84■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 RICTORQ6R327 1708 aa35.83■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.82■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 NEUROD1Q13562 356 aa35.79■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.77■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 TRIM52Q96A61 297 aa35.76■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.76■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.75■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.74■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.71■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
CTU1-201ENST00000421832 ERBINQ96RT1 1412 aa35.65■■■■□ 3.3
CTU1-201ENST00000421832 ABCA6Q8N139 1617 aa35.65■■■■□ 3.3
CTU1-201ENST00000421832 PZPP20742 1482 aa35.61■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.6■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.6■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.6■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.58■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8826.7 ms