RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417936.5

SH3BP5-205, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-205ENST00000417936 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
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SH3BP5-205ENST00000417936 MADDQ8WXG6 1647 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP5-205ENST00000417936 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.21■□□□□ 0.34
SH3BP5-205ENST00000417936 CCDC18Q5T9S5 1454 aa17.18■□□□□ 0.34
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SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP5-205ENST00000417936 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP5-205ENST00000417936 ATP10AO60312 1499 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP5-205ENST00000417936 ABCA6Q8N139 1617 aa16.96■□□□□ 0.31
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SH3BP5-205ENST00000417936 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.96■□□□□ 0.31
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SH3BP5-205ENST00000417936 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
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SH3BP5-205ENST00000417936 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.95■□□□□ 0.3
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SH3BP5-205ENST00000417936 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP5-205ENST00000417936 NPATQ14207 1427 aa16.85■□□□□ 0.29
SH3BP5-205ENST00000417936 A2MP01023 1474 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP5-205ENST00000417936 C3P01024 1663 aa16.84■□□□□ 0.29
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SH3BP5-205ENST00000417936 ZMYM3Q14202 1370 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP5-205ENST00000417936 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP5-205ENST00000417936 PLXNC1O60486 1568 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP5-205ENST00000417936 TIAM1Q13009 1591 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP5-205ENST00000417936 PTPRTO14522 1441 aa16.81■□□□□ 0.28
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SH3BP5-205ENST00000417936 GGT6Q6P531 493 aa16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP5-205ENST00000417936 NCOA2Q15596 1464 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-205ENST00000417936 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-205ENST00000417936 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-205ENST00000417936 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-205ENST00000417936 PTPRKQ15262 1439 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BP5-205ENST00000417936 PKD2Q13563 968 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP5-205ENST00000417936 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP5-205ENST00000417936 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 PLA2R1Q13018 1463 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 TSPY4P0CV99 314 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 TSPY10P0CW01 314 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 KIF3BO15066 747 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP5-205ENST00000417936 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.65■□□□□ 0.26
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