RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417936.5

SH3BP5-205, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-205ENST00000417936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.27■■□□□ 1.8
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SH3BP5-205ENST00000417936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5-205ENST00000417936 NACADO15069 1562 aa22.32■■□□□ 1.16
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SH3BP5-205ENST00000417936 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.05■■□□□ 1.12
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SH3BP5-205ENST00000417936 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.25■□□□□ 0.99
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SH3BP5-205ENST00000417936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP5-205ENST00000417936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP5-205ENST00000417936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP5-205ENST00000417936 ARHGEF11O15085 1522 aa19.08■□□□□ 0.64
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SH3BP5-205ENST00000417936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP5-205ENST00000417936 WDR97A6NE52 1622 aa19.04■□□□□ 0.64
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SH3BP5-205ENST00000417936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.03■□□□□ 0.64
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SH3BP5-205ENST00000417936 CUX1P39880 1505 aa18.99■□□□□ 0.63
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SH3BP5-205ENST00000417936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP5-205ENST00000417936 CEP170Q5SW79 1584 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP5-205ENST00000417936 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP5-205ENST00000417936 SHROOM2Q13796 1616 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP5-205ENST00000417936 JPH4Q96JJ6 628 aa18.44■□□□□ 0.54
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SH3BP5-205ENST00000417936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.37■□□□□ 0.53
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