RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413497.5

ANKRD54-205, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 794 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-205ENST00000413497 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
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ANKRD54-205ENST00000413497 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.12■■■■□ 3.05
ANKRD54-205ENST00000413497 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.1■■■■□ 3.05
ANKRD54-205ENST00000413497 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
ANKRD54-205ENST00000413497 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.06■■■■□ 3.04
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ANKRD54-205ENST00000413497 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.02■■■■□ 3.04
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ANKRD54-205ENST00000413497 PREX2Q70Z35 1606 aa33.9■■■■□ 3.02
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ANKRD54-205ENST00000413497 AFAP1Q8N556 730 aa33.84■■■■□ 3.01
ANKRD54-205ENST00000413497 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.82■■■■□ 3.01
ANKRD54-205ENST00000413497 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.8■■■■□ 3
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ANKRD54-205ENST00000413497 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.75■■■□□ 2.99
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ANKRD54-205ENST00000413497 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.62■■■□□ 2.97
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ANKRD54-205ENST00000413497 PLXNC1O60486 1568 aa33.35■■■□□ 2.93
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ANKRD54-205ENST00000413497 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.16■■■□□ 2.9
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ANKRD54-205ENST00000413497 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.02■■■□□ 2.88
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ANKRD54-205ENST00000413497 PLA2R1Q13018 1463 aa32.99■■■□□ 2.87
ANKRD54-205ENST00000413497 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.98■■■□□ 2.87
ANKRD54-205ENST00000413497 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.97■■■□□ 2.87
ANKRD54-205ENST00000413497 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.97■■■□□ 2.87
ANKRD54-205ENST00000413497 KIF3BO15066 747 aa32.95■■■□□ 2.87
ANKRD54-205ENST00000413497 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.95■■■□□ 2.87
ANKRD54-205ENST00000413497 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.93■■■□□ 2.86
ANKRD54-205ENST00000413497 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.93■■■□□ 2.86
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