RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413497.5

ANKRD54-205, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 794 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ANKRD54-205ENST00000413497 SMARCA2P51531 1590 aa40.57■■■■■ 4.09
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ANKRD54-205ENST00000413497 IFT140Q96RY7 1462 aa38.35■■■■□ 3.73
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ANKRD54-205ENST00000413497 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38■■■■□ 3.67
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ANKRD54-205ENST00000413497 ARHGEF11O15085 1522 aa37.83■■■■□ 3.65
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ANKRD54-205ENST00000413497 CUX1P39880 1505 aa37.7■■■■□ 3.63
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ANKRD54-205ENST00000413497 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.81■■■■□ 3.48
ANKRD54-205ENST00000413497 SHROOM2Q13796 1616 aa36.76■■■■□ 3.48
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ANKRD54-205ENST00000413497 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
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ANKRD54-205ENST00000413497 CUL7Q14999 1698 aa36.36■■■■□ 3.41
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