RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412596.5

UBAP2L-205, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 5

Gene UBAP2L, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-205ENST00000412596 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.38
UBAP2L-205ENST00000412596 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.38■■■■■ 4.38
UBAP2L-205ENST00000412596 KIF14Q15058 1648 aa42.35■■■■■ 4.37
UBAP2L-205ENST00000412596 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
UBAP2L-205ENST00000412596 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.32■■■■■ 4.37
UBAP2L-205ENST00000412596 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.32■■■■■ 4.37
UBAP2L-205ENST00000412596 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
UBAP2L-205ENST00000412596 CLIP1P30622 1438 aa42.29■■■■■ 4.36
UBAP2L-205ENST00000412596 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.27■■■■■ 4.36
UBAP2L-205ENST00000412596 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.25■■■■■ 4.35
UBAP2L-205ENST00000412596 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.22■■■■■ 4.35
UBAP2L-205ENST00000412596 ATP10AO60312 1499 aa42.17■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 MLECQ14165 292 aa42.17■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.16■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.16■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.15■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.14■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.14■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.14■■■■■ 4.34
UBAP2L-205ENST00000412596 KDM5CP41229 1560 aa42.1■■■■■ 4.33
UBAP2L-205ENST00000412596 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.06■■■■■ 4.32
UBAP2L-205ENST00000412596 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.06■■■■■ 4.32
UBAP2L-205ENST00000412596 AFAP1Q8N556 730 aa42.04■■■■■ 4.32
UBAP2L-205ENST00000412596 PREX2Q70Z35 1606 aa42.03■■■■■ 4.32
UBAP2L-205ENST00000412596 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.99■■■■■ 4.31
UBAP2L-205ENST00000412596 HSPA2P54652 639 aa41.99■■■■■ 4.31
UBAP2L-205ENST00000412596 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.97■■■■■ 4.31
UBAP2L-205ENST00000412596 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.96■■■■■ 4.31
UBAP2L-205ENST00000412596 ABCC1P33527 1531 aa41.95■■■■■ 4.31
UBAP2L-205ENST00000412596 FBXO41Q8TF61 875 aa41.95■■■■■ 4.31
UBAP2L-205ENST00000412596 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.91■■■■■ 4.3
UBAP2L-205ENST00000412596 REREQ9P2R6 1566 aa41.89■■■■■ 4.3
UBAP2L-205ENST00000412596 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.89■■■■■ 4.3
UBAP2L-205ENST00000412596 ABCA6Q8N139 1617 aa41.89■■■■■ 4.3
UBAP2L-205ENST00000412596 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.89■■■■■ 4.3
UBAP2L-205ENST00000412596 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.87■■■■■ 4.29
UBAP2L-205ENST00000412596 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
UBAP2L-205ENST00000412596 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.8■■■■■ 4.28
UBAP2L-205ENST00000412596 AGLP35573 1532 aa41.75■■■■■ 4.27
UBAP2L-205ENST00000412596 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.73■■■■■ 4.27
UBAP2L-205ENST00000412596 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.71■■■■■ 4.27
UBAP2L-205ENST00000412596 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
UBAP2L-205ENST00000412596 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
UBAP2L-205ENST00000412596 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.67■■■■■ 4.26
UBAP2L-205ENST00000412596 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.65■■■■■ 4.26
UBAP2L-205ENST00000412596 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
UBAP2L-205ENST00000412596 C3P01024 1663 aa41.61■■■■■ 4.25
UBAP2L-205ENST00000412596 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
UBAP2L-205ENST00000412596 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.58■■■■■ 4.25
UBAP2L-205ENST00000412596 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.58■■■■■ 4.25
UBAP2L-205ENST00000412596 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
UBAP2L-205ENST00000412596 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.56■■■■■ 4.24
UBAP2L-205ENST00000412596 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.56■■■■■ 4.243e-7■■■□□ 15
UBAP2L-205ENST00000412596 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
UBAP2L-205ENST00000412596 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.54■■■■■ 4.24
UBAP2L-205ENST00000412596 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.54■■■■■ 4.24
UBAP2L-205ENST00000412596 ATP7AQ04656 1500 aa41.51■■■■■ 4.24
UBAP2L-205ENST00000412596 CERKQ8TCT0 537 aa41.5■■■■■ 4.23
UBAP2L-205ENST00000412596 STRCQ7RTU9 1775 aa41.49■■■■■ 4.23
UBAP2L-205ENST00000412596 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
UBAP2L-205ENST00000412596 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.46■■■■■ 4.23
UBAP2L-205ENST00000412596 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.45■■■■■ 4.23
UBAP2L-205ENST00000412596 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
UBAP2L-205ENST00000412596 TIAM1Q13009 1591 aa41.42■■■■■ 4.22
UBAP2L-205ENST00000412596 CEP162Q5TB80 1403 aa41.42■■■■■ 4.22
UBAP2L-205ENST00000412596 MROH2AA6NES4 1674 aa41.4■■■■■ 4.22
UBAP2L-205ENST00000412596 PLXNC1O60486 1568 aa41.4■■■■■ 4.22
UBAP2L-205ENST00000412596 A2MP01023 1474 aa41.39■■■■■ 4.22
UBAP2L-205ENST00000412596 NPATQ14207 1427 aa41.34■■■■■ 4.21
UBAP2L-205ENST00000412596 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
UBAP2L-205ENST00000412596 ZMYM3Q14202 1370 aa41.31■■■■■ 4.2
UBAP2L-205ENST00000412596 PTPRTO14522 1441 aa41.29■■■■■ 4.2
UBAP2L-205ENST00000412596 MBD5Q9P267 1494 aa41.28■■■■■ 4.2
UBAP2L-205ENST00000412596 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
UBAP2L-205ENST00000412596 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.27■■■■■ 4.2
UBAP2L-205ENST00000412596 NCOA1Q15788 1441 aa41.24■■■■■ 4.19
UBAP2L-205ENST00000412596 GGT6Q6P531 493 aa41.22■■■■■ 4.19
UBAP2L-205ENST00000412596 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.18■■■■■ 4.18
UBAP2L-205ENST00000412596 NCOA2Q15596 1464 aa41.17■■■■■ 4.18
UBAP2L-205ENST00000412596 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.17■■■■■ 4.18
UBAP2L-205ENST00000412596 PTPRKQ15262 1439 aa41.13■■■■■ 4.17
UBAP2L-205ENST00000412596 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.13■■■■■ 4.17
UBAP2L-205ENST00000412596 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.12■■■■■ 4.17
UBAP2L-205ENST00000412596 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.12■■■■■ 4.17
UBAP2L-205ENST00000412596 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.11■■■■■ 4.17
UBAP2L-205ENST00000412596 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
UBAP2L-205ENST00000412596 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
UBAP2L-205ENST00000412596 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.05■■■■■ 4.16
UBAP2L-205ENST00000412596 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
UBAP2L-205ENST00000412596 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.01■■■■■ 4.15
UBAP2L-205ENST00000412596 RSPH4AQ5TD94 716 aa41■■■■■ 4.15
UBAP2L-205ENST00000412596 PLA2R1Q13018 1463 aa41■■■■■ 4.15
UBAP2L-205ENST00000412596 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.99■■■■■ 4.15
UBAP2L-205ENST00000412596 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.95■■■■■ 4.15
UBAP2L-205ENST00000412596 KIF3BO15066 747 aa40.95■■■■■ 4.15
UBAP2L-205ENST00000412596 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.95■■■■■ 4.15
UBAP2L-205ENST00000412596 PKD2Q13563 968 aa40.93■■■■■ 4.14
UBAP2L-205ENST00000412596 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.92■■■■■ 4.14
UBAP2L-205ENST00000412596 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.92■■■■■ 4.14
UBAP2L-205ENST00000412596 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.92■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.2 ms