RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404424.5

CLIP4-204, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLIP4, Length 2,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4-204ENST00000404424 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLIP4-204ENST00000404424 ABCC5O15440 1437 aa14.92□□□□□ -0.02
CLIP4-204ENST00000404424 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.92□□□□□ -0.02
CLIP4-204ENST00000404424 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLIP4-204ENST00000404424 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.91□□□□□ -0.02
CLIP4-204ENST00000404424 NCOA1Q15788 1441 aa14.9□□□□□ -0.02
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 GRIN2AQ12879 1464 aa14.88□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.87□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 ARID3CA6NKF2 412 aa14.87□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 CCDC7Q96M83 1385 aa14.87□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 FOXD1Q16676 465 aa14.85□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.84□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.83□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.83□□□□□ -0.03
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.83□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.82□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.82□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 ADGRL2O95490 1459 aa14.81□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.81□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.81□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 PZPP20742 1482 aa14.8□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.77□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.77□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 SYNJ2O15056 1496 aa14.77□□□□□ -0.04
CLIP4-204ENST00000404424 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.77□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.76□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.76□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 MBD5Q9P267 1494 aa14.76□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.75□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 CEP170Q5SW79 1584 aa14.75□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 CCDC184Q52MB2 194 aa14.75□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 MRS2Q9HD23 443 aa14.75□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.75□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 KIF14Q15058 1648 aa14.72□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.72□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 NUP160Q12769 1436 aa14.72□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.71□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.71□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.71□□□□□ -0.05
CLIP4-204ENST00000404424 JPH4Q96JJ6 628 aa14.7□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 PKD2Q13563 968 aa14.7□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.69□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 USP47Q96K76 1375 aa14.69□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.69□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 ERCC6Q03468 1493 aa14.68□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 ABCA8O94911 1581 aa14.67□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.67□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.67□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 KDM5CP41229 1560 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.66□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.65□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.65□□□□□ -0.06
CLIP4-204ENST00000404424 NUP155O75694 1391 aa14.64□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.64□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.64□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 ATP10BO94823 1461 aa14.64□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 TSPY4P0CV99 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 TSPY10P0CW01 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 FBLN2P98095 1184 aa14.64□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.61□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 PTPRGP23470 1445 aa14.61□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.58□□□□□ -0.07
CLIP4-204ENST00000404424 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 KIF15Q9NS87 1388 aa14.58□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 NUDCQ9Y266 331 aa14.57□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.56□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.55□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.54□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 MSH5O43196 834 aa14.53□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 RALBP1Q15311 655 aa14.53□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 TMC1Q8TDI8 760 aa14.53□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.52□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
CLIP4-204ENST00000404424 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.52□□□□□ -0.09
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