RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394725.2

SIAH1-203, Transcript of siah E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIAH1, Length 2,147 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH1-203ENST00000394725 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.6■■■■■ 4.09
SIAH1-203ENST00000394725 TRIM52Q96A61 297 aa40.6■■■■■ 4.09
SIAH1-203ENST00000394725 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.59■■■■■ 4.09
SIAH1-203ENST00000394725 ROCK1Q13464 1354 aa40.58■■■■■ 4.09
SIAH1-203ENST00000394725 SHROOM2Q13796 1616 aa40.57■■■■■ 4.08
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
SIAH1-203ENST00000394725 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
SIAH1-203ENST00000394725 TONSLQ96HA7 1378 aa40.5■■■■■ 4.07
SIAH1-203ENST00000394725 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
SIAH1-203ENST00000394725 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.48■■■■■ 4.07
SIAH1-203ENST00000394725 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.47■■■■■ 4.07
SIAH1-203ENST00000394725 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.43■■■■■ 4.06
SIAH1-203ENST00000394725 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.42■■■■■ 4.06
SIAH1-203ENST00000394725 NCOA1Q15788 1441 aa40.33■■■■■ 4.05
SIAH1-203ENST00000394725 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
SIAH1-203ENST00000394725 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.31■■■■■ 4.04
SIAH1-203ENST00000394725 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
SIAH1-203ENST00000394725 FOXD1Q16676 465 aa40.3■■■■■ 4.04
SIAH1-203ENST00000394725 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.3■■■■■ 4.04
SIAH1-203ENST00000394725 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.29■■■■■ 4.04
SIAH1-203ENST00000394725 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
SIAH1-203ENST00000394725 ADGRL2O95490 1459 aa40.26■■■■■ 4.04
SIAH1-203ENST00000394725 ABCC2Q92887 1545 aa40.24■■■■■ 4.03
SIAH1-203ENST00000394725 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SIAH1-203ENST00000394725 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.23■■■■■ 4.03
SIAH1-203ENST00000394725 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.21■■■■■ 4.03
SIAH1-203ENST00000394725 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
SIAH1-203ENST00000394725 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
SIAH1-203ENST00000394725 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.022e-7■■■■■ 27
SIAH1-203ENST00000394725 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.13■■■■■ 4.02
SIAH1-203ENST00000394725 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.12■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.12■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.11■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 PREX2Q70Z35 1606 aa40.1■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 TSPY4P0CV99 314 aa40.09■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 TSPY10P0CW01 314 aa40.09■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 PZPP20742 1482 aa40.09■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.07■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.07■■■■■ 4.01
SIAH1-203ENST00000394725 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.07■■■■■ 4
SIAH1-203ENST00000394725 MBD5Q9P267 1494 aa40.07■■■■■ 4
SIAH1-203ENST00000394725 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 42e-6■■□□□ 12.3
SIAH1-203ENST00000394725 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
SIAH1-203ENST00000394725 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.04■■■■■ 4
SIAH1-203ENST00000394725 KCNH8Q96L42 1107 aa40.03■■■■■ 4
SIAH1-203ENST00000394725 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.01■■■■■ 4
SIAH1-203ENST00000394725 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
SIAH1-203ENST00000394725 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.98■■■■□ 3.99
SIAH1-203ENST00000394725 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
SIAH1-203ENST00000394725 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.98■■■■□ 3.99
SIAH1-203ENST00000394725 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.96■■■■□ 3.99
SIAH1-203ENST00000394725 KIF15Q9NS87 1388 aa39.94■■■■□ 3.98
SIAH1-203ENST00000394725 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.9■■■■□ 3.98
SIAH1-203ENST00000394725 PKD2Q13563 968 aa39.89■■■■□ 3.98
SIAH1-203ENST00000394725 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.89■■■■□ 3.98
SIAH1-203ENST00000394725 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.88■■■■□ 3.97
SIAH1-203ENST00000394725 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.87■■■■□ 3.97
SIAH1-203ENST00000394725 NUP155O75694 1391 aa39.86■■■■□ 3.97
SIAH1-203ENST00000394725 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.85■■■■□ 3.97
SIAH1-203ENST00000394725 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.77■■■■□ 3.96
SIAH1-203ENST00000394725 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
SIAH1-203ENST00000394725 PLCH2O75038 1416 aa39.76■■■■□ 3.96
SIAH1-203ENST00000394725 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.76■■■■□ 3.95
SIAH1-203ENST00000394725 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.73■■■■□ 3.95
SIAH1-203ENST00000394725 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.73■■■■□ 3.95
SIAH1-203ENST00000394725 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.71■■■■□ 3.95
SIAH1-203ENST00000394725 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.71■■■■□ 3.95
SIAH1-203ENST00000394725 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.69■■■■□ 3.94
SIAH1-203ENST00000394725 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.68■■■■□ 3.94
SIAH1-203ENST00000394725 OSCARQ8IYS5 282 aa39.59■■■■□ 3.93
SIAH1-203ENST00000394725 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.57■■■■□ 3.93
SIAH1-203ENST00000394725 PLXNC1O60486 1568 aa39.57■■■■□ 3.92
SIAH1-203ENST00000394725 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.56■■■■□ 3.92
SIAH1-203ENST00000394725 WASHC2AQ641Q2 1341 aa39.56■■■■□ 3.92
SIAH1-203ENST00000394725 ABCC1P33527 1531 aa39.56■■■■□ 3.92
SIAH1-203ENST00000394725 ANP32CO43423 234 aa39.55■■■■□ 3.92
SIAH1-203ENST00000394725 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.53■■■■□ 3.92
SIAH1-203ENST00000394725 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.5■■■■□ 3.91
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
SIAH1-203ENST00000394725 UNC13BO14795 1591 aa39.47■■■■□ 3.91
SIAH1-203ENST00000394725 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.46■■■■□ 3.91
SIAH1-203ENST00000394725 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.45■■■■□ 3.91
SIAH1-203ENST00000394725 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
SIAH1-203ENST00000394725 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.42■■■■□ 3.9
SIAH1-203ENST00000394725 AFAP1Q8N556 730 aa39.41■■■■□ 3.9
SIAH1-203ENST00000394725 ASXL2Q76L83 1435 aa39.4■■■■□ 3.9
SIAH1-203ENST00000394725 CCER2I3L3R5 266 aa39.38■■■■□ 3.9
SIAH1-203ENST00000394725 ERBINQ96RT1 1412 aa39.38■■■■□ 3.9
SIAH1-203ENST00000394725 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
SIAH1-203ENST00000394725 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.36■■■■□ 3.89
SIAH1-203ENST00000394725 FANCAO15360 1455 aa39.34■■■■□ 3.89
SIAH1-203ENST00000394725 CCDC7Q96M83 1385 aa39.34■■■■□ 3.89
SIAH1-203ENST00000394725 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.32■■■■□ 3.89
SIAH1-203ENST00000394725 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.32■■■■□ 3.88
SIAH1-203ENST00000394725 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.31■■■■□ 3.88
SIAH1-203ENST00000394725 PLA2R1Q13018 1463 aa39.28■■■■□ 3.88
SIAH1-203ENST00000394725 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.28■■■■□ 3.88
SIAH1-203ENST00000394725 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.28■■■■□ 3.88
SIAH1-203ENST00000394725 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.28■■■■□ 3.88
SIAH1-203ENST00000394725 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.28■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms