RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-641P-201ENST00000384006 KIF3CO14782 793 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 P3H3Q8IVL6 736 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 WDR70Q9NW82 654 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMC2Q8TDI7 906 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 FOXK1P85037 733 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 CAMK2BQ13554 666 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-641P-201ENST00000384006 C2orf72A6NCS6 295 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 E2F4Q16254 413 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 POTEB2H3BUK9 544 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 POTEJP0CG39 1038 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 DSG2Q14126 1118 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCANQ96GW7 911 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLPP6Q8IY26 295 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC34A2O95436 690 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-641P-201ENST00000384006 NBR1Q14596 966 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-641P-201ENST00000384006 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-641P-201ENST00000384006 OXER1Q8TDS5 423 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-641P-201ENST00000384006 LHX8Q68G74 356 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 PDIA6Q15084 440 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 OTUD5Q96G74 571 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 DOK7Q18PE1 504 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 DPYSL4O14531 572 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 SNPHO15079 494 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 TBC1D12O60347 775 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-641P-201ENST00000384006 RIMBP2O15034 1052 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP3K9P80192 1104 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTGER2P43116 358 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 SEMA3EO15041 775 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 EVI5O60447 810 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPR153Q6NV75 609 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 JPH4Q96JJ6 628 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 PHF14O94880 888 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 ARSIQ5FYB1 569 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 EPAS1Q99814 870 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUDT7P0C024 238 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 OSBPP22059 807 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 FOSBP53539 338 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 FBXW7Q969H0 707 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 DDX12PQ92771 950 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 ST18O60284 1047 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 LHX6Q9UPM6 363 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPR37O15354 613 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 MAP3K7O43318 606 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZMYND10O75800 440 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 EMP3P54852 163 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 CERKQ8TCT0 537 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 FCHSD2O94868 740 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTGDRQ13258 359 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-641P-201ENST00000384006 HIC1Q14526 733 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-641P-201ENST00000384006 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-641P-201ENST00000384006 ERBB3P21860 1342 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUTM2FA1L443 756 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-641P-201ENST00000384006 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms