RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.15■■■■■ 4.02
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MSX1-201ENST00000382723 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.1■■■■■ 4.01
MSX1-201ENST00000382723 PLCH2O75038 1416 aa40.1■■■■■ 4.01
MSX1-201ENST00000382723 DAPK1P53355 1430 aa40.1■■■■■ 4.01
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MSX1-201ENST00000382723 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40■■■■□ 3.99
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MSX1-201ENST00000382723 HRCP23327 699 aa39.94■■■■□ 3.98
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MSX1-201ENST00000382723 MBD5Q9P267 1494 aa39.91■■■■□ 3.98
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MSX1-201ENST00000382723 AKNAQ7Z591 1439 aa39.9■■■■□ 3.98
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MSX1-201ENST00000382723 CD109Q6YHK3 1445 aa39.87■■■■□ 3.97
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MSX1-201ENST00000382723 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.85■■■■□ 3.97
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MSX1-201ENST00000382723 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.79■■■■□ 3.96
MSX1-201ENST00000382723 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.75■■■■□ 3.95
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MSX1-201ENST00000382723 ADGRL2O95490 1459 aa39.74■■■■□ 3.95
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MSX1-201ENST00000382723 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
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MSX1-201ENST00000382723 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.69■■■■□ 3.94
MSX1-201ENST00000382723 DIP2BQ9P265 1576 aa39.69■■■■□ 3.94
MSX1-201ENST00000382723 ADGRL1O94910 1474 aa39.69■■■■□ 3.94
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MSX1-201ENST00000382723 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.66■■■■□ 3.94
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MSX1-201ENST00000382723 AFAP1Q8N556 730 aa39.62■■■■□ 3.93
MSX1-201ENST00000382723 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.61■■■■□ 3.93
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MSX1-201ENST00000382723 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.43■■■■□ 3.9
MSX1-201ENST00000382723 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.42■■■■□ 3.9
MSX1-201ENST00000382723 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.41■■■■□ 3.9
MSX1-201ENST00000382723 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.41■■■■□ 3.9
MSX1-201ENST00000382723 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.41■■■■□ 3.9
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MSX1-201ENST00000382723 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.14■■■■□ 3.86
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MSX1-201ENST00000382723 NEUROD1Q13562 356 aa39.12■■■■□ 3.85
MSX1-201ENST00000382723 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
MSX1-201ENST00000382723 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.1■■■■□ 3.85
MSX1-201ENST00000382723 UNC13BO14795 1591 aa39.09■■■■□ 3.85
MSX1-201ENST00000382723 A2MP01023 1474 aa39.06■■■■□ 3.84
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