RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382034.9

TOM1-201, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TOM1, Length 1,300 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-201ENST00000382034 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.28■■□□□ 1.64
TOM1-201ENST00000382034 PREX2Q70Z35 1606 aa25.28■■□□□ 1.64
TOM1-201ENST00000382034 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.27■■□□□ 1.64
TOM1-201ENST00000382034 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.26■■□□□ 1.63
TOM1-201ENST00000382034 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.25■■□□□ 1.63
TOM1-201ENST00000382034 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.25■■□□□ 1.63
TOM1-201ENST00000382034 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.24■■□□□ 1.63
TOM1-201ENST00000382034 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.23■■□□□ 1.63
TOM1-201ENST00000382034 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.21■■□□□ 1.63
TOM1-201ENST00000382034 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.21■■□□□ 1.63
TOM1-201ENST00000382034 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.19■■□□□ 1.62
TOM1-201ENST00000382034 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TOM1-201ENST00000382034 MAP3K1Q13233 1512 aa25.17■■□□□ 1.62
TOM1-201ENST00000382034 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.16■■□□□ 1.62
TOM1-201ENST00000382034 KDM5CP41229 1560 aa25.15■■□□□ 1.62
TOM1-201ENST00000382034 ABCC1P33527 1531 aa25.15■■□□□ 1.62
TOM1-201ENST00000382034 TIAM1Q13009 1591 aa25.15■■□□□ 1.62
TOM1-201ENST00000382034 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.14■■□□□ 1.61
TOM1-201ENST00000382034 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.1■■□□□ 1.61
TOM1-201ENST00000382034 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.1■■□□□ 1.61
TOM1-201ENST00000382034 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.09■■□□□ 1.61
TOM1-201ENST00000382034 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.09■■□□□ 1.61
TOM1-201ENST00000382034 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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TOM1-201ENST00000382034 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.07■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.07■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 ATP10AO60312 1499 aa25.06■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.06■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.06■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 AFAP1Q8N556 730 aa25.06■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.06■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.05■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 NCOA2Q15596 1464 aa25.03■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.03■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.02■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TOM1-201ENST00000382034 REREQ9P2R6 1566 aa25.01■■□□□ 1.59
TOM1-201ENST00000382034 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TOM1-201ENST00000382034 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.99■■□□□ 1.59
TOM1-201ENST00000382034 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.96■■□□□ 1.59
TOM1-201ENST00000382034 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.95■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.94■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 APLP2Q06481 763 aa24.94■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 ABCA6Q8N139 1617 aa24.92■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 PTPRMP28827 1452 aa24.92■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 AGLP35573 1532 aa24.92■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 MADDQ8WXG6 1647 aa24.92■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.91■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.91■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 MBD5Q9P267 1494 aa24.91■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TOM1-201ENST00000382034 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TOM1-201ENST00000382034 ATP7AQ04656 1500 aa24.88■■□□□ 1.57
TOM1-201ENST00000382034 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.86■■□□□ 1.57
TOM1-201ENST00000382034 MIA2Q96PC5 1412 aa24.86■■□□□ 1.57
TOM1-201ENST00000382034 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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TOM1-201ENST00000382034 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.84■■□□□ 1.57
TOM1-201ENST00000382034 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.83■■□□□ 1.57
TOM1-201ENST00000382034 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.83■■□□□ 1.56
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TOM1-201ENST00000382034 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.82■■□□□ 1.56
TOM1-201ENST00000382034 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.79■■□□□ 1.56
TOM1-201ENST00000382034 PLXNC1O60486 1568 aa24.78■■□□□ 1.56
TOM1-201ENST00000382034 MLECQ14165 292 aa24.77■■□□□ 1.56
TOM1-201ENST00000382034 A2MP01023 1474 aa24.76■■□□□ 1.55
TOM1-201ENST00000382034 TSPY4P0CV99 314 aa24.72■■□□□ 1.55
TOM1-201ENST00000382034 TSPY10P0CW01 314 aa24.72■■□□□ 1.55
TOM1-201ENST00000382034 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.71■■□□□ 1.55
TOM1-201ENST00000382034 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.69■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.69■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.66■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.65■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 MROH2AA6NES4 1674 aa24.64■■□□□ 1.54
TOM1-201ENST00000382034 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.61■■□□□ 1.53
TOM1-201ENST00000382034 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.61■■□□□ 1.53
TOM1-201ENST00000382034 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.61■■□□□ 1.53
TOM1-201ENST00000382034 C3P01024 1663 aa24.6■■□□□ 1.53
TOM1-201ENST00000382034 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.57■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.57■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 ABCC5O15440 1437 aa24.55■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 ZMYM3Q14202 1370 aa24.54■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 NPATQ14207 1427 aa24.54■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 GGT6Q6P531 493 aa24.54■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 DAPK1P53355 1430 aa24.53■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 KIF3BO15066 747 aa24.52■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TOM1-201ENST00000382034 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.51■■□□□ 1.51
TOM1-201ENST00000382034 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.5■■□□□ 1.51
TOM1-201ENST00000382034 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.49■■□□□ 1.51
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