RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381514.7

MRPL23-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MRPL23, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-201ENST00000381514 RAPGEF3O95398 923 aa27■■□□□ 1.91
MRPL23-201ENST00000381514 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
MRPL23-201ENST00000381514 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.99■■□□□ 1.91
MRPL23-201ENST00000381514 MADDQ8WXG6 1647 aa26.98■■□□□ 1.91
MRPL23-201ENST00000381514 KIF14Q15058 1648 aa26.96■■□□□ 1.91
MRPL23-201ENST00000381514 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.93■■□□□ 1.9
MRPL23-201ENST00000381514 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.93■■□□□ 1.9
MRPL23-201ENST00000381514 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.9■■□□□ 1.9
MRPL23-201ENST00000381514 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
MRPL23-201ENST00000381514 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.89■■□□□ 1.9
MRPL23-201ENST00000381514 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 FANCAO15360 1455 aa26.87■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 NCOA2Q15596 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.86■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 AKNAQ7Z591 1439 aa26.83■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.83■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
MRPL23-201ENST00000381514 CERKQ8TCT0 537 aa26.81■■□□□ 1.88
MRPL23-201ENST00000381514 RICTORQ6R327 1708 aa26.79■■□□□ 1.88
MRPL23-201ENST00000381514 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
MRPL23-201ENST00000381514 PLCH2O75038 1416 aa26.78■■□□□ 1.88
MRPL23-201ENST00000381514 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.78■■□□□ 1.88
MRPL23-201ENST00000381514 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.75■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 HSPA2P54652 639 aa26.75■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.75■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.74■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.74■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.73■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.71■■□□□ 1.87
MRPL23-201ENST00000381514 MIA2Q96PC5 1412 aa26.69■■□□□ 1.86
MRPL23-201ENST00000381514 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.69■■□□□ 1.86
MRPL23-201ENST00000381514 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.69■■□□□ 1.86
MRPL23-201ENST00000381514 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
MRPL23-201ENST00000381514 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.66■■□□□ 1.86
MRPL23-201ENST00000381514 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.66■■□□□ 1.86
MRPL23-201ENST00000381514 PREX2Q70Z35 1606 aa26.63■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.62■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.62■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.62■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.61■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.6■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.6■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.6■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 SOCS7O14512 581 aa26.59■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 MLECQ14165 292 aa26.58■■□□□ 1.85
MRPL23-201ENST00000381514 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.57■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 ATP10AO60312 1499 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 TSPY4P0CV99 314 aa26.54■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 TSPY10P0CW01 314 aa26.54■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.54■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.53■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.52■■□□□ 1.84
MRPL23-201ENST00000381514 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.51■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 ITGAEP38570 1179 aa26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.46■■□□□ 1.83
MRPL23-201ENST00000381514 AFAP1Q8N556 730 aa26.44■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 ILDR2Q71H61 639 aa26.43■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 ABCC1P33527 1531 aa26.43■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.42■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 PTPRTO14522 1441 aa26.41■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 STRCQ7RTU9 1775 aa26.41■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.39■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.39■■□□□ 1.82
MRPL23-201ENST00000381514 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.38■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.37■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 MBD5Q9P267 1494 aa26.36■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.36■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 DAPK1P53355 1430 aa26.35■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.35■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 REREQ9P2R6 1566 aa26.33■■□□□ 1.81
MRPL23-201ENST00000381514 KDM5CP41229 1560 aa26.32■■□□□ 1.8
MRPL23-201ENST00000381514 ABCC5O15440 1437 aa26.31■■□□□ 1.8
MRPL23-201ENST00000381514 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
MRPL23-201ENST00000381514 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.29■■□□□ 1.8
MRPL23-201ENST00000381514 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.28■■□□□ 1.8
MRPL23-201ENST00000381514 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.26■■□□□ 1.79
MRPL23-201ENST00000381514 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.25■■□□□ 1.79
MRPL23-201ENST00000381514 AGLP35573 1532 aa26.24■■□□□ 1.79
MRPL23-201ENST00000381514 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.24■■□□□ 1.79
MRPL23-201ENST00000381514 C3P01024 1663 aa26.24■■□□□ 1.79
MRPL23-201ENST00000381514 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.24■■□□□ 1.79
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