RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379772.3

C20orf27-202, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C20orf27, Length 1,886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-202ENST00000379772 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.33■■■■□ 3.25
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C20orf27-202ENST00000379772 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.32■■■■□ 3.24
C20orf27-202ENST00000379772 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
C20orf27-202ENST00000379772 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.3■■■■□ 3.24
C20orf27-202ENST00000379772 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
C20orf27-202ENST00000379772 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.29■■■■□ 3.24
C20orf27-202ENST00000379772 PREX2Q70Z35 1606 aa35.28■■■■□ 3.24
C20orf27-202ENST00000379772 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
C20orf27-202ENST00000379772 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
C20orf27-202ENST00000379772 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.24■■■■□ 3.23
C20orf27-202ENST00000379772 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.23■■■■□ 3.23
C20orf27-202ENST00000379772 ADGRL1O94910 1474 aa35.23■■■■□ 3.23
C20orf27-202ENST00000379772 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
C20orf27-202ENST00000379772 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.17■■■■□ 3.22
C20orf27-202ENST00000379772 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
C20orf27-202ENST00000379772 AFAP1Q8N556 730 aa35.12■■■■□ 3.21
C20orf27-202ENST00000379772 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
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C20orf27-202ENST00000379772 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.07■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.07■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.06■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.06■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 RICTORQ6R327 1708 aa35.04■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.03■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 ABCC1P33527 1531 aa35.02■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.02■■■■□ 3.2
C20orf27-202ENST00000379772 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.98■■■■□ 3.19
C20orf27-202ENST00000379772 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.98■■■■□ 3.19
C20orf27-202ENST00000379772 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.95■■■■□ 3.19
C20orf27-202ENST00000379772 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.95■■■■□ 3.19
C20orf27-202ENST00000379772 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.95■■■■□ 3.19
C20orf27-202ENST00000379772 MIA2Q96PC5 1412 aa34.95■■■■□ 3.19
C20orf27-202ENST00000379772 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.92■■■■□ 3.18
C20orf27-202ENST00000379772 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.91■■■■□ 3.18
C20orf27-202ENST00000379772 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.89■■■■□ 3.18
C20orf27-202ENST00000379772 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.88■■■■□ 3.17
C20orf27-202ENST00000379772 MBD5Q9P267 1494 aa34.87■■■■□ 3.17
C20orf27-202ENST00000379772 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.86■■■■□ 3.17
C20orf27-202ENST00000379772 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
C20orf27-202ENST00000379772 KDM5CP41229 1560 aa34.86■■■■□ 3.17
C20orf27-202ENST00000379772 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.84■■■■□ 3.17
C20orf27-202ENST00000379772 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
C20orf27-202ENST00000379772 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.8■■■■□ 3.16
C20orf27-202ENST00000379772 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.8■■■■□ 3.16
C20orf27-202ENST00000379772 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.78■■■■□ 3.16
C20orf27-202ENST00000379772 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
C20orf27-202ENST00000379772 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.77■■■■□ 3.16
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C20orf27-202ENST00000379772 TSPY10P0CW01 314 aa34.75■■■■□ 3.15
C20orf27-202ENST00000379772 ATP10AO60312 1499 aa34.74■■■■□ 3.15
C20orf27-202ENST00000379772 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.74■■■■□ 3.15
C20orf27-202ENST00000379772 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.73■■■■□ 3.15
C20orf27-202ENST00000379772 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.72■■■■□ 3.15
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C20orf27-202ENST00000379772 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.66■■■■□ 3.14
C20orf27-202ENST00000379772 ABCA6Q8N139 1617 aa34.66■■■■□ 3.14
C20orf27-202ENST00000379772 MLECQ14165 292 aa34.65■■■■□ 3.14
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C20orf27-202ENST00000379772 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
C20orf27-202ENST00000379772 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
C20orf27-202ENST00000379772 ABCC5O15440 1437 aa34.63■■■■□ 3.13
C20orf27-202ENST00000379772 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.61■■■■□ 3.13
C20orf27-202ENST00000379772 DAPK1P53355 1430 aa34.61■■■■□ 3.13
C20orf27-202ENST00000379772 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.61■■■■□ 3.13
C20orf27-202ENST00000379772 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.59■■■■□ 3.13
C20orf27-202ENST00000379772 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.58■■■■□ 3.13
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C20orf27-202ENST00000379772 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.51■■■■□ 3.11
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C20orf27-202ENST00000379772 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
C20orf27-202ENST00000379772 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.46■■■■□ 3.11
C20orf27-202ENST00000379772 GGT6Q6P531 493 aa34.42■■■■□ 3.1
C20orf27-202ENST00000379772 AGLP35573 1532 aa34.42■■■■□ 3.1
C20orf27-202ENST00000379772 PLXNC1O60486 1568 aa34.41■■■■□ 3.1
C20orf27-202ENST00000379772 KIF3BO15066 747 aa34.41■■■■□ 3.1
C20orf27-202ENST00000379772 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.4■■■■□ 3.1
C20orf27-202ENST00000379772 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.38■■■■□ 3.09
C20orf27-202ENST00000379772 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.37■■■■□ 3.09
C20orf27-202ENST00000379772 KIF15Q9NS87 1388 aa34.37■■■■□ 3.09
C20orf27-202ENST00000379772 NCOA1Q15788 1441 aa34.36■■■■□ 3.09
C20orf27-202ENST00000379772 MADDQ8WXG6 1647 aa34.35■■■■□ 3.09
C20orf27-202ENST00000379772 ADGRL2O95490 1459 aa34.35■■■■□ 3.09
C20orf27-202ENST00000379772 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
C20orf27-202ENST00000379772 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.29■■■■□ 3.08
C20orf27-202ENST00000379772 PTPRMP28827 1452 aa34.27■■■■□ 3.08
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C20orf27-202ENST00000379772 ROCK1Q13464 1354 aa34.26■■■■□ 3.07
C20orf27-202ENST00000379772 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
C20orf27-202ENST00000379772 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.24■■■■□ 3.07
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